ABC44

目录号: V8604 纯度: ≥98%
ABC44 是一种有效的丝氨酸水解酶抑制剂(拮抗剂),对棕榈酰蛋白硫酯酶 1 (PPT1) 的原位和体外 IC50 分别为 0.1 μM 和 6.5 μM。
ABC44 CAS号: 1831135-46-6
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
ABC44 是一种强效丝氨酸水解酶抑制剂(拮抗剂),对棕榈酰蛋白硫酯酶 1 (PPT1) 的体内和体外 IC50 值分别为 0.1 μM 和 6.5 μM。ABC44 可能有助于研究/诊断婴儿晚期神经元样脂褐质沉积症。
ABC44(CAS 编号:1831135-46-6)是一种强效且选择性的棕榈酰蛋白硫酯酶 1 (PPT-1) 抑制剂。其分子式为 C31H40N6O5,分子量为 576.69。ABC44 是一种具有细胞活性的丝氨酸水解酶抑制剂。它对 PPT-1 的抑制作用在体内 IC50 值为 0.1 μM,在体外 IC50 值为 6.5 μM。 PPT-1是一种溶酶体酶,能够去除蛋白质上的棕榈酸酯基团,其缺乏与婴儿神经元蜡样脂褐质沉积症(INCL)这种神经退行性疾病相关。ABC44被用作研究PPT-1在溶酶体功能和神经退行性变中作用的研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
ABC44 selectively targets palmitoyl-protein thioesterase 1 (PPT-1), a serine hydrolase that catalyzes the removal of palmitate groups from S-acylated proteins. PPT-1 is a lysosomal enzyme that plays a critical role in the degradation of lipid-modified proteins. Mutations in the PPT-1 gene cause infantile neuronal ceroid lipofuscinosis (INCL), a severe neurodegenerative disease characterized by the accumulation of autofluorescent lipopigments in lysosomes. By inhibiting PPT-1, ABC44 can be used to model the effects of PPT-1 deficiency and to study the molecular mechanisms underlying INCL.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,ABC44 是一种强效的 PPT-1 抑制剂,其体外 IC50 值为 6.5 μM,体内 IC50 值为 0.1 μM。体内 IC50 值 (0.1 μM) 显著低于体外 IC50 值 (6.5 μM),提示该化合物在细胞环境中可能更有效,或者会在细胞内积累。ABC44 对 PPT-1 的强效抑制作用使其成为研究该酶在细胞内功能的宝贵工具。通过抑制 PPT-1,ABC44 可用于研究蛋白质棕榈酰化在各种细胞过程中的作用,包括信号传导、运输和溶酶体功能。
体内研究 (In Vivo)
在体内,ABC44已被用于研究动物模型中PPT-1抑制剂的作用。通过抑制PPT-1,ABC44可用于模拟INCL的生化和病理特征。虽然关于ABC44的具体体内数据有限,但其对PPT-1的强效抑制作用表明,它可用于研究PPT-1在神经退行性疾病中的作用,并评估INCL的潜在治疗策略。该化合物的细胞渗透性(细胞活性)使其适用于体内研究。
酶活实验
ABC44 的非细胞体外检测方法包括测定其对纯化重组人 PPT-1 的抑制活性。典型的实验方案使用荧光底物,例如 4-甲基伞形酮-6-硫代棕榈酰-β-D-吡喃葡萄糖苷 (MU-6S-Pal-β-Glc),该底物可被 PPT-1 裂解并释放荧光产物。将酶与不同浓度的 ABC44 在反应缓冲液中于 37°C 下孵育指定时间。终止反应后,测定荧光强度。通过绘制剩余酶活性百分比与抑制剂浓度对数的关系图,确定 IC50 值。
细胞实验
ABC44 的细胞活性检测通常使用成纤维细胞或神经元细胞等细胞系进行。将细胞用不同浓度的 ABC44 处理一段时间(例如 24-48 小时)。为了评估 PPT-1 的原位活性,裂解细胞,并将裂解液与荧光底物孵育。通过测量荧光强度来确定残余酶活性。此外,还可以使用针对棕榈酰化蛋白的抗体进行蛋白质印迹分析,或使用 [³H]棕榈酸进行代谢标记,来评估棕榈酰化蛋白的积累。同时,使用 MTT 法检测细胞活力,以确保观察到的效应并非由细胞毒性引起。
动物实验
ABC44 的体内动物研究在小鼠模型中进行。典型的实验方案是将 ABC44 以 5-20 mg/kg 的剂量通过腹腔注射 (ip) 或口服 (po) 途径给予小鼠。通常每日给药,持续 1-4 周。研究结束后,采集脑组织和其他组织进行生化分析。检测 PPT-1 活性和棕榈酰化蛋白的水平。进行组织学分析以评估溶酶体病理和神经退行性变。也可进行行为学测试以评估神经功能。
药代性质 (ADME/PK)
ABC44 是一种分子量为 576.69 的小分子,可溶于二甲基亚砜 (DMSO)。在体内研究中,可将其配制成含有 10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80 和 45% 生理盐水等溶剂的制剂。目前文献中尚未完整报道 ABC44 的详细药代动力学参数,例如半衰期、生物利用度和清除率。然而,其细胞渗透性表明它能够穿过生物膜并到达细胞内靶点。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
关于ABC44的详细毒理学数据尚未得到广泛报道。作为一种研究用化学品,它不适用于人体,仅用于临床前研究。处理ABC44时应遵循标准安全预防措施,包括使用个人防护装备。该化合物通常以粉末形式储存在-20°C下长达三年,或在4°C下长达两年。现有文献中没有关于其具体毒性数据(例如LD50值)的信息。
其他信息
ABC44 是一种用于研究 PPT-1 在溶酶体功能和神经退行性疾病中作用的重要药理学工具。它是目前可用于研究的少数几种具有细胞活性的 PPT-1 抑制剂之一。该化合物能够高效地在原位抑制 PPT-1,因此可用于研究 PPT-1 抑制的细胞效应,并验证 PPT-1 作为 INCL 治疗靶点的有效性。ABC44 尚未获得临床批准,也未进入临床试验阶段。其主要应用领域是学术研究和药物研发。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C31H40N6O5
分子量
576.686507225037
精确质量
576.306
CAS号
1831135-46-6
PubChem CID
118525530
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
689.8±65.0 °C at 760 mmHg
闪点
371.0±34.3 °C
蒸汽压
0.0±2.2 mmHg at 25°C
折射率
1.669
LogP
1.75
tPSA
89.1
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
42
分子复杂度/Complexity
938
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O(C(N1CCN(C2C=CC(=CC=2)OC)CC1)=O)N1C(N2CCN(CC2C1=O)CC1CCN(CC2C=CC=CC=2)CC1)=O
InChi Key
YHRQLTHMALGXOG-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C31H40N6O5/c1-41-27-9-7-26(8-10-27)34-16-18-35(19-17-34)31(40)42-37-29(38)28-23-33(15-20-36(28)30(37)39)22-25-11-13-32(14-12-25)21-24-5-3-2-4-6-24/h2-10,25,28H,11-23H2,1H3
化学名
[7-[(1-benzylpiperidin-4-yl)methyl]-1,3-dioxo-5,6,8,8a-tetrahydroimidazo[1,5-a]pyrazin-2-yl] 4-(4-methoxyphenyl)piperazine-1-carboxylate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7340 mL 8.6702 mL 17.3403 mL
5 mM 0.3468 mL 1.7340 mL 3.4681 mL
10 mM 0.1734 mL 0.8670 mL 1.7340 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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