Br-DAPI

别名: Br-DAPI
目录号: V34746 纯度: ≥98%
Br-DAPI 是 DAPI 系列的标记染料。
Br-DAPI CAS号: 2387906-44-5
产品类别: DNA Stain
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
50mg
100mg
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  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
Br-DAPI是DAPI系列标记染料。DAPI是一种荧光染料,能与DNA强力结合。DAPI与双链DNA小沟的A/T碱基对结合(一个DAPI分子可占据3个碱基对位点),从而使荧光强度放大约20倍。通过检测荧光强度即可测定DNA含量。DAPI常用于活细胞和固定细胞的染色,因为它能穿过完整的细胞膜。储存方法:避免阳光直射。
Br-DAPI是经典DNA结合染料DAPI(4',6-二脒基-2-苯基吲哚)的卤代衍生物。与DAPI类似,Br-DAPI是一种荧光染料,能与DNA强力结合,尤其能与双链DNA小沟中的A/T碱基对结合。一个DAPI分子可以占据三个碱基对位置,使荧光强度增强约20倍。Br-DAPI是一种水溶性、细胞渗透性DNA结合光敏剂,常用于荧光显微镜、活细胞和固定细胞成像以及DNA定量分析。溴取代增强了其光物理性质,并赋予其光动力活性。
生物活性&实验参考方法
靶点
Br-DAPI targets DNA, specifically binding to the A/T-rich regions in the minor groove of double-stranded DNA. The compound's binding is highly selective for A/T base pairs, with minimal binding to G/C-rich sequences. The bromine substitution may enhance the compound's photophysical properties and enable photodynamic activity upon light activation. As a DNA-binding dye, Br-DAPI's primary target is the DNA molecule itself, making it useful for nuclear staining in various imaging applications. Its cell-permeability allows it to reach intracellular DNA in live cells.
体外研究 (In Vitro)
使用说明 1. 配制DAPI工作液 1.1 配制储备液 配制1 mg/mL储备液,将1 mg DAPI用1 mL双蒸水稀释。建议将DAPI储备液分装后避光保存于-20°C或-80°C。 1.2 配制工作液 配制1-10 μg/mL DAPI工作液,可使用PBS稀释储备液或热的无血清细胞培养基。 注意:使用DAPI工作液前,请确保其浓度适合当前情况。 2. 细胞染色 2.1 离心收集细胞,加入PBS洗涤两次,每次5分钟。每毫升细胞浓度为1×10⁶个。 2.2 加入1 mL DAPI工作液,室温静置3-10分钟。 2.3 以 400 g 离心 3~4 分钟后,移除上清液。2.4 加入 PBS,用 PBS 洗涤细胞两次,每次 5 分钟。2.5 将细胞重悬于 1 mL PBS 或无血清培养基中,并使用流式细胞仪或荧光显微镜进行观察。3. 贴壁细胞染色 3.1 使用无菌盖玻片培养贴壁细胞。3.2 将盖玻片从培养基中取出后,吸出多余的培养基。3.3 加入 100 μL 染料工作液,轻轻摇晃使细胞完全被染料覆盖,然后静置 3~10 分钟。3.4 吸出染料工作液,用培养基洗涤 2~3 次,每次 5 分钟,并使用流式细胞仪或荧光显微镜进行观察。储存条件:-20°C,避光保存一年。注意事项:1. 请根据实际情况调整DAPI工作液的浓度和孵育时间。2. 本产品仅供专业人员用于科学研究,不得用于临床诊断或治疗,也不得添加到食品或药品中。3. 为了您自身的健康和安全,请穿戴实验服和一次性手套。
体外研究表明,Br-DAPI 是一种高效的 DNA 结合染料,其光物理性质优于 DAPI。该化合物能以高亲和力与双链 DNA 小沟中的 A/T 碱基对结合,结合后荧光强度显著增强。其荧光激发和发射最大值与 DAPI 相似,因此可与标准 DAPI 滤光片组兼容。溴取代可能提高其光稳定性并赋予其光动力活性。该化合物的体外活性通过测量 DNA 结合后的荧光强度、固定细胞和活细胞中的 DNA 染色效率以及光激活后的光动力活性来评估。
体内研究 (In Vivo)
为评估Br-DAPI的DNA染色效率和光动力活性,我们进行了细胞实验。将细胞与适当浓度(通常为0.1-10 ug/mL)的化合物在37℃下孵育10-30分钟。对于活细胞成像,将化合物加入培养基中,并在标准条件下孵育细胞。对于固定细胞成像,在染色前用多聚甲醛或甲醇固定细胞。染色后的细胞经洗涤后,使用配备DAPI滤光片组的荧光显微镜进行成像。通过定量荧光强度来评估DNA含量或细胞周期分布。光动力活性通过光照射染色细胞并测量细胞活力或DNA损伤来评估。
酶活实验
Br-DAPI 的体内应用主要与其作为 DNA 染色剂而非治疗剂有关。该化合物可用于动物模型中离体细胞或组织的标记,但由于其潜在的毒性和快速清除,其体内应用受到限制。在体内使用时,该化合物通常局部给药进行组织染色,而非全身给药。其体内用途主要用于研究,例如追踪细胞群或评估组织 DNA 含量。该化合物不适用于治疗用途。
细胞实验
由于Br-DAPI是一种DNA结合染料而非酶抑制剂,因此体外酶/受体结合试验不适用于它。取而代之的是,DNA结合试验用于表征其与DNA的相互作用。这些试验通常包括将化合物与纯化的DNA(例如,小牛胸腺DNA)或含有富含A/T序列的合成寡核苷酸孵育,并测量结合后的荧光增强。结合亲和力通过荧光滴定法测定,结合化学计量比通过Scatchard分析法评估。通过比较化合物与富含A/T和富含G/C的DNA序列的结合情况,可以确认化合物对A/T碱基对的特异性。
动物实验
Br-DAPI 的细胞检测是评估其作为 DNA 染料效用的主要方法。将细胞培养于合适的培养基中,并用浓度通常为 0.1-10 μg/mL 的化合物处理 10-30 分钟。对于活细胞成像,将化合物直接添加到培养基中。对于固定细胞成像,在染色前先固定细胞。染色后的细胞经洗涤以去除未结合的染料,然后使用配备 DAPI 滤光片组的荧光显微镜进行成像。使用图像分析软件对荧光强度进行定量。通过流式细胞术进行细胞周期分析以评估 DNA 含量。使用 MTT 或类似方法评估细胞毒性。
药代性质 (ADME/PK)
由于Br-DAPI主要用作DNA染色研究工具而非治疗药物,因此其在体内动物研究中的应用有限。在体内,该化合物可用于组织染色或离体细胞标记。例如,可将Br-DAPI注射到荷瘤小鼠体内以标记肿瘤细胞用于成像研究,但此类应用并不常见。该化合物清除迅速且具有潜在毒性,限制了其在体内的应用。文献中鲜有关于Br-DAPI体内研究方案的详细报道。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
Br-DAPI 的药代动力学特性具有小分子 DNA 结合染料的典型特征。该化合物的分子量为 356.22 g/mol,分子式为 C1₆H14BrN₅。它易溶于水,因此可用于水性生物体系。该化合物具有细胞渗透性,能够进入活细胞。通常将其储存在 4℃ 或 -80℃ 的避光条件下。由于该化合物并非用作治疗药物,因此未报告其详细的药代动力学参数,例如半衰期和生物利用度。
参考文献

