| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
DNA. Ecubectedin is a transcriptional inhibitor that binds to the minor groove of DNA, forming covalent adducts with guanine residues. This binding blocks DNA-protein interactions, particularly interfering with transcription factors and the transcription machinery, leading to inhibition of RNA synthesis (both mRNA and rRNA). This results in cell cycle arrest and apoptosis. It is a DNA/RNA synthesis inhibitor and belongs to the tetrahydroisoquinoline alkaloid class.
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| 体外研究 (In Vitro) |
体外实验表明，依库贝替定在人类实体瘤模型中具有强效的抗增殖活性。它能抑制多种癌细胞系的增殖，IC50值预计在低纳摩尔范围内（与其他依库贝替定类化合物相似）。依库贝替定可形成DNA加合物，阻断RNA合成，并诱导细胞凋亡。作为一种转录抑制剂，它优先影响转录活跃的基因。此外，依库贝替定还具有抗菌特性。
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| 体内研究 (In Vivo) |
依库贝替定在人体实体瘤模型中表现出强效的体内抗增殖活性。研究表明，它能抑制多种实体瘤异种移植模型（包括卵巢癌、乳腺癌、肺癌和结肠癌）的肿瘤生长。依库贝替定是DNA结合抗癌药物曲贝替定的合成类似物。目前，依库贝替定正处于实体瘤的临床前或早期临床开发阶段。
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| 酶活实验 |
DNA结合研究的典型方案是将DNA寡核苷酸（例如，50个碱基对的富含GC序列，1 uM）与不同浓度的依库贝替定（1 nM-10 uM）在含有100 mM KCl、5 mM MgCl2和1 mM DTT的20 mM Tris-HCl缓冲液（pH 7.5）中于25℃孵育2-4小时。DNA加合物的形成通过琼脂糖凝胶电泳（DNA迁移率变动分析）在1-2%琼脂糖凝胶上进行检测，并用溴化乙锭染色。或者，也可以使用液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）来鉴定特定的DNA加合物。对于RNA合成抑制，则进行体外转录实验。将纯化的 RNA 聚合酶 II (10 nM) 与 DNA 模板 (1 ug) 和 NTP（每种 100 uM，包括 3H-UTP）在转录缓冲液（20 mM HEPES，pH 7.9，60 mM KCl，10 mM MgCl2，2 mM DTT）中于 30℃ 孵育 30 分钟。在反应开始时加入依库贝替定 (0.1-100 nM)。终止反应后，用 TCA 沉淀 RNA 产物，并将沉淀物收集在玻璃纤维滤膜上。通过闪烁计数法测定放射性。通过剂量反应曲线确定 RNA 合成抑制的 IC50 值。
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| 细胞实验 |
将人实体瘤细胞系（例如，A549肺癌细胞、HCT116结肠癌细胞、MCF-7乳腺癌细胞、OVCAR-3卵巢癌细胞）以3000-5000个细胞/孔的密度接种于96孔板中，培养基为含10%胎牛血清（FBS）的RPMI 1640培养基。24小时后，用浓度范围为0.01 pM至100 nM的依库贝替定处理细胞72-96小时。采用CellTiter-Glo（基于ATP）或SRB（磺基罗丹明B）法评估细胞活力。IC50值通过非线性回归计算。为研究其作用机制，用浓度为0.1-10 nM的依库贝替定处理细胞4-24小时。通过测定3H-尿苷掺入总RNA的量来评估RNA合成。 DNA加合物的形成可通过改良的彗星试验（使用DNA修复酶）或使用抗DNA加合物抗体的免疫荧光法检测。细胞凋亡可通过caspase-3/7活性检测以及Annexin V/PI双染流式细胞术检测。细胞周期分布可通过碘化丙啶染色分析，G2/M期阻滞和亚G1期细胞积累提示细胞凋亡。
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| 动物实验 |
在体内疗效研究中，将5×10⁶个人类癌细胞（例如，A549肺癌细胞、HCT116结肠癌细胞）悬浮于100 μL PBS与Matrigel按1:1比例混合的溶液中，皮下注射到6-8周龄、18-22 g的雌性BALB/c裸鼠体内。当肿瘤体积达到100-200 mm³（接种后约7-14天）时，将小鼠随机分为治疗组（每组n=8-10）。每周一次，经尾静脉注射依库贝替定（0.1-1 mg/kg），持续3-4周。溶剂对照组注射生理盐水或DMSO/PBS。阳性对照组注射曲贝替定（0.2 mg/kg）或顺铂（5 mg/kg）。每周两次用游标卡尺测量肿瘤体积，并按（长×宽²）/2计算。每周监测两次体重，以评估耐受性。研究结束时（第28天或肿瘤体积达到2000 mm³时），处死小鼠，切除肿瘤，称重，并进行组织病理学（H&E染色）、免疫组织化学（Ki67用于增殖检测，cleaved caspase-3用于凋亡检测）和LC-MS DNA加合物分析。在生存期延长研究中监测生存情况。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
目前尚无公开的依库贝替定详细药代动力学数据。作为曲贝替定的合成类似物，预计其药代动力学特征与曲贝替定相似。曲贝替定的分布容积较大（在人体内约为1800-4500 L/m²），表明其与组织广泛结合，且血浆蛋白结合率很高（>95%）。它主要在肝脏中通过CYP3A4代谢。其终末半衰期较长（约80-100小时）。由于口服生物利用度低，依库贝替定需静脉给药。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
