Halo-DBCO

别名: Halo-DBCO; 1808119-16-5; 4-(2-azatricyclo[10.4.0.04,9]hexadeca-1(16),4,6,8,12,14-hexaen-10-yn-2-yl)-N-[2-[2-(6-chlorohexoxy)ethoxy]ethyl]-4-oxobutanamide; HaloTag DBCO Ligand; SCHEMBL23511160;
目录号: V54510 纯度: ≥95%
Halo-DBCO 是一种含有二苯并环辛炔 (DBCO) 的点击化学试剂。
Halo-DBCO CAS号: 1808119-16-5
产品类别: ADC Linker
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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纯度/质量控制文件

纯度: =100%

产品描述
Halo-DBCO 是一种含有二苯并环辛炔 (DBCO) 的点击化学试剂。 Halo-DBCO 可用作配体与 HaloTag 反应形成共价 HaloTag 配体缀合物。
生物活性&实验参考方法
靶点
Click chemistry reagent
体外研究 (In Vitro)
生物正交反应,包括菌株促进叠氮-炔环加成反应(SPAAC)和反电子需求Diels-Alder反应(iEDDA),在活细胞成像应用中越来越受欢迎。然而,试剂的稳定性和反应性从未在活细胞的背景下系统地探索过。在这里,我们报告了一个通用的,基于HaloTag蛋白技术的细胞器靶向系统,该系统使用可点击的HaloTag配体在各种亚细胞区室中直接比较生物正交试剂的反应性,特异性和稳定性。该系统能够对活细胞中的生物正交反应进行详细的比较,并为活细胞成像研究的最佳试剂和条件的选择提供信息。我们发现sTCO与单取代四嗪的反应是细胞内最快的反应;然而,这两种试剂都有稳定性问题。为了解决这个问题,我们引入了sTCO的一种新变体Ag-sTCO,它的稳定性大大提高,可以直接在细胞中与四嗪进行快速的生物正交反应。利用构象应变的反式环烯的Ag配合物将大大扩大其用途,特别是当与反应性较低、更稳定的四嗪配对时。[1]
细胞实验
生物正交配体标记HaloTag融合蛋白及其在活细胞中SPAAC和edda反应的评价[1]
将表达HaloTag构建体的HeLa细胞置于6孔培养皿中,加入1 mL 10 μM HaloTag配体1 - 12,在37℃/5% CO2条件下培养0.5 h。标记为12的样品作为阳性对照,以确定每次实验中HaloTag蛋白标记的最大数量。细胞在DPBS中洗涤3次,在2 mL新培养基中孵育1小时,更换一次培养基以去除未结合的HaloTag配体。对于SPAAC反应,用氯烷配体1-3标记HeLa细胞,然后在生长培养基中进行50 nM至250 μM荧光团15-17的剂量反应2 h,或25 μM荧光团30 s至4 h的时间反应。用500 μM叠氮胺24、DBCO-amine 26(点击化学工具)或BCN-amine 25在PBS (SPAAC淬灭缓冲液)中洗涤细胞两次,立即淬灭反应。对于iEDDA,用氯烷烃配体2和4-11标记的HeLa细胞在生长培养基中以1 nM-20 μM荧光团13、14、17和18的剂量响应处理1小时,或以2 μM荧光团10 s-2小时的时间过程处理。细胞用100 μM的Tz-amine 27(点击化学工具)或TCO-amine 28在PBS (iEDDA淬灭缓冲液)中洗涤2次。细胞在1ml淬灭缓冲液中刮擦,在2000g下旋转3min,抽吸缓冲液,细胞微球立即在干冰上冷冻。
参考文献

[1]. Systematic Evaluation of Bioorthogonal Reactions in Live Cells with Clickable HaloTag Ligands: Implications for Intracellular Imaging. J Am Chem Soc. 2015 Sep 9;137(35):11461-75.

其他信息
总体而言,HaloTag模型系统提供了一种独特且无偏的方法,可直接在活体哺乳动物细胞及其不同亚细胞器内系统地评估生物正交标记策略。利用这种方法,研究人员能够快速评估各种生物正交基团,以实现快速、高效且选择性的SPAAC和iEDDA连接,从而应用于活细胞成像。虽然SPAAC反应总体速度较慢,但研究人员仍然能够确定使用TAMRA荧光染料对BCN和DBCO进行细胞内活细胞成像研究的条件。然而,在许多情况下,活细胞标记研究所需的高荧光染料浓度会因背景荧光积累而限制荧光染料的选择。出乎意料的是,研究人员发现,当DBCO 1与HaloTag蛋白偶联时,其SPAAC反应在活细胞的不同亚细胞器中几乎与使用反应较慢的亲二烯体TCO和BCN的iEDDA反应一样快。这种反应速率的提高使得可以使用浓度更低的荧光团-叠氮化物报告分子,并表明这种SPAAC反应可能适用于以DBCO为标记物的细胞内成像应用。当DBCO与报告分子连接时,研究人员观察到SPAAC反应所需的高浓度下存在广泛的背景标记,这限制了其在这些应用中的使用。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H35CLN2O4
分子量
511.06
精确质量
510.2285
元素分析
C, 68.16; H, 6.90; Cl, 6.94; N, 5.48; O, 12.52
CAS号
1808119-16-5
PubChem CID
156484476
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
3.8
tPSA
67.9Ų
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
15
重原子数目
36
分子复杂度/Complexity
733
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(NCCOCCOCCCCCCCl)CCC(N1C2=CC=CC=C2C#CC3=CC=CC=C3C1)=O
InChi Key
IPBMADSLMZUFQN-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H35ClN2O4/c30-17-7-1-2-8-19-35-21-22-36-20-18-31-28(33)15-16-29(34)32-23-26-11-4-3-9-24(26)13-14-25-10-5-6-12-27(25)32/h3-6,9-12H,1-2,7-8,15-23H2,(H,31,33)
化学名
4-(2-Azatricyclo[10.4.0.04,9]hexadeca-1(16),4,6,8,12,14-hexaen-10-yn-2-yl)-N-[2-[2-(6-chlorohexoxy)ethoxy]ethyl]-4-oxobutanamide
别名
Halo-DBCO; 1808119-16-5; 4-(2-azatricyclo[10.4.0.04,9]hexadeca-1(16),4,6,8,12,14-hexaen-10-yn-2-yl)-N-[2-[2-(6-chlorohexoxy)ethoxy]ethyl]-4-oxobutanamide; HaloTag DBCO Ligand; SCHEMBL23511160;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9567 mL 9.7836 mL 19.5672 mL
5 mM 0.3913 mL 1.9567 mL 3.9134 mL
10 mM 0.1957 mL 0.9784 mL 1.9567 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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