| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
G-quadruplex
Carboxy pyridostatin trifluoroacetate salt targets G-quadruplex (G4) structures in DNA and RNA. G4s are non-canonical secondary structures formed by guanine-rich nucleic acid sequences. By selectively binding and stabilizing G4 structures, the compound interferes with telomerase activity, transcription, and replication. This mechanism underlies its potential effects on tumor cell proliferation and gene expression. |
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| 体外研究 (In Vitro) |
G-四链体是哺乳动物基因组和转录组中普遍存在的核酸二级结构，它们调控基因表达和基因组复制。能够改变G-四链体稳定性的小分子配体在癌症研究中得到了广泛关注，但G-四链体配体是否也能用于调控正常发育和稳态条件下的细胞功能，目前尚不清楚。本文研究表明，两种相关的G-四链体配体（吡啶斯他汀和羧基吡啶斯他汀）能够降低成年小鼠脑室下区来源的成年神经干细胞和祖细胞的增殖，无论是在体外还是体内。神经球培养实验表明，吡啶斯他汀通过一种与DNA损伤和细胞死亡相关的机制来抑制细胞增殖。相比之下，羧基吡啶斯他汀选择性地靶向RNA G-四链体的稳定性，则通过促进细胞周期退出和少突胶质细胞祖细胞生成的机制来抑制细胞增殖。然而，通过靶向RNA G-四链体稳定性来生成少突胶质细胞祖细胞的能力取决于细胞环境。这些发现共同表明，能够选择性稳定RNA G-四链体的配体是一类重要的新型分子工具，可用于神经干细胞和祖细胞的工程改造；而靶向DNA G-四链体的配体由于其毒性，应用受到限制。[1]在无细胞生化体系中，羧基吡啶斯他汀三氟乙酸盐能够高特异性地结合G-四链体结构。该化合物与G4的结合可以通过圆二色谱(CD)、紫外熔解实验或基于荧光的G4结合实验进行评估。该化合物对DNA G4上的RNA表现出高度的分子特异性。
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| 体内研究 (In Vivo) |
在基于细胞的实验中，羧基吡啶斯他汀三氟乙酸盐可稳定G-四链体结构，从而抑制端粒酶活性并调节基因表达。通过测量端粒酶活性、细胞增殖和基因表达变化，评估该化合物在癌细胞系中的作用。该化合物通过影响肿瘤细胞增殖和基因表达，具有潜在的抗癌活性。
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| 酶活实验 |
吡啶斯他汀 (PDS) 是基于 N,N'-双(喹啉基)吡啶-2,6-二甲酰胺骨架的 G-四链体 (G4) 稳定合成小分子家族的先导化合物。其作用机制是通过与端粒相关蛋白（例如人 POT1）竞争结合，诱导端粒功能障碍。最近，通过模板导向的“原位”点击化学方法，发现了一种 PDS 衍生物——羧基吡啶斯他汀 (cPDS)。cPDS 的独特之处在于它对 RNA G4 表现出比 DNA G4 更高的分子特异性，而 PDS 则是一种良好的 RNA 和 DNA G4 相互作用通用小分子。目前尚无这些化合物结合模式的结构数据，cPDS 对 TERRA G4 的选择性模式也尚不清楚。因此，本研究旨在通过分子动力学和分子对接模拟，阐明cPDS与TERRA G4选择性的机制，并进一步理解这些化合物与端粒G4结构的结合模式。对cPDS结合模式及其构象行为的全面分析表明，配体构象特性及其显著的溶剂化作用至关重要。本研究有望为进一步合理设计新型选择性TERRA G4结合剂提供有价值的线索。[2]
G4结合的无细胞检测方法是将化合物与G-四链体形成寡核苷酸孵育。结合情况可通过圆二色谱(CD)监测G4结构的变化、紫外熔解实验测量热稳定性变化或使用G4特异性荧光探针进行荧光检测来评估。化合物对不同G4结构的选择性可通过测试各种G4形成序列来评估。 |
| 细胞实验 |
羧基吡啶斯他汀三氟乙酸盐的细胞活性检测包括培养癌细胞系，并用浓度范围为 0.1 至 100 μM 的化合物处理细胞。端粒酶活性采用 TRAP 法进行评估。细胞增殖采用 MTT 或 CCK-8 法进行评估。基因表达变化通过 qRT-PCR 或 RNA-seq 进行评估。此外，还评估了该化合物对细胞周期进程和细胞凋亡的影响。
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| 动物实验 |
目前尚无针对羧基吡啶斯他汀三氟乙酸盐的成熟动物实验方案。作为一种具有潜在抗癌活性的G-四链体稳定剂，该化合物有望在癌症动物模型中进行评估。典型的研究方法是通过腹腔或静脉途径将该化合物给药于荷瘤小鼠。研究将评估肿瘤生长、端粒酶活性和基因表达的变化。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
羧基吡啶斯他汀三氟乙酸盐的药代动力学性质尚未得到充分报道。该化合物分子量较大，为 820.73 g/mol，预计口服生物利用度有限，可能需要肠外给药。该化合物在水中的溶解度为 60 mg/mL，通常储存于 -20°C，干燥密封保存。需要进一步开展药代动力学研究以进行治疗开发。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
羧基吡啶斯他汀三氟乙酸盐仅供研究使用，尚无已确定的治疗应用毒性数据。处理该化合物时应遵守标准的实验室安全预防措施。作为一种G-四链体稳定剂，它可能对正常细胞和癌细胞均有影响。需要进行啮齿动物的标准毒性研究以确定最大耐受剂量和安全性。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
