| 规格 | 价格 | |
|---|---|---|
| 500mg | ||
| 1g | ||
| Other Sizes |
| 靶点 |
Colibactin 742 targets DNA, forming interstrand crosslinks (ICLs) through cyclopropane ring-opening, likely alkylating adenine-N3 residues on opposing strands. This DNA damage activates the Fanconi anemia (FA) DNA repair pathway, leading to FANCD2 monoubiquitination and recruitment, as well as γH2AX focus formation. The compound also induces replication fork stalling and fork fusion events. The gem-dimethyl derivative 22 (lacking cyclopropanes) and the left/right fragments 23 and 24 do not form DNA ICLs, confirming that both cyclopropane warheads are required for crosslinking. The inactive analog colibactin 746 (with methyl groups replacing cyclopropanes) does not induce DNA damage. [1][2]
|
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
Colibactin 742 在 pH 5.0 和 pH 7.0 下在 linearized pUC19 DNA 中诱导 DNA 链间交联，活性浓度低至 10-100 nM。线性前体 9 显示出相似的交联活性。相反，gem-二甲基衍生物 22、左片段 23 和右片段 24 不形成链间交联。 [1]
在大鼠 IEC-6 肠上皮细胞中，3-100 μM 742 处理 24 小时以浓度依赖性方式诱导 γH2AX 焦点形成，而无活性类似物 746 不诱导。在人结肠类器官中，10-100 μM 742 处理 48 小时诱导 γH2AX 焦点并减少类器官直径和活力。 [3] 在人结肠上皮 FHC 细胞中，10-100 μM 742 处理 4-12 小时诱导 p53 信号通路、细胞周期停滞/衰老通路和内质网应激通路的转录激活。上游调节因子分析确定 p53 和 CDKN2A 为预测的激活调节因子。抗增殖和凋亡相关基因上调。 [3] 在 RWPE-1 前列腺上皮细胞中，742 处理显著增加复制叉停滞，并在 20 μM 下诱导复制叉融合事件增加 2.2 倍。 [2] 在 HCT 116 细胞中，慢性暴露于 20 μM 742 增加 SNV 和 indel 总数，突变特征包括 SBS88、SBS44 和 SBS17。 [3] 细胞毒性：在 HeLa 细胞中，colibactin 742 的 IC50 为 5.2 ± 2.1 μM，线性前体 9 为 7.2 ± 1.7 μM。 [1] |
| 体内研究 (In Vivo) |
在蜡螟幼虫中，口服 7.42 μg colibactin 742（按幼虫体重 250 mg 计，约 30 mg/kg）24 小时后，通过碱性彗星实验检测到肠道上皮细胞中显著的 DNA 损伤（尾矩和尾强度增加）。无活性类似物 746 不诱导显著 DNA 损伤。血腔注射 7.42 μg 742 与 746 相比增加表皮黑化。 [3]
在无菌 Apcᴹⁱⁿ/⁺ DSS 结肠炎相关癌症小鼠模型中，与 pks⁺ 大肠杆菌定植相比，colibactin 缺陷型 ΔclbP 突变体定植增加了结肠肿瘤中的体细胞 SNP 总数，并增强了错配修复缺陷相关特征 SBS15 的突变比例。但由于合成量限制，colibactin 742 本身未用于小鼠给药。 [3] |
| 细胞实验 |
IEC-6 细胞 γH2AX 免疫荧光：细胞种于 8 孔腔室玻片，血清饥饿过夜，然后用 DMSO、3 μM MMC 或不同浓度 742/746 处理 24 小时。固定、透化、封闭后，与抗磷酸化组蛋白 H2AX 抗体（1:800）4°C 孵育过夜，然后用 Alexa Fluor 488 二抗孵育。DAPI 染核。>5 个焦点/核的细胞计为阳性。 [3]
人结肠类器官培养和处理：类器官在 Matrigel 中培养。传代后用 10-100 μM 742/746 处理 48 小时。γH2AX 检测时，固定、透化后染色。每条件测量 30 个类器官的直径和活力。 [3] HeLa 细胞细胞毒性测定：HeLa 细胞用系列稀释的 742 或 9 处理 72 小时。使用 CellTiter-GLO 发光法测定细胞活力。742 的 IC50 为 5.2 ± 2.1 μM，9 为 7.2 ± 1.7 μM。 [1] RWPE-1 细胞 DNA 纤维测定：细胞用 100 μM IdU 脉冲标记 20 分钟，然后用 10-40 μM 742 处理 1 小时，再用 300 μM CldU 标记 20 分钟。DNA 纤维用分子梳系统铺展，用抗 IdU 和抗 CldU 抗体染色，共聚焦显微镜成像。定量叉停滞和融合事件。 [2] HCT 116 细胞慢性暴露：HCT 116 细胞用 20 μM 742 或 746 处理 48 小时，洗涤，恢复 48-96 小时，重复 10 个循环。然后亚克隆，扩增 30-32 天后进行全基因组测序和 RNA-seq 分析。 [3] |
| 动物实验 |
蜡螟幼虫口服给药：Colibactin 742 或 746 溶于 DMSO，以每只幼虫 7.42 μg（约 30 mg/kg）的剂量通过口服灌胃给药，终体积 10 μL。加入蓝色食用色素（1:10,000）以可视化成功灌胃。24 小时后，每组 5 只幼虫的中肠被解剖、合并，分离上皮细胞用于碱性彗星实验。 [3]
