| 规格 | 价格 | |
|---|---|---|
| 500mg | ||
| 1g | ||
| Other Sizes |
| 靶点 |
The target of Dimethyl-F-OICR-9429-COOH is WD40 repeat domain protein 5 (WDR5). WDR5 is a core component of the Mixed-Lineage Leukemia (MLL) complex, playing a critical role in histone H3 lysine 4 (H3K4) methylation and the regulation of gene transcription. By binding with high affinity to the surface of WDR5, this ligand can competitively disrupt the WDR5-MLL interaction. In PROTAC applications, it serves as the target protein recognition module, directing WDR5 to an E3 ubiquitin ligase and triggering its proteasome-dependent degradation. The carboxylic acid functionality in this derivative facilitates linker conjugation for PROTAC construction.
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|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
一个配体用于 E3 泛素连接酶，另一个配体用于靶蛋白；这两个配体通过接头连接形成 PROTAC。 PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性破坏靶蛋白[1]。
该化合物主要用于PROTAC合成而非独立生物学评估。其母体化合物OICR-9429在体外WDR5结合亲和力Kd为24-93 nM，在多种癌细胞系中表现出抗增殖活性。Dimethyl-F-OICR-9429-COOH作为WDR5配体，其结合特性通过与OICR-9429类似机制实现。体外PROTAC实验中，由该配体构建的PROTAC分子利用细胞内泛素-蛋白酶体系统实现靶蛋白WDR5的选择性降解。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
该化合物目前定位于PROTAC合成的中间体工具，而非直接用于体内药效学评估的候选分子。由该配体构建的完整PROTAC分子的体内抗肿瘤活性取决于整体分子设计（包括WDR5配体、连接子和E3连接酶配体三部分的协同作用），目前未见基于此配体的PROTAC体内研究数据。
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| 酶活实验 |
WDR5配体与靶蛋白的结合亲和力评估可采用表面等离子体共振或荧光偏振技术。对于该系列化合物的典型流程：将重组WDR5蛋白固定于芯片或反应体系中，将不同浓度的Dimethyl-F-OICR-9429-COOH（0-1000 nM）溶于结合缓冲液（如PBS + 0.005% Tween-20）后与WDR5蛋白孵育，测定结合信号。母体化合物OICR-9429在该类体系中测得Kd = 24 nM。该配体衍生物通过羧酸修饰保留了与WDR5的结合能力，作为PROTAC构建的靶蛋白识别模块使用。
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| 细胞实验 |
Dimethyl-F-OICR-9429-COOH作为PROTAC合成的中间体，其本身的细胞实验流程在公开文献中尚未报道。由该配体构建的PROTAC分子的细胞降解活性评估典型流程如下：取对数生长期的WDR5高表达癌细胞（如MLL重排的急性髓系白血病细胞系），以5×10³-1×10⁴个/孔的密度接种于96孔板，培养过夜后加入不同浓度的PROTAC化合物（0.1-1000 nM），处理24-72小时。通过Western blot检测WDR5蛋白水平变化，计算DC₅₀和Dmax。同时可通过MTT或CellTiter-Glo法检测细胞活力。
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| 动物实验 |
Dimethyl-F-OICR-9429-COOH本身的体内动物实验流程在公开文献中尚未报道。该化合物目前主要用于PROTAC合成研究而非直接体内给药。PROTAC分子的体内评估标准流程如下：选用6-8周龄雌性裸鼠，皮下接种WDR5驱动的癌细胞系（5×10⁶个/100 μL PBS），待肿瘤体积达100-150 mm³后随机分组，PROTAC化合物通过腹腔注射或静脉注射给药，每周测量2-3次肿瘤体积和体重。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
该化合物为PROTAC合成的中间体配体，其本身的ADME参数未被独立表征。该化合物的溶解性信息供参考：在DMSO中溶解度约200 mg/mL（365.96 mM），常用体内注射制剂配方包括DMSO : Tween 80 : 生理盐水 = 10 : 5 : 85等。产品仅供科研使用，其药代参数不具备独立的临床前药理学意义。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
关于Dimethyl-F-OICR-9429-COOH的系统性毒理学资料目前较为有限。该化合物明确声明仅供科学研究使用，不用于人体治疗。产品归类于PROTAC合成中间体，主要涉及化学操作安全规范。粉末可在-20°C避光保存3年，4°C保存2年，溶液在-80°C保存6个月，-20°C保存1个月。从WDR5靶点机制看，该通路的长期抑制或降解对正常细胞的潜在影响尚需进一步研究。
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| 参考文献 |
| 分子式 |
C27H26F4N4O4
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|---|---|
| 分子量 |
546.513360500336
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| 精确质量 |
546.189
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| CAS号 |
2407458-49-3
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| PubChem CID |
148647697
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| 外观&性状 |
Light brown to brown solid powder
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| LogP |
1
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| tPSA |
102
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
3
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
10
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| 可旋转键数目(RBC) |
5
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| 重原子数目 |
39
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| 分子复杂度/Complexity |
1020
|
| 定义原子立体中心数目 |
2
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| SMILES |
C1(C2=CC=C(N3C[C@H](C)N(C)[C@H](C)C3)C(NC(C3C(C(F)(F)F)=CC(=O)NC=3)=O)=C2)=C(F)C=CC(C(O)=O)=C1
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| InChi Key |
NLHFYALGJZKULH-GASCZTMLSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C27H26F4N4O4/c1-14-12-35(13-15(2)34(14)3)23-7-5-16(18-8-17(26(38)39)4-6-21(18)28)9-22(23)33-25(37)19-11-32-24(36)10-20(19)27(29,30)31/h4-11,14-15H,12-13H2,1-3H3,(H,32,36)(H,33,37)(H,38,39)/t14-,15+
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| 化学名 |
4-fluoro-3-[3-[[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1H-pyridine-3-carbonyl]amino]-4-[(3S,5R)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl]phenyl]benzoic acid
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| 别名 |
Dimethyl-F-OICR-9429-COOH; 2407458-49-3; 6-fluoro-3'-[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-amido]-4'-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl]-[1,1'-biphenyl]-3-carboxylic acid; orb1984563; NLHFYALGJZKULH-GASCZTMLSA-N;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 本产品在运输和储存过程中需避光。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~200 mg/mL (~366.0 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.8298 mL | 9.1490 mL | 18.2979 mL | |
| 5 mM | 0.3660 mL | 1.8298 mL | 3.6596 mL | |
| 10 mM | 0.1830 mL | 0.9149 mL | 1.8298 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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