目前尚未有具体的毒性数据报告。作为一种DNA结合转录抑制剂，Ecubectedin的毒性特征预计与trabectedin相似，包括肝毒性（转氨酶升高）、血液毒性（中性粒细胞减少症、血小板减少症）、疲劳、恶心和呕吐。这些毒性反应具有剂量限制性，但通常是可逆的。该化合物是一种强效细胞毒性药物，必须采取适当的安全预防措施（生物安全柜、防护设备）进行操作。除临床试验外，不得用于人体。
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| 其他信息 |
依库贝替定是DNA小沟结合剂鲁宾替定的合成类似物，具有潜在的抗肿瘤活性。给药后，依库贝替定特异性抑制RNA合成，从而阻止蛋白质编码基因的转录。这可能杀死肿瘤细胞。
依库贝替定 (PM14) 是依库贝替定类化合物的合成类似物，依库贝替定是一类具有广泛抗肿瘤和抗菌活性的四氢异喹啉生物碱。它是一种DNA结合转录抑制剂，可形成DNA加合物，从而阻断RNA合成。依库贝替定仅供研究使用，临床试验之外不得用于人体治疗。依库贝替定正被开发为一种用于治疗实体瘤的抗癌药物。其分子式为C41H44N4O10S，分子量为784.87。 |
| 分子式 |
C41H44N4O10S
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|---|---|
| 分子量 |
784.873869895935
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| 精确质量 |
784.277
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| CAS号 |
2248127-53-7
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| PubChem CID |
146175071
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| 外观&性状 |
Typically exists as solid at room temperature
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| LogP |
3.3
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| tPSA |
201
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| 氢键供体(HBD)数目 |
5
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| 氢键受体(HBA)数目 |
14
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| 可旋转键数目(RBC) |
4
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| 重原子数目 |
56
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| 分子复杂度/Complexity |
1530
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| 定义原子立体中心数目 |
8
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| SMILES |
CC1=CC2=C([C@@H]3[C@@H]4[C@H]5C6=C(C(=C7C(=C6[C@@H](N4[C@H]([C@H](C2)N3C)O)COC(=O)[C@@]8(CS5)C9=C(C[C@H](N8)CO)C2=CC=CC=C2N9)OCO7)C)OC(=O)C)C(=C1OC)O
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| InChi Key |
PVXBRBBFWHHDFS-DJQPDYNTSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C41H44N4O10S/c1-17-10-20-11-25-39(49)45-26-14-52-40(50)41(38-23(12-21(13-46)43-41)22-8-6-7-9-24(22)42-38)15-56-37(31(45)30(44(25)4)27(20)32(48)33(17)51-5)29-28(26)36-35(53-16-54-36)18(2)34(29)55-19(3)47/h6-10,21,25-26,30-31,37,39,42-43,46,48-49H,11-16H2,1-5H3/t21-,25-,26-,30+,31+,37+,39-,41+/m0/s1
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| 化学名 |
[(1R,2R,3R,3'S,11S,12S,14R,26R)-5,12-dihydroxy-3'-(hydroxymethyl)-6-methoxy-7,21,30-trimethyl-27-oxospiro[17,19,28-trioxa-24-thia-13,30-diazaheptacyclo[12.9.6.13,11.02,13.04,9.015,23.016,20]triaconta-4(9),5,7,15,20,22-hexaene-26,1'-2,3,4,9-tetrahydropyrido[3,4-b]indole]-22-yl] acetate
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.2741 mL | 6.3705 mL | 12.7410 mL | |
| 5 mM | 0.2548 mL | 1.2741 mL | 2.5482 mL | |
| 10 mM | 0.1274 mL | 0.6370 mL | 1.2741 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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