| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Ac-IEPD-AFC is a fluorescent substrate, with its target being granzyme B[1]
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| 体外研究 (In Vitro) |
在颗粒酶 B 测定缓冲液中,人颗粒酶 B 对 Ac-IEPD-AFC 的 Km 为 585 μM [1]。
1. 作为人颗粒酶B的底物,用于检测SRP-2对人颗粒酶B的抑制活性,通过测量底物水解产生的荧光强度反映酶活性,其激发/发射光谱分别为390 nm/510 nm[1] 2. 在SRP-2与人颗粒酶B的相互作用实验中,使用终浓度10 μM的Ac-IEPD-AFC检测结合化学计量学,终浓度50 μM用于假一级反应条件下的酶动力学分析,终浓度100 μM用于二级速率常数计算[1] 3. 用于标准化人颗粒酶B的浓度,以Ac-IEPD-pNA或Ac-IEPD-AFC为底物,基于1:1化学计量关系,通过活性位点滴定法确定颗粒酶B的活性浓度[1] |
| 酶活实验 |
1. 酶抑制活性检测:在颗粒酶B检测缓冲液(50 mM Tris,pH 7.4,100 mM NaCl,0.01% Tween 20)中,混合酶(如人颗粒酶B)与抑制剂(如SRP-2),25℃孵育15分钟后,加入Ac-IEPD-AFC至指定终浓度,用酶标仪持续检测荧光强度变化(激发390 nm/发射510 nm),通过水解速率计算残留酶活性,抑制率=100×(1-抑制组酶反应速率/未抑制组酶反应速率)[1]
2. 结合化学计量学检测:在96孔板中,将25 nM人颗粒酶B与0-50 nM SRP-2在颗粒酶B检测缓冲液中25℃孵育15分钟,加入Ac-IEPD-AFC至终浓度10 μM,检测底物水解速率,以 fractional activity(抑制组速率/未抑制组速率)对抑制剂与酶初始浓度比([I]₀/[E]₀)作图,通过线性回归分析得出抑制化学计量比(SI)[1] 3. 酶动力学分析:在假一级反应条件下,固定25 nM人颗粒酶B浓度,加入0-800 nM SRP-2和终浓度100 μM的Ac-IEPD-AFC,持续检测荧光强度变化,通过非线性回归拟合数据计算一级速率常数(kₒᵦₛ),以kₒᵦₛ对抑制剂浓度作图,斜率即为二级速率常数(k'),结合底物Km值(人颗粒酶B对Ac-IEPD-AFC的Km为585 μM)校正得到二级速率常数(kₐ)[1] |
| 参考文献 |
[1]. Pak SC, et al. SRP-2 is a cross-class inhibitor that participates in postembryonic development of the nematode Caenorhabditis elegans: initial characterization of the clade L serpins. J Biol Chem. 2004 Apr 9;279(15):15448-59.
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| 其他信息 |
1. Ac-IEPD-AFC,全称为乙酰基-Ile-Glu-Pro-Asp-7-氨基-4-三氟甲基香豆素,是一种常用的荧光底物,用于检测凋亡相关丝氨酸蛋白酶(例如颗粒酶B)的活性[1]。2. 该底物被靶酶水解后,会释放荧光基团AFC。荧光强度的变化可以定量反映酶的活性水平,因此被广泛用于蛋白酶抑制剂的筛选和表征[1]。
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| 分子式 |
C32H38F3N5O11
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|---|---|
| 分子量 |
725.666239261627
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| 精确质量 |
725.252
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| CAS号 |
1135417-31-0
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| PubChem CID |
44135102
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| 密度 |
1.4±0.1 g/cm3
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| 沸点 |
1073.9±65.0 °C at 760 mmHg
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| 闪点 |
603.3±34.3 °C
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| 蒸汽压 |
0.0±0.3 mmHg at 25°C
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| 折射率 |
1.575
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| LogP |
2.49
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| tPSA |
238
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| 氢键供体(HBD)数目 |
6
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| 氢键受体(HBA)数目 |
14
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| 可旋转键数目(RBC) |
15
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| 重原子数目 |
51
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| 分子复杂度/Complexity |
1420
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
FC(C1=CC(=O)OC2C1=CC=C(C=2)NC([C@H](CC(=O)O)NC([C@H]1CCCN1C([C@H](CCC(=O)O)NC([C@H]([C@H](C)CC)NC(C)=O)=O)=O)=O)=O)(F)F
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| InChi Key |
HWXKKVLJPWMVLL-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C32H38F3N5O11/c1-4-15(2)27(36-16(3)41)30(49)38-20(9-10-24(42)43)31(50)40-11-5-6-22(40)29(48)39-21(14-25(44)45)28(47)37-17-7-8-18-19(32(33,34)35)13-26(46)51-23(18)12-17/h7-8,12-13,15,20-22,27H,4-6,9-11,14H2,1-3H3,(H,36,41)(H,37,47)(H,38,49)(H,39,48)(H,42,43)(H,44,45)
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| 化学名 |
4-[(2-acetamido-3-methylpentanoyl)amino]-5-[2-[[3-carboxy-1-oxo-1-[[2-oxo-4-(trifluoromethyl)chromen-7-yl]amino]propan-2-yl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-5-oxopentanoic acid
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.3780 mL | 6.8902 mL | 13.7804 mL | |
| 5 mM | 0.2756 mL | 1.3780 mL | 2.7561 mL | |
| 10 mM | 0.1378 mL | 0.6890 mL | 1.3780 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。