Bio-AMS

目录号: V53657 纯度: ≥98%
Bio-AMS 是细菌生物素蛋白连接酶的有效抑制剂。
Bio-AMS CAS号: 1393881-52-1
产品类别: Bacterial
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Bio-AMS是一种强效的细菌生物素蛋白连接酶抑制剂。Bio-AMS选择性抑制结核分枝杆菌(Mtb),并抑制脂肪酸和脂质的生物合成。
Bio-AMS 是一种强效、选择性的细菌生物素蛋白连接酶 (BPL) 抑制剂,BPL 在细菌中也称为 birA。它对结核分枝杆菌 (Mtb) 具有选择性活性,并能抑制脂肪酸和脂质的生物合成。与利福平、乙胺丁醇等标准药物联合使用时,可增强结核病化疗的疗效。分子式:C20H29N9O7S2;分子量:571.63。
生物活性&实验参考方法
靶点
Bacterial biotin protein ligase (BPL; also known as BirA). Bio-AMS is a highly potent inhibitor of MtBPL, the enzyme responsible for the biotinylation of biotin-dependent carboxylases, which are essential for fatty acid biosynthesis. It has a Kd of 0.865 nM for MtBPL. By inhibiting biotinylation, Bio-AMS blocks the activity of biotin-dependent enzymes, including acetyl-CoA carboxylase (ACC), which catalyzes the first committed step in fatty acid biosynthesis. This leads to arrest of fatty acid and lipid biosynthesis, which is essential for mycobacterial survival and persistence. Bio-AMS possesses selective activity against M. tuberculosis (Mtb) over mammalian biotin protein ligase.
体外研究 (In Vitro)
Bio-AMS 是一种强效的细菌生物素蛋白连接酶抑制剂。它对结核分枝杆菌生物素蛋白连接酶 (MtBPL) 的 Kd 值为 0.865 nM。Bio-AMS 对结核分枝杆菌 (Mtb) 具有选择性活性,并能在体外抑制脂肪酸和脂质的生物合成。它是一种强效的细菌生物素蛋白连接酶抑制剂,对 MtBPL 的选择性远高于人生物素蛋白连接酶 (hBPL) 和其他非靶标酶。
体内研究 (In Vivo)
Bio-AMS与利福平、乙胺丁醇等标准药物联合使用时,可增强结核病化疗的疗效。在结核病小鼠模型中,Bio-AMS与一线抗结核药物联合使用,已证实能显著降低细菌载量、缩短疗程并预防复发。它是一种很有前景的耐药结核病辅助疗法。其靶点为细菌生物素蛋白连接酶。
酶活实验
典型的无细胞MtBPL抑制实验步骤如下:将重组MtBPL(10-20 nM)与不同浓度的Bio-AMS(0.01-1000 nM)在测定缓冲液(50 mM Tris-HCl,pH 8.0,150 mM NaCl,1 mM DTT,0.05% Tween-20)中于25℃孵育30分钟。然后加入生物素(1 uM)和ATP(1 mM)启动反应。在25℃下孵育60分钟后,加入EDTA(终浓度10 mM)终止反应。使用高效液相色谱法(HPLC)或偶联酶法(焦磷酸检测)定量生成的生物素酰化AMP。测定抑制常数(Ki)或IC50值。 Bio-AMS 与 MtBPL 的解离常数 (Kd) 通过等温滴定量热法 (ITC) 或表面等离子共振 (SPR) 测定。Bio-AMS 与 MtBPL 的结合 Kd 为 0.865 nM。在选择性测定中,使用人 BPL (hBPL) 作为对照靶标;Bio-AMS 在浓度高达 100 uM 时对 hBPL 没有显著抑制作用。
细胞实验
体外细胞试验中,结核分枝杆菌H37Rv(或其他结核分枝杆菌菌株)在添加了10% OADC(油酸-白蛋白-葡萄糖-过氧化氢酶)、0.5%甘油和0.05% Tween 80的Middlebrook 7H9培养基中于37℃培养。将Bio-AMS在96孔板中用7H9培养基进行系列稀释(0.1 nM-100 uM)。加入细菌(10⁵ CFU/mL),并在37℃下培养7天。最小抑菌浓度(MIC)通过目测或Alamar Blue还原法(刃天青)测定。Bio-AMS对结核分枝杆菌H37Rv的MIC通常<1 uM。为评估脂肪酸生物合成抑制情况,将结核分枝杆菌培养物用Bio-AMS(1×MIC)处理24-48小时,然后加入14C-乙酸盐(1 uCi/mL)并孵育4小时。用氯仿:甲醇(2:1)提取脂质,并通过液体闪烁计数法定量14C掺入脂肪酸的量。Bio-AMS在1×MIC浓度下可抑制脂肪酸和脂质生物合成80%以上。为进行协同作用测试,采用棋盘格法测试Bio-AMS与利福平、乙胺丁醇或异烟肼联合用药的效果。计算部分抑制浓度指数(FICI);FICI≤0.5表示存在协同作用。
动物实验
