Prunasin

别名: Prunasin 野黑樱苷;野樱苷;野黑樱苷,Prunasin
目录号: V55119 纯度: ≥98%
Prunasin 是 DNA 聚合酶 β 的抑制剂(阻断剂/拮抗剂)。
Prunasin CAS号: 99-18-3
产品类别: DNA(RNA) Synthesis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
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产品描述
苦参苷是DNA聚合酶β的抑制剂(阻断剂/拮抗剂)。
苦参苷(CAS 99-18-3)是一种天然存在的氰苷。又名(R)-扁桃腈-β-D-葡萄糖苷,分子式为C14H17NO6,分子量为295.29 g/mol。苦参苷是DNA聚合酶β的抑制剂。它是一种口服有效的氰苷,也是苦杏仁苷的主要代谢产物。苦参苷能特异性抑制大鼠DNA聚合酶β,IC50值为98 μM。它存在于黑樱桃(Prunus serotina)的果核中。
生物活性&实验参考方法
靶点
Prunasin targets DNA polymerase β. DNA polymerase β is a key enzyme involved in DNA repair, particularly base excision repair. By inhibiting DNA polymerase β, Prunasin interferes with DNA repair processes. The compound is an orally active cyanogenic glucoside and the main metabolite of Amygdalin. It can specifically inhibit rat DNA polymerase β with an IC50 of 98 μM.
体外研究 (In Vitro)
在无细胞生化体系中,普鲁那辛对DNA聚合酶β的抑制IC50值为98 μM。该活性表明该化合物可直接抑制DNA聚合酶β的酶活性。该化合物抑制DNA修复的能力使其成为研究DNA修复机制和增强癌细胞对DNA损伤剂敏感性的潜在工具。
体内研究 (In Vivo)
在基于细胞的实验中,普鲁那辛抑制DNA聚合酶β的活性,导致DNA修复受损。通过评估DNA损伤后的细胞修复能力和细胞活力,可以评价该化合物在细胞系中的作用。作为一种氰苷,普鲁那辛还能释放氰化氢,这可能与其生物学效应有关。本研究还评估了该化合物对DNA修复和细胞存活的影响。
酶活实验
用于检测DNA聚合酶β抑制的无细胞分析方法是在化合物存在下测量纯化的DNA聚合酶β的聚合酶活性。该分析方法使用DNA模板、dNTP(包括标记的dNTP)以及不同浓度的化合物。通过测量标记核苷酸掺入DNA的量来确定IC50值为98 μM。
细胞实验
普鲁那辛的细胞活性检测包括培养细胞,并用浓度范围为 0.1 至 1000 μM 的化合物处理细胞。通过测量基因毒性物质诱导的 DNA 损伤的修复情况来评估该化合物对 DNA 修复的影响。细胞活力采用 MTT 或 CCK-8 法进行评估。此外,还评估了该化合物对细胞周期进程和细胞凋亡的影响。
动物实验
目前尚无针对普鲁那辛的成熟动物实验方案。作为一种DNA聚合酶β抑制剂和氰苷,该化合物可能在动物模型中用于评估其对DNA修复和癌症的影响。典型的研究方法是给小鼠口服该化合物,并评估其DNA修复能力、毒性和疗效。由于该化合物具有氰苷活性,因此需要密切监测其毒性。
药代性质 (ADME/PK)
代谢/代谢物
有机腈在肝脏中经细胞色素P450酶转化为氰离子。氰离子被迅速吸收并分布于全身。氰离子主要经硫氰酸氧化酶或3-巯基丙酮酸硫转移酶代谢为硫氰酸。氰化物代谢物经尿液排出。(L96)
普鲁那新是一种口服活性化合物。由于其分子量为295.29 g/mol,预计其口服生物利用度和组织渗透性中等。该化合物是一种氰苷,可释放氰化氢,这可能会影响其药代动力学和毒性。需要进一步的药代动力学研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
毒性概述
有机腈在体内和体外均可分解为氰离子。因此,有机腈的主要毒性机制是产生有毒的氰离子,即氰化氢。氰离子是第四电子传递链复合物(位于真核细胞线粒体膜上)中细胞色素c氧化酶的抑制剂。它与该酶中的铁原子形成复合物。氰离子与该细胞色素的结合阻止了电子从细胞色素c氧化酶传递到氧气。结果,电子传递链被破坏,细胞无法进行有氧呼吸以产生ATP供能。主要依赖有氧呼吸的组织,例如中枢神经系统和心脏,尤其容易受到这种影响。氰化物还能与过氧化氢酶、谷胱甘肽过氧化物酶、高铁血红蛋白、氢钴胺素、磷酸酶、酪氨酸酶、抗坏血酸氧化酶、黄嘌呤氧化酶、琥珀酸脱氢酶和铜/锌超氧化物歧化酶结合,从而产生毒性作用。氰化物与高铁血红蛋白中的铁离子结合,形成无活性的高铁血红蛋白氰化物。(L97)
苦参苷是一种生氰糖苷,可释放有毒化合物氰化氢。该化合物的毒性主要与其生氰能力有关。处理该化合物时应遵守标准的实验室安全预防措施。该化合物被列为运输危险品。需要进行毒性研究以确定其安全性。
参考文献

[1]. The cyanogenic glucoside, prunasin (D-mandelonitrile-beta-D-glucoside), is a novel inhibitor of DNA polymerase beta. J Biochem. 1999;126(2):430-436.

其他信息
(R)-苦参苷是一种苦参苷。据报道,它存在于山茶(Camellia sinensis)、栎叶维斯康塞利亚(Vasconcellea quercifolia)以及其他具有相关数据的生物体中。苦参苷也存在于杏仁中。苦参苷可以从李子仁、西番莲的未成熟果实以及紫苏(Perilla frutescens var. acuta)的叶片中分离得到。苦参苷属于O-糖苷类化合物。这类化合物是糖苷,其中一个糖基通过碳原子以O-糖苷键与另一个糖基相连。
苦参苷是一种用于DNA修复和癌症研究的研究级天然产物。它并非已获批准的药物,也没有临床试验历史。该化合物是一种天然存在的氰苷,也是DNA聚合酶β的抑制剂。它是苦杏仁苷的主要代谢产物。本产品仅供研究用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C14H17NO6
分子量
295.29
精确质量
295.105
CAS号
99-18-3
PubChem CID
119033
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.5±0.1 g/cm3
沸点
527.0±50.0 °C at 760 mmHg
熔点
138-148ºC
闪点
272.5±30.1 °C
蒸汽压
0.0±1.5 mmHg at 25°C
折射率
1.621
LogP
-0.92
tPSA
123.17
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
21
分子复杂度/Complexity
377
定义原子立体中心数目
6
SMILES
C1=CC=C(C=C1)[C@H](C#N)O[C@H]2[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O)O
InChi Key
ZKSZEJFBGODIJW-GMDXDWKASA-N
InChi Code
InChI=1S/C14H17NO6/c15-6-9(8-4-2-1-3-5-8)20-14-13(19)12(18)11(17)10(7-16)21-14/h1-5,9-14,16-19H,7H2/t9-,10+,11+,12-,13+,14+/m0/s1
化学名
(2R)-2-phenyl-2-[(2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyacetonitrile
别名
Prunasin
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O : ≥ 50 mg/mL (~169.33 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.3865 mL 16.9325 mL 33.8650 mL
5 mM 0.6773 mL 3.3865 mL 6.7730 mL
10 mM 0.3387 mL 1.6933 mL 3.3865 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们