Biotinylated isoxazole

目录号: V53482 纯度: ≥98%
生物素化异恶唑是异恶唑的生物素化类似物。
Biotinylated isoxazole CAS号: 1377605-22-5
产品类别: Antibiotic
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
25mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
生物素化异噁唑是异噁唑的生物素化类似物。生物素化异噁唑可诱导与RNA颗粒相关的聚集体的形成。
生物素化异噁唑是异噁唑的生物素偶联衍生物,可从细胞或组织裂解液中沉淀RNA结合蛋白,其组成成分与RNA颗粒的组成成分有显著重叠。它可逆地聚集和解聚类似于RNA颗粒的结构,从而为RNA颗粒组装和功能所需的多肽提供了深入的见解。该化合物被广泛用作研究RNA-蛋白质相互作用以及细胞生理和疾病中RNA颗粒动态变化的化学工具。据报道,它还可通过与核糖体蛋白S6激酶(RSK)结合并抑制4E-BP1的磷酸化来抑制哺乳动物细胞中的蛋白质合成。
生物活性&实验参考方法
靶点
Biotinylated isoxazole targets RNA-binding proteins (RBPs) that constitute RNA granules, including stress granules and P-bodies. It precipitates hundreds of RNA-binding proteins with significant overlap to the constituents of RNA granules. Additionally, it has been reported to bind to ribosomal protein S6 kinase (RSK). The compound's mechanism involves the reversible aggregation of RNA granule-like structures, allowing the identification and study of proteins involved in RNA metabolism and cellular stress responses.
体外研究 (In Vitro)
生物素标记的异噁唑在从细胞和组织裂解液中沉淀RNA结合蛋白方面表现出强大的活性。一项研究表明,生物素标记的异噁唑沉淀了约580种蛋白质,其中大部分与RNA颗粒成分存在显著重叠。该化合物能够以可逆的方式有效诱导与RNA颗粒相关的聚集体的形成。研究表明,它通过靶向RSK/4E-BP1信号通路抑制哺乳动物细胞中的蛋白质合成。该化合物的活性呈浓度依赖性,并被广泛用作研究RNA结合蛋白网络和颗粒动力学的工具。
体内研究 (In Vivo)
由于生物素化异噁唑主要用作体外生化研究的工具,因此其体内活性数据有限。然而,它已被用于基于组织裂解液的检测方法,以研究RNA颗粒的组成和动态变化。该化合物能够可逆地聚集和解聚RNA颗粒样结构,这表明其在细胞模型中研究应激颗粒的形成和清除方面具有潜在价值。需要进一步的体内研究来评估其药代动力学特性和治疗潜力。
酶活实验
体外酶/受体结合实验中,生物素标记的异噁唑通常包括将细胞或组织裂解液与生物素标记的化合物孵育,然后进行链霉亲和素下拉实验以沉淀RNA结合蛋白。沉淀的蛋白随后通过质谱或蛋白质印迹法进行鉴定。该化合物可逆地聚集和解聚类似于RNA颗粒的结构,从而可以研究蛋白质-RNA相互作用。这种实验方法能够鉴定RNA颗粒的组成成分,并研究它们在不同细胞条件下的动态变化。
细胞实验
体外细胞分析中,生物素化异噁唑的检测方法包括:用该化合物处理培养的哺乳动物细胞,然后裂解细胞,并用链霉亲和素下拉法沉淀生物素化蛋白复合物。沉淀的蛋白通过质谱或免疫印迹分析,以鉴定RNA结合蛋白。此外,还可以通过检测处理细胞中RSK和4E-BP1的磷酸化水平来评估该化合物对蛋白质合成的影响。这些检测方法广泛用于研究RNA颗粒动力学和RNA-蛋白质相互作用网络。
动物实验
生物素化异噁唑的体内动物实验数据尚不丰富,因为该化合物主要用作体外研究工具。若用于动物模型,典型方案包括腹腔或静脉注射给药,随后收集组织,并利用链霉亲和素下拉法和质谱分析RNA颗粒组成。该化合物的可逆聚集特性可用于研究体内应激颗粒的动态变化。
药代性质 (ADME/PK)
文献中关于生物素化异噁唑的药代动力学数据尚不充分。作为一种生物素化小分子,其吸收、分布、代谢和排泄特性会受到生物素部分的影响,生物素可能促进其与链霉亲和素的结合并影响组织分布。该化合物通常用于体外研究,其体内药代动力学特征尚未得到系统研究。需要进一步研究以确定其全身暴露量、半衰期和生物利用度。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
生物素化异噁唑的毒理学数据尚不完善。作为一种主要用于体外生化分析的研究工具,其体内安全性尚未得到充分研究。该化合物含有生物素部分,通常认为生物素是安全的,但异噁唑骨架在高浓度下可能导致细胞毒性。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施,包括使用个人防护装备和妥善处理废弃物。
参考文献
[1]. Kato M, et, al. Cell-free formation of RNA granules: low complexity sequence domains form dynamic fibers within hydrogels. Cell. 2012 May 11;149(4):753-67.
其他信息
生物素化异噁唑(CAS号:1377605-22-5)是一种用于研究RNA结合蛋白和RNA颗粒的化学探针。其分子式为C24H32N4O5S2。该化合物可沉淀数百种RNA结合蛋白,且与RNA颗粒的组成成分有显著重叠。它并非获批的治疗药物,而是用于生物化学和细胞生物学研究的工具。该化合物可从多家化学品供应商处获得,仅供研究使用,不得用于人类治疗。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H32N4O5S2
分子量
520.66468334198
精确质量
520.181
CAS号
1377605-22-5
PubChem CID
97301453
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.251±0.06 g/cm3(Predicted)
沸点
800.4±65.0 °C(Predicted)
LogP
3.2
tPSA
176
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
15
重原子数目
35
分子复杂度/Complexity
730
定义原子立体中心数目
3
SMILES
C1[C@H]2[C@@H]([C@@H](S1)CCCCC(=O)OCCCCCCNC(=O)C3=NOC(=C3)C4=CC=CS4)NC(=O)N2
InChi Key
KZZXSHXZDYGEDW-XJABCFGWSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H32N4O5S2/c29-21(10-4-3-8-20-22-17(15-35-20)26-24(31)27-22)32-12-6-2-1-5-11-25-23(30)16-14-18(33-28-16)19-9-7-13-34-19/h7,9,13-14,17,20,22H,1-6,8,10-12,15H2,(H,25,30)(H2,26,27,31)/t17-,20-,22-/m0/s1
化学名
6-[(5-thiophen-2-yl-1,2-oxazole-3-carbonyl)amino]hexyl 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 41.67 mg/mL (80.03 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
View More

注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
View More

口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9206 mL 9.6032 mL 19.2064 mL
5 mM 0.3841 mL 1.9206 mL 3.8413 mL
10 mM 0.1921 mL 0.9603 mL 1.9206 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们