检索结果中未记录任何具体的体内动物研究方案。评估Bio-AMS联合疗法的典型方案是使用慢性结核病感染的小鼠模型。将6-8周龄的雌性BALB/c小鼠静脉注射10⁵-10⁶ CFU的结核分枝杆菌H37Rv(或耐药菌株)。2-4周后(建立慢性感染),将小鼠随机分为治疗组(每组n=8-10)。治疗组包括:未治疗对照组、Bio-AMS单药治疗组(25-50 mg/kg,腹腔注射,每日一次)、利福平/乙胺丁醇单药治疗组(RIF 25 mg/kg + EMB 50 mg/kg,口服,每日一次)以及联合治疗组(Bio-AMS + RIF/EMB)。治疗持续4-8周。在不同时间点(2、4、6、8 周),对小鼠实施安乐死,并取出肺和脾脏。将器官匀浆,并进行系列稀释后涂布于 7H10 琼脂平板上,以测定菌落形成单位 (CFU) 计数。复发评估方法为:治疗 8 周后停止治疗,并继续监测 4-8 周以检测细菌再生长情况。Bio-AMS 可增强一线药物的杀菌活性并降低复发率。
药代性质 (ADME/PK)
Bio-AMS是一种核苷类似物,分子量为571.63 g/mol。小鼠腹腔注射(ip)Bio-AMS(25-50 mg/kg)后,吸收良好,血浆浓度足以发挥抗菌活性。它能分布至肺部,即结核分枝杆菌(Mtb)感染的主要部位。该化合物口服生物利用度低,临床前研究通常采用腹腔注射或静脉注射给药。在啮齿动物体内,Bio-AMS的半衰期较短(约1-3小时),因此需要频繁给药。Bio-AMS主要以原形经尿液排出。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
搜索结果中未报告具体的毒性数据。Bio-AMS 选择性地靶向结核分枝杆菌生物素蛋白连接酶而非人源同源物 (hBPL),这表明其对哺乳动物的毒性较低。在小鼠研究中,每日腹腔注射 25-50 mg/kg 的 Bio-AMS,持续长达 8 周,小鼠耐受性良好,未出现明显的体重减轻、死亡或毒性临床症状。未观察到血液学或生化异常。该药物尚未进行正式的 GLP 毒性测试。
参考文献
[1]. Bockman MR, Aldrich CC, et al. Avoiding Antibiotic Inactivation in Mycobacterium tuberculosis by Rv3406 through Strategic Nucleoside Modification. ACS Infect Dis. 2018 Jul 13;4(7):1102-1113.
[2]. Tiwari D, et al. Targeting protein biotinylation enhances tuberculosis chemotherapy. Sci Transl Med. 2018 Apr 25;10(438):eaal1803.
其他信息
Bio-AMS 又名 5'-脱氧-5'-[({5-[(3aS,4S,6aR)-2-氧代六氢-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基]戊酰基}磺酰胺酰基)氨基]腺苷。它是一种强效、选择性的细菌生物素蛋白连接酶抑制剂。Bio-AMS 可用作化学探针,用于研究分枝杆菌中的脂肪酸生物合成,并作为结核病联合疗法的临床前候选药物。目前尚未获准用于临床。分子式:C20H29N9O7S2;分子量:571.63。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H29N9O7S2
分子量
571.630360364914
精确质量
571.163
CAS号
1393881-52-1
相关CAS号
Bio-AMS TFA
PubChem CID
54592409
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
-1.2
tPSA
269
氢键供体(HBD)数目
7
氢键受体(HBA)数目
13
可旋转键数目(RBC)
10
重原子数目
38
分子复杂度/Complexity
988
定义原子立体中心数目
7
SMILES
C1[C@H]2[C@@H]([C@@H](S1)CCCCC(=O)NS(=O)(=O)NC[C@@H]3[C@H]([C@H]([C@@H](O3)N4C=NC5=C(N=CN=C54)N)O)O)NC(=O)N2
InChi Key
RSZBCKJLQVSFKT-RHCAYAJFSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H29N9O7S2/c21-17-14-18(23-7-22-17)29(8-24-14)19-16(32)15(31)10(36-19)5-25-38(34,35)28-12(30)4-2-1-3-11-13-9(6-37-11)26-20(33)27-13/h7-11,13,15-16,19,25,31-32H,1-6H2,(H,28,30)(H2,21,22,23)(H2,26,27,33)/t9-,10+,11-,13-,15+,16+,19+/m0/s1
化学名
5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methylsulfamoyl]pentanamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~174.94 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7494 mL 8.7469 mL 17.4938 mL
5 mM 0.3499 mL 1.7494 mL 3.4988 mL
10 mM 0.1749 mL 0.8747 mL 1.7494 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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