5-Aza-7-deazaguanine

别名: 2-氨基-咪唑并[1,2-a]-1,3,5-噻嗪-4(1h)-酮(9ci); 5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤
目录号: V29681 纯度: ≥98%
5-Aza-7-deazaguanine 是野生型大肠杆菌嘌呤核苷磷酸化酶及其突变体 Ser90Ala 在碱基修饰核苷制备/合成中的底物。
5-Aza-7-deazaguanine CAS号: 67410-64-4
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤是野生型大肠杆菌嘌呤核苷磷酸化酶及其突变体Ser90Ala在碱基修饰核苷的制备/合成中的底物。
5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤(CAS号:67410-64-4)是一种合成嘌呤类似物,可作为野生型大肠杆菌嘌呤核苷磷酸化酶及其Ser90Ala突变体合成碱基修饰核苷的底物。该化合物的分子式为C5H5N5O,分子量为151.13。5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤用于制备和合成碱基修饰核苷,而碱基修饰核苷对于研究核酸的结构、功能和治疗应用至关重要。该化合物是嘌呤核苷磷酸化酶的底物,嘌呤核苷磷酸化酶是嘌呤补救途径中的一种酶。
生物活性&实验参考方法
靶点
5-Aza-7-deazaguanine targets purine nucleoside phosphorylase (PNP), an enzyme that catalyzes the reversible phosphorolysis of purine nucleosides. The compound serves as a substrate for wild-type E. coli PNP and its Ser90Ala mutant. By acting as a substrate for PNP, 5-Aza-7-deazaguanine is used in the enzymatic synthesis of base-modified nucleosides. These modified nucleosides are valuable tools for studying nucleic acid structure, function, and for developing nucleoside-based therapeutics.
体外研究 (In Vitro)
体外研究表明,5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤是野生型大肠杆菌嘌呤核苷磷酸化酶及其Ser90Ala突变体的底物。该化合物可用于酶促反应合成碱基修饰的核苷。作为底物,它可被PNP转化为修饰的核苷,这些修饰的核苷可掺入核酸或用作治疗剂。然而,已发表的文献中缺乏具体的体外活性数据,例如动力学参数(Km、Vmax)。
体内研究 (In Vivo)
由于5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤主要用作体外酶促合成修饰核苷的研究工具,因此对其体内研究有限。该化合物并非用于治疗,主要用于生物化学研究。然而,以5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤为底物合成的修饰核苷可能具有潜在的治疗应用价值,包括抗病毒和抗癌疗法。目前尚无5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤本身的具体体内数据。
酶活实验
5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤的体外酶活性测定通常包括测量其作为嘌呤核苷磷酸化酶底物的活性。在这些测定中,将该化合物与嘌呤核苷磷酸化酶(PNP)和磷酸供体一起孵育,并使用高效液相色谱(HPLC)、液相色谱-质谱联用(LC-MS)或紫外分光光度法监测修饰核苷产物的生成。动力学参数,例如Km和Vmax,可以从底物浓度与反应速率曲线中确定。这些测定方法是表征嘌呤类似物作为PNP底物性质的标准方法。
细胞实验
由于5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤主要用作酶底物而非直接用于细胞研究,因此针对该化合物的细胞分析方法较为有限。然而,可以通过用由5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤合成的修饰核苷处理细胞来研究该化合物对细胞的影响。这些修饰核苷可能掺入细胞核酸中,并影响细胞活力、增殖或基因表达。但是,目前尚未广泛发表针对5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤本身的具体细胞实验方案。
动物实验
关于5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤的体内动物研究文献尚不充分。作为一种主要用于酶促合成的研究化合物,该化合物尚未在动物模型中进行研究。然而,以5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤为底物合成的修饰核苷可用于动物模型中评估其治疗潜力。有兴趣研究这些修饰核苷体内效应的研究人员需要开发合适的动物模型和实验方案。
药代性质 (ADME/PK)
5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤的分子量为151.13,分子式为C5H5N5O。该化合物在水中的溶解度为5 mg/mL,需经超声处理并用氢氧化钠调节pH至9。用于研究的5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤通常以粉末形式储存在-20℃下长达3年,或在4℃下长达2年。该化合物是一种合成嘌呤类似物,应小心处理。其详细的药代动力学参数,例如口服生物利用度、半衰期和组织分布等,尚未确定。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤的毒理学数据有限。作为一种主要用于酶促合成的研究化合物,5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤尚未在临床前研究中进行系统的毒性评估。处理该化合物时应遵循标准安全预防措施,包括使用适当的个人防护装备。该化合物仅供研究使用,不得用于人体治疗。研究人员应查阅安全数据表 (SDS) 以获取具体的安全信息。
参考文献

[1]. Recognition of Artificial Nucleobases by E. coli Purine Nucleoside Phosphorylase versus its Ser90Ala Mutant in the Synthesis of Base-Modified Nucleosides. Chemistry. 2015 Sep 14;21(38):13401-19.

其他信息
5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤(CAS号:67410-64-4)是一种合成嘌呤类似物,可作为大肠杆菌嘌呤核苷磷酸化酶的底物,用于合成碱基修饰的核苷。其分子式为C5H5N5O,分子量为151.13。该化合物用于生化研究中修饰核苷的酶促合成。5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤尚未获准用于临床,仅供核酸化学和药物研发领域的研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C5H5N5O
分子量
151.1261
精确质量
151.049
CAS号
67410-64-4
PubChem CID
135600909
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
-1
tPSA
89.07
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
0
重原子数目
11
分子复杂度/Complexity
225
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
KSTJOICDZAFYTD-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C5H5N5O/c6-3-8-4-7-1-2-10(4)5(11)9-3/h1-2H,(H3,6,7,8,9,11)
化学名
2-amino-3H-imidazo[1,2-a][1,3,5]triazin-4-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O : ~5 mg/mL (~33.08 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 6.6168 mL 33.0841 mL 66.1682 mL
5 mM 1.3234 mL 6.6168 mL 13.2336 mL
10 mM 0.6617 mL 3.3084 mL 6.6168 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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