[1]. DAPI: a DNA-specific fluorescent probe. Biotech Histochem. 1995 Sep;70(5):220-33.

其他信息
由于溴代DAPI(Br-DAPI)主要用作DNA染色研究工具而非治疗药物,因此其毒理学数据有限。该化合物不适用于人类治疗,仅供研究用途。在基于细胞的检测中,该化合物在用于DNA染色的浓度(0.1-10 μg/mL)下通常耐受性良好,但较高浓度可能导致细胞毒性。该化合物的DNA结合特性表明,如果它造成DNA损伤或干扰DNA复制,则可能具有潜在的遗传毒性。处理该化合物时应遵循标准安全预防措施。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H14BRN5
分子量
356.219861507416
精确质量
355.04
CAS号
2387906-44-5
PubChem CID
162642091
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
2.3
tPSA
116
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
2
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
22
分子复杂度/Complexity
446
定义原子立体中心数目
0
SMILES
BrC1=C(C2C=CC(C(=N)N)=CC=2)NC2C=C(C(=N)N)C=CC=21
InChi Key
GSBXNZFEZFIMCS-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H14BrN5/c17-13-11-6-5-10(16(20)21)7-12(11)22-14(13)8-1-3-9(4-2-8)15(18)19/h1-7,22H,(H3,18,19)(H3,20,21)
化学名
3-bromo-2-(4-carbamimidoylphenyl)-1H-indole-6-carboximidamide
别名
Br-DAPI
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.8073 mL 14.0363 mL 28.0725 mL
5 mM 0.5615 mL 2.8073 mL 5.6145 mL
10 mM 0.2807 mL 1.4036 mL 2.8073 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们