| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 10mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Not applicable. This compound is a reagent for oligonucleotide synthesis, not a drug. It does not have a biological target itself; it is a building block for creating nucleic acid-based therapeutics (e.g., antisense oligonucleotides, siRNA). Its modifications are designed to improve the pharmacological properties of the resulting oligonucleotides.
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| 体外研究 (In Vitro) |
未见明显的体外直接活性报道。单体形式下,该化合物不具有生物活性。其活性仅在整合到全长寡核苷酸序列中后才能实现,其中cEt修饰可提高核酸酶抗性和与靶RNA的杂交亲和力。偶联反应中,亚磷酰胺的纯度通常≥98%。
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| 体内研究 (In Vivo) |
未见具体的体内数据报道。作为合成试剂,该化合物的价值在于用于生产寡核苷酸药物。一旦被引入寡核苷酸中,这些修饰可增强其体内稳定性(核酸酶抗性)和药代动力学性质,从而提高动物模型中的疗效。已知cEt修饰可提高反义寡核苷酸的效力。
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| 酶活实验 |
不适用。这是一种用于固相寡核苷酸合成的化学试剂。典型的偶联方案是将亚磷酰胺(50-100 mM)溶解于无水乙腈中。使用DNA合成仪,用5-苄硫基-1H-四唑(0.25 M)活化亚磷酰胺,并将其偶联到固定化的去三苯甲基化核苷的游离5'-OH上。偶联反应在2-5分钟内完成,偶联效率>98%。
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| 细胞实验 |
不适用。该化合物用于化学合成,而非细胞实验。然而,含有该亚磷酸酯的完全合成纯化的寡核苷酸可用于细胞培养测试。将细胞用寡核苷酸处理(例如,通过脂质体转染,浓度为10-200 nM),处理时间为24-96小时。通过qPCR或Western blot检测靶基因的敲低情况,并通过RNA测序评估脱靶效应。
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| 动物实验 |
目前尚无针对亚磷酰胺本身的具体体内动物实验方案。然而,对于由其衍生的反义寡核苷酸,典型的实验方案包括对啮齿动物进行静脉注射(iv)或皮下注射(sc),剂量为1-50 mg/kg,每日一次或每周两次。收集组织(肝脏、肾脏)以通过qPCR定量靶mRNA的减少,并通过LC-MS/MS测定寡核苷酸的浓度。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
不适用于亚磷酰胺。对于所得寡核苷酸,已知 cEt(受限乙基)修饰可赋予其对核酸内切酶和核酸外切酶的高抵抗力,从而导致较长的血浆半衰期(例如,在啮齿动物中为 2-8 小时)和较高的组织暴露量。其代谢主要通过核酸酶介导的链缩短,而非 Cyp450 酶。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
未报告毒性数据。作为化学试剂,它具有刺激性。对于所得寡核苷酸,cEt修饰通常可降低与未修饰的硫代磷酸酯寡核苷酸相关的促炎副作用(例如细胞因子释放),但高剂量时可能导致肝毒性。长期毒理学研究因化合物而异。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
这是构建下一代反义寡核苷酸(ASO)的关键结构单元。受限的乙基(cEt)双环结构将糖锁定在有利的构象中,显著提高了与互补RNA的结合亲和力(Tm),并提供了比第一代修饰更优异的核酸酶抗性。其IUPAC名称为N-[1-[(1S,3R,4R,6S,7S)-1-[[双(4-甲氧基苯基)-苯基甲氧基]甲基]-7-[2-氰基乙氧基-[二(丙-2-基)氨基]膦基]氧基-6-甲基-2,5-二氧杂双环[2.2.1]庚烷-3-基]-5-甲基-2-氧代嘧啶-4-基]苯甲酰胺;分子式:C49H56N5O9P;分子量:889.97。
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| 分子式 |
C49H56N5O9P
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|---|---|
| 分子量 |
889.97
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| 精确质量 |
889.382
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| CAS号 |
1197033-17-2
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| PubChem CID |
45139840
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
8.38
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| tPSA |
172.71
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
11
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| 可旋转键数目(RBC) |
19
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| 重原子数目 |
64
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| 分子复杂度/Complexity |
1640
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| 定义原子立体中心数目 |
5
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| SMILES |
C[C@H]1[C@]2([C@H]([C@@H](O1)[C@@H](O2)N3C=C(C(=NC3=O)NC(=O)C4=CC=CC=C4)C)OP(N(C(C)C)C(C)C)OCCC#N)COC(C5=CC=CC=C5)(C6=CC=C(C=C6)OC)C7=CC=C(C=C7)OC
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| InChi Key |
BDTXILPCBUAYPJ-USFFSJIASA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C49H56N5O9P/c1-32(2)54(33(3)4)64(60-29-15-28-50)63-43-42-46(53-30-34(5)44(52-47(53)56)51-45(55)36-16-11-9-12-17-36)62-48(43,35(6)61-42)31-59-49(37-18-13-10-14-19-37,38-20-24-40(57-7)25-21-38)39-22-26-41(58-8)27-23-39/h9-14,16-27,30,32-33,35,42-43,46H,15,29,31H2,1-8H3,(H,51,52,55,56)/t35-,42+,43-,46+,48-,64?/m0/s1
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| 化学名 |
N-[1-[(1S,3R,4R,6S,7S)-1-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-7-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxy-6-methyl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-3-yl]-5-methyl-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.1236 mL | 5.6182 mL | 11.2363 mL | |
| 5 mM | 0.2247 mL | 1.1236 mL | 2.2473 mL | |
| 10 mM | 0.1124 mL | 0.5618 mL | 1.1236 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。