羧基吡啶斯他汀三氟乙酸盐是一种研究级化合物，用于G-四链体和癌症研究。它并非已获批准的药品，也没有临床试验历史。该化合物是一种G-四链体稳定剂，可选择性地与DNA或RNA中的G4结构结合。本产品仅供研究使用。
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| 分子式 |
C37H35F3N10O9
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|---|---|
| 分子量 |
820.7306
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| 精确质量 |
706.26119
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| CAS号 |
2444713-88-4
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| PubChem CID |
134828255
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| 外观&性状 |
Off-white to light yellow solid powder
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| LogP |
-1.1
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| tPSA |
245Ų
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| 氢键供体(HBD)数目 |
6
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| 氢键受体(HBA)数目 |
19
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| 可旋转键数目(RBC) |
16
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| 重原子数目 |
59
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| 分子复杂度/Complexity |
1190
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
O(C1=CC(NC(C2=CC(OCC3N=NN(CCC(=O)O)C=3)=CC(C(=O)NC3C=C(OCCN)C4C=CC=CC=4N=3)=N2)=O)=NC2C=CC=CC1=2)CCN.O=C(C(F)(F)F)O
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| InChi Key |
WTHDBHUUPVHFQX-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C35H34N10O7.C2HF3O2/c36-10-13-50-29-17-31(39-25-7-3-1-5-23(25)29)41-34(48)27-15-22(52-20-21-19-45(44-43-21)12-9-33(46)47)16-28(38-27)35(49)42-32-18-30(51-14-11-37)24-6-2-4-8-26(24)40-32;3-2(4,5)1(6)7/h1-8,15-19H,9-14,20,36-37H2,(H,46,47)(H,39,41,48)(H,40,42,49);(H,6,7)
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| 化学名 |
3-[4-[[2,6-bis[[4-(2-aminoethoxy)quinolin-2-yl]carbamoyl]pyridin-4-yl]oxymethyl]triazol-1-yl]propanoic acid;2,2,2-trifluoroacetic acid
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| 别名 |
Carboxy pyridostatin trifluoroacetate salt; 2444713-88-4; Carboxy pyridostatin (trifluoroacetate salt);3-(4-(((2,6-Bis((4-(2-aminoethoxy)quinolin-2-yl)carbamoyl)pyridin-4-yl)oxy)methyl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl)propanoic acid;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 请将本产品存放在密封且受保护的环境中，避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : 100 mg/mL (121.84 mM)
H2O : 60 mg/mL (73.11 mM) |
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.2184 mL | 6.0921 mL | 12.1843 mL | |
| 5 mM | 0.2437 mL | 1.2184 mL | 2.4369 mL | |
| 10 mM | 0.1218 mL | 0.6092 mL | 1.2184 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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