| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| 250mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
SARS-CoV PLpro
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| 体外研究 (In Vitro) |
中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)属于β冠状病毒属,可导致严重的呼吸系统疾病,并伴有肺炎、多器官衰竭,最终死亡。冠状病毒有能力跨越物种屏障,迅速传播到新的宿主物种中,人与人之间的传播会导致流行病。尽管MERS-CoV对公众健康构成严重威胁,但目前还没有疫苗或药物可用于治疗。MERS-CoV木瓜蛋白酶样蛋白酶(PLpro)是一种在其复制中起重要作用的关键酶。在本研究中,我们通过蛋白酶抑制试验评估了阿霉素(DOX)对重组MERS-CoV-PLpro的抑制活性。在DOX存在下,Z-RLRGG-AMC–肽键的荧光肽水解在30分钟时显示出1.67μM的IC50值。随后,我们通过热位移分析(TSA)证实了DOX和MERS-CoV-PLpro之间的相互作用,DOX将ΔTm增加了约20°C,清楚地表明了MERS-CoV PL蛋白酶和DOX之间的相干相互作用。使用对接技术和分子动力学(MD)模拟评估了DOX在MERS-CoV-PLpro上的结合位点。DOX结合到MERS-CoV-PLpro的催化结构域的拇指区域。MD模拟结果显示了灵活的BL2环,以及其他潜在的残基,如MERS-CoV-PLpro的R231、R233和G276。药物再利用的发展是一个显著的机会,可以快速检查治疗各种疾病的不同方面的疗效。迄今为止,蛋白酶抑制剂已被发现对MERS-CoV有效,许多候选药物目前正在进行临床试验以证明这一点。我们的努力遵循着类似的方向[1]。
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| 酶活实验 |
MERS-CoV-PLpro抑制试验[1]
使用基于平板的平底黑色测试384测定不同浓度和持续时间的DOX的IC50值。简言之,水解的荧光肽Z-Arg-Leu-Arg-Gly-Gly肽键7-氨基-甲基香豆素(Z-RLRGG-AMC)显著增加了AMC部分的荧光,使转化率能够准确测量。反应在50µL的总体积中进行,其中包含以下成分:20 mM Tris缓冲液,pH 8.0,30µM Z-RLRGG-AMC和不同浓度的抑制剂(DOX)(1.84 pM–183.98µM)。通过添加PLpro开始测定以产生60nM的最终酶浓度。轻轻摇动平板30秒,在Biotek HT微孔板读取器上记录肽释放AMC的荧光60分钟(γ激发=360nm;γ发射=460 nm,增益=40),IC50值通过Graphpad Prism中的剂量-反应抑制函数计算,具有抑制剂与归一化反应方程。这个实验重复了三次。阳性对照孔,代表100%的抑制作用,包括10μg/mL DOX;阴性对照孔显示零抑制,包括仅含有缓冲液的载体。 热位移测定法(TSA)[1] 阿霉素与MERS-CoV-PLpro蛋白的结合是通过使用Applied Biosystems™PCR机的差示扫描荧光法(DSF)估计的,如前所述。我们还测试了阿昔洛韦(已知的抗病毒药物)作为DOX对MERS-CoV-PLpro的可能相互作用。简言之,使用反应缓冲液作为对照,将MERS-CoV-PLpro蛋白稀释至最终浓度为2 mol/L,然后在25°C下用0.29–18.4μM DOX处理30分钟。使用SYPRO橙,在25°C和95°C之间使用1°C/分钟的温度梯度来记录荧光。熔融温度(Tm)是用TSA CRAFT软件确定的,该软件稳健且对噪声不太敏感(Lee等人,2019)。TSA-CRAFT,通过Boltzmann方程实现曲线拟合以确定熔融温度(Tm)。 |
| 细胞实验 |
SDS-PAGE[1]
使用BioRad Mini蛋白质的SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳:将蛋白质样品与总体积为20μL的含有2X莱姆利缓冲液的缓冲液混合。样品在95°C的水浴中加热5分钟,并立即在冰中冷却,然后在SDS-PAGE上最初在60V下电泳,蛋白质通过堆叠凝胶后在100V下运行。电泳后,用考马斯蓝染色溶液对凝胶进行染色,并在温和搅拌下用50%H2O、10%乙酸和40%甲醇的去染色溶液进行去染色。使用Gel Doc系统拍摄和裁剪SDS-PAGE凝胶的照片,并在没有任何颜色或对比度校正的情况下在Microsoft PowerPoint中发布。 Western印迹[1] 对单克隆His抗体进行蛋白质印迹,以确认N-末端6xHis-Tag的存在,如前所述。将通过超声分离的全细胞蛋白(10μL)与2X莱姆利染料混合,并在10%SDS−聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳,然后使用transblot turbo机器将其转移到硝化纤维素膜上,然后在室温下在Every Blot Blocking Buffer中封闭10分钟。用TBST缓冲液每隔5分钟洗涤膜5次,然后与一次poly-His抗体一起孵育过夜(4°C)。在用TBST以5分钟间隔连续洗涤5次后,在室温下与第二抗体孵育2小时后,用TBST漂洗膜5次,每次5分钟。使用Luminata™西方化学发光马萝卜过氧化物酶底物扫描条带,然后使用Gel Doc系统。 |
| 参考文献 |
| 分子式 |
C40H56N12O9
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|---|---|
| 分子量 |
848.947648048401
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| 精确质量 |
848.429
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| CAS号 |
167698-69-3
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| PubChem CID |
156612994
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| 外观&性状 |
Typically exists as solid at room temperature
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| 密度 |
1.4±0.1 g/cm3
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| 沸点 |
1056.1±75.0 °C at 760 mmHg
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| 闪点 |
592.5±37.1 °C
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| 蒸汽压 |
0.0±0.3 mmHg at 25°C
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| 折射率 |
1.646
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| LogP |
4.91
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| tPSA |
339Ų
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| 氢键供体(HBD)数目 |
10
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| 氢键受体(HBA)数目 |
11
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| 可旋转键数目(RBC) |
24
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| 重原子数目 |
61
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| 分子复杂度/Complexity |
1610
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
O=C([C@H](CC(C)C)NC([C@H](CCC/N=C(\N)/N)NC(=O)OCC1C=CC=CC=1)=O)N[C@H](C(NCC(NCC(NC1C=CC2C(C)=CC(=O)OC=2C=1)=O)=O)=O)CCC/N=C(\N)/N
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| InChi Key |
BOVMHLIAYDDKAY-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C40H56N12O9/c1-23(2)17-30(51-36(57)29(12-8-16-46-39(43)44)52-40(59)60-22-25-9-5-4-6-10-25)37(58)50-28(11-7-15-45-38(41)42)35(56)48-20-32(53)47-21-33(54)49-26-13-14-27-24(3)18-34(55)61-31(27)19-26/h4-6,9-10,13-14,18-19,23,28-30H,7-8,11-12,15-17,20-22H2,1-3H3,(H,47,53)(H,48,56)(H,49,54)(H,50,58)(H,51,57)(H,52,59)(H4,41,42,45)(H4,43,44,46)
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| 化学名 |
benzyl N-[5-(diaminomethylideneamino)-1-[[1-[[5-(diaminomethylideneamino)-1-[[2-[[2-[(4-methyl-2-oxochromen-7-yl)amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]amino]-1-oxopentan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-1-oxopentan-2-yl]carbamate
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.1779 mL | 5.8896 mL | 11.7793 mL | |
| 5 mM | 0.2356 mL | 1.1779 mL | 2.3559 mL | |
| 10 mM | 0.1178 mL | 0.5890 mL | 1.1779 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。