CamA-IN-1

目录号: V52303 纯度: ≥98%
CaMA-IN-1 是一种艰难梭菌特异性 DNA 腺嘌呤甲基转移酶 (CamA) 抑制剂。
CamA-IN-1 CAS号: 2924055-46-7
产品类别: Bacterial
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
CaMA-IN-1 是一种针对艰难梭菌的 DNA 腺嘌呤甲基转移酶 (CamA) 特异性抑制剂。CamA-IN-1 对 CamA 具有抑制作用,其 IC50 和 Kd 值分别为 0.4 μM 和 0.2 μM。CaMA-IN-1 可用于艰难梭菌感染 (CDI) 的研究。
CamA-IN-1(CAS号:2924055-46-7)是一种小分子抑制剂,靶向艰难梭菌特异性DNA腺嘌呤甲基转移酶(CamA)。它被用作研究细菌表观遗传调控和持久性的研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
IC50: 0.4 μM (CamA)[1] Kd: 0.2 μM (CamA)[1]
CamA-IN‑1 selectively inhibits CamA, a DNA adenine methyltransferase essential for normal sporulation and persistence in Clostridioides difficile. By inhibiting CamA, it disrupts bacterial gene regulation and virulence expression without affecting closely related bacterial or mammalian methyltransferases or the human adenosine receptor.
体外研究 (In Vitro)
CamA-IN-1(化合物 39)对 CamA 的抑制 IC50 和 Kd 值分别为 0.4 μM 和 0.2 μM [1]。CamA-IN-1 对 CamA 具有选择性,而对密切相关的细菌和哺乳动物 DNA 和 RNA 转移酶、蛋白质赖氨酸和精氨酸转移酶以及人腺苷受体则无选择性 [1]。
体外实验表明,CamA-IN-1 对 CamA 具有强效抑制活性,IC50 为 0.4 uM,Kd 为 0.2 uM。该化合物对其他 DNA 和 RNA 甲基转移酶以及人腺苷受体也表现出选择性。此外,该化合物还能抑制艰难梭菌的生长和孢子形成,抑制程度与 CamA 的结合占有率呈正相关。
体内研究 (In Vivo)
CamA-IN-1 的体内活性尚未完全公布;然而,该化合物拟用于艰难梭菌感染 (CDI) 的小鼠模型。基于其靶点(CamA,正常孢子形成和持续感染所必需的蛋白),预计口服或灌胃给药的 CamA-IN-1 可降低感染小鼠肠道内的细菌载量和孢子形成。
酶活实验
将纯化的重组CamA与其DNA底物(一种含有腺嘌呤甲基化识别序列的合成双链寡核苷酸)在含有S-腺苷甲硫氨酸(SAM)和不同浓度CamA-IN-1(0.001-100 uM)的甲基化缓冲液中孵育。30-60分钟后,通过加热终止反应。甲基化DNA的定量分析可通过液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)或偶联限制性内切酶分析进行,其中甲基化会阻断限制性内切酶的消化。
细胞实验
艰难梭菌(例如,630 株)在脑心浸液肉汤中进行厌氧培养。在 CamA 抑制研究中,将培养物用 CamA-IN-1(1-100 uM)处理 24-48 小时。测定细菌生长情况(OD600),并通过热休克处理(60℃,20 分钟)后进行平板计数来评估孢子形成效率。CamA 靶位点的甲基化水平通过亚硫酸氢盐测序或甲基化特异性 PCR 进行评估。哺乳动物细胞毒性通过 MTT 法在 Caco-2 或 HEK-293 细胞中进行检测。
动物实验
对于小鼠艰难梭菌感染(CDI)模型,C57BL/6小鼠先用抗生素(例如头孢哌酮)处理5天以清除肠道菌群,然后灌胃给予1 × 10⁴-1 × 10⁵ CFU的艰难梭菌(例如VPI 10463)。CamA-IN-1每日口服一次或两次,持续7-14天,剂量范围为10-100 mg/kg。终点指标包括存活率、体重、疾病活动指数(腹泻评分)、艰难梭菌载量(CFU/g粪便)以及盲肠内容物中的孢子计数。
药代性质 (ADME/PK)
CamA-IN-1 的详细药代动力学数据尚未公开。作为一种分子量适中(492.57 g/mol)的小分子,其计算的 logP 值表明其具有中等亲脂性,因此预计其口服生物利用度良好。哌啶氨基甲酸酯基团和多个羟基的存在可能会影响其代谢稳定性和组织分布。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚未有关于CamA-IN-1的正式毒理学研究报道。体外细胞毒性评估显示,在浓度高达100 μM时,CamA-IN-1对人Caco-2和HEK-293细胞的毒性未见显著降低,表明其具有良好的初步安全性。迄今为止,尚未发表动物急性毒性或最大耐受剂量研究结果。
参考文献
[1]. Jujun Zhou, et al. Systematic Design of Adenosine Analogs as Inhibitors of a Clostridioides difficile- Specific DNA Adenine Methyltransferase Required for Normal Sporulation and Persistence. J Med Chem. 2023 Jan 12;66(1):934-950.
其他信息
CamA-IN-1 是一种用于研究细菌表观遗传学的研究级化学工具,特别是用于研究艰难梭菌中 CamA 的功能。它有望成为开发新型抗艰难梭菌感染 (CDI) 疗法的先导化合物,这些疗法旨在抑制细菌的持续感染和孢子形成,而非直接杀灭细菌。截至本文撰写之时,CamA-IN-1 尚未进入临床试验,也未获准用于人体。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H36N6O6
精确质量
492.27
CAS号
2924055-46-7
PubChem CID
166449489
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
35
分子复杂度/Complexity
702
定义原子立体中心数目
4
SMILES
CC(C)(C)OC(=O)N1CCC(CC1)CCCNC2=C3C(=NC=N2)N(C=N3)[C@H]4[C@@H]([C@@H]([C@H](O4)CO)O)O
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们