蜡螟幼虫血腔注射：化合物（7.42 μg 于 10 μL 中）注射到 G. mellonella 幼虫的末足。24 小时后，使用标准化评分系统量化健康指数和黑化评分。 [3] |
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
在 HeLa 细胞中，colibactin 742 处理 72 小时的 IC50 为 5.2 ± 2.1 μM，表明在低微摩尔浓度下具有细胞毒性。线性前体 9 的 IC50 相似（7.2 ± 1.7 μM）。无活性类似物 746 无显著细胞毒性。 [1]
在人结肠类器官中，100 μM colibactin 742 处理 48 小时显著降低类器官活力和直径，而 746 影响很小。 [3] 在 RWPE-1 细胞中，10-40 μM colibactin 742 诱导复制叉停滞和融合事件，表明基因毒性应激。 [2] 在蜡螟幼虫中，口服 742 在肠上皮细胞中诱导显著的 DNA 损伤，而 746 不诱导。 [3] |
| 参考文献 |
|
| 其他信息 |
合成与稳定性：Colibactin 742 通过汇聚合成制备。线性前体 9 在质子溶剂中发生环化脱水形成 colibactin 弹头。环异构体 4b 是主要产物，环化是不可逆的。 [1]
与天然 colibactin 的比较：Colibactin 742 缺乏天然 colibactin 770 中不稳定的 C36-C37 1,2-二酮，赋予更高的稳定性，同时保留形成 DNA 链间交联的能力，证实二酮对交联不是必需的。 [1] 与无活性类似物 746 的比较：Colibactin 746 的两个环丙烷弹头被甲基取代，不诱导 DNA 损伤、γH2AX 焦点或 DNA 损伤反应通路的转录激活。 [1][3] 作用机制：Colibactin 结合于 DNA 小沟，通过环丙烷开环烷基化腺嘌呤-N3 残基，形成链间交联。这激活范可尼贫血修复通路，导致复制叉停滞、融合和染色体易位。Colibactin 与 DHT 在前列腺细胞中的组合协同增加基因组不稳定性。 [1][2][3] |
| 分子式 |
C37H42N8O5S2
|
|---|---|
| 分子量 |
742.90998506546
|
| 精确质量 |
742.27
|
| CAS号 |
2916559-62-9
|
| PubChem CID |
162413463
|
| 外观&性状 |
Typically exists as solid at room temperature
|
| LogP |
-1.3
|
| tPSA |
244 Ų
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
5
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
11
|
| 可旋转键数目(RBC) |
11
|
| 重原子数目 |
52
|
| 分子复杂度/Complexity |
1730
|
| 定义原子立体中心数目 |
2
|
| SMILES |
S1C(CCC2=CSC(CNC(CC3=C(C4CC[C@H](C)N=4)C(NC43CC4)=O)=O)=N2)=NC(=C1)C1(CNC(C1C1=C(C2CC[C@H](C)N=2)C(NC21CC2)=O)=O)O
|
| InChi Key |
MUFRDBRHJIYYPD-AYLSQICOSA-N
|
| InChi Code |
InChI=1S/C37H42N8O5S2/c1-18-3-6-22(40-18)28-21(35(9-10-35)44-32(28)47)13-25(46)38-14-27-42-20(15-51-27)5-8-26-43-24(16-52-26)37(50)17-39-34(49)31(37)30-29(23-7-4-19(2)41-23)33(48)45-36(30)11-12-36/h15-16,18-19,31,50H,3-14,17H2,1-2H3,(H,38,46)(H,39,49)(H,44,47)(H,45,48)/t18-,19-,31?,37?/m0/s1
|
| 化学名 |
N-[[4-[2-[4-[3-hydroxy-4-[6-[(2S)-2-methyl-3,4-dihydro-2H-pyrrol-5-yl]-5-oxo-4-azaspiro[2.4]hept-6-en-7-yl]-5-oxopyrrolidin-3-yl]-1,3-thiazol-2-yl]ethyl]-1,3-thiazol-2-yl]methyl]-2-[6-[(2S)-2-methyl-3,4-dihydro-2H-pyrrol-5-yl]-5-oxo-4-azaspiro[2.4]hept-6-en-7-yl]acetamide
|
| 别名 |
Colibactin 742; Colibactin-742; 2916559-62-9; orb1744645;
|
| HS Tariff Code |
2934.99.9001
|
| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
|
| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
|
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.3461 mL | 6.7303 mL | 13.4606 mL | |
| 5 mM | 0.2692 mL | 1.3461 mL | 2.6921 mL | |
| 10 mM | 0.1346 mL | 0.6730 mL | 1.3461 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
PRKGGRRRRAWGRRRRRRRRRRRRAPRKRLTLA
FK 973
Cr-ACP1
Galarubicin hydrochloride
InvivoChem的所有产品仅用于作科学研究，不面向患者销售
Copyright 2020 InvivoChem LLC | All Rights Reserved 粤ICP备20063088号-1
粤公网安备 44011102003439号
463611831
