AMCA-X SE

目录号: V46021 纯度: ≥98%
AMCA-X-SE 是一种香豆素类似物,可产生固定的蓝色荧光。
AMCA-X SE CAS号: 216309-02-3
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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1mg
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产品描述
AMCA-X-SE 是一种香豆素类似物,可产生固定的蓝色荧光。NHS 活化酯可与伯胺基团形成稳定的酰胺键,用于标记肽、蛋白质和寡核苷酸的氨基。属于活性染料。激发和发射最大值(波长):354/442 nm。
AMCA-X SE(AMCA-X琥珀酰亚胺酯,CAS 216309-02-3)是一种胺反应性、紫外激发蓝色荧光染料。其NHS活化酯与伯胺基团形成稳定的酰胺键,用于标记肽、蛋白质和寡核苷酸。
生物活性&实验参考方法
靶点
AMCA-X SE targets primary amine groups (-NH2) on biomolecules, including the N-terminus and lysine side chains of proteins/peptides, and amine-modified nucleotides. It does not target biological receptors but is a chemical labeling reagent.
体外研究 (In Vitro)
制备储备液的最佳方法:1. 蛋白质制备:为获得理想的标记效果,添加 2 mg/mL 的蛋白质(抗体)。蛋白质溶液的理想 pH 值为 8.5±0.5。如果 pH 值低于 8.0,则使用 1 M 的蛋白质溶液。2) 蛋白质浓度低于 2 mg/mL 会导致标记效率显著降低。建议使用 2–10 mg/mL 的最终蛋白质浓度范围以获得最高的标记效率。3) 必须存在明显的蛋白质。制备染料时,在 AMCA-X-SE 小瓶中加入无水二甲基亚胺,配制成 10 mM 的储备液。3. 对于染料涂层制备过程,AMCA-X-SE 与化妆品的理想摩尔比约为 10,具体比例取决于待标记化妆品的数量。例如:如果所需的标记蛋白为 500 μL 浓度为 2 mg/mL 的 IgG(分子量=150,000),则将含有 1 mg AMCA-X-SE 的试管溶解于 100 μL DMSO 中。AMCA-X-SE 需要 3 μL 的量。精确的计算步骤如下:1) mmol (IgG) = mg/mL (IgG)×mL (IgG) / MW (IgG) = 2 mg/mL×0.5 mL / 150,000 mg/mmol = 6.7×10⁻⁶ mmol 2) mmol (AMCA-X-SE) = 毫摩尔 (IgG)×10 = 6.7×10⁻⁶ mmol×10 = 6.7×10⁻⁵ mmol 3) μL (AMCA-X-SE) = 毫摩尔 (AMCA-X-SE)×MW (AMCA-X-SE) / mg/μL (AMCA-X-SE) = 6.7×10⁻⁵ mmol×443 mg/mmol / 0.01 mg/μL = 3 μL (AMCA-X-SE) 使用说明 1. 标记反应 1:将计算好的新鲜配制的 10 mg/mL AMCA-X-SE 溶液逐渐加入到反应体系中将蛋白质样品溶液以 0.5 mL 的增量分次加入,轻轻摇晃混匀,然后快速离心,使样品沉淀在试管底部。2) 不要混合染色液。将反应管置于黑暗环境中。在初始条件下轻轻摇晃试剂 60 分钟。每隔 10 到 15 分钟轻轻旋转反应管数次,直至达到完全混合。2. 蛋白质封闭脱盐偶联:以下偶联过程以使用 Sephadex G-25 柱封闭染料偶联物为例。1) 按照制造商的说明制备 Sephadex G-25 柱。2) 将反应混合物加至 Sephadex G-25 柱的顶部。3) 当样品低于顶部树脂表面时,立即加入 PBS(pH 7.2–7.4)。4) 为完成柱收缩,向所需样品中加入额外的 PBS(pH 7.2–7.4)。将包含所选蛋白质-染料组合的成分混合。注意事项:1. 光照和湿度会影响 AMCA-X-SE 的标记效果。请立即配制 AMCA-X-SE 溶液,并丢弃任何剩余溶液。2. 20-50% 的甘油会降低标记效率,但低浓度的折叠钠(≤3 mM 或 0.02%)或硫柳汞(≤0.02 mM 或 0.01%)不会明显干扰蛋白质标记。3. 使用含有铵离子或伯胺(例如 Tris 或甘氨酸)的缓冲液,因为这些物质会与需要标记的蛋白质竞争。4. 本产品不适用于临床诊断或治疗;仅供专业科学研究使用。5. 为了您自身的健康和安全,请在操作过程中穿戴实验服和一次性手套。
在无细胞标记反应中,AMCA-X SE(琥珀酰亚胺酯)在 pH 8.0-9.0(最佳 pH 值约为 8.5)条件下与伯脂肪胺特异性反应,形成稳定的共价酰胺键。该染料具有高荧光量子产率,在紫外光激发下发出明亮的蓝色荧光。未反应的染料可通过尺寸排阻色谱或透析去除。
体内研究 (In Vivo)
AMCA-X SE 不用于体内活性测定。它的用途在于对纯化的蛋白质、抗体、肽或寡核苷酸进行体外标记,以便随后用于免疫测定、荧光显微镜、流式细胞术和其他检测方法。
酶活实验
标记反应在使用前立即进行,方法是将 AMCA-X SE 溶解于无水 DMF 或 DMSO 中(10 mg/mL)。蛋白质溶液(2 mg/mL)用 0.1 M 碳酸氢钠缓冲液(pH 8.5 +/- 0.5)配制。将染料以 10:1 的摩尔比(染料:蛋白质)分次少量加入蛋白质溶液中,并轻轻搅拌。反应在室温下避光进行 1-2 小时,并轻微搅拌。未结合的染料可通过透析或尺寸排阻色谱法去除。
细胞实验
由于该染料用于体外预标记纯化的生物分子,因此活细胞检测的标记方案不适用。对于抗体标记,将纯化的IgG(2 mg/mL,溶于PBS)用0.1 M碳酸氢盐缓冲液调节至pH 8.5。以10:1的摩尔比(染料:蛋白)分0.5 mL的增量加入AMCA-X SE(10 mg/mL,溶于DMSO),并轻轻混匀。在室温下避光孵育1-2小时后,通过PBS透析或尺寸排阻色谱法纯化标记的抗体,以去除游离染料。
动物实验
AMCA-X SE 不用于活体动物的体内研究。然而,标记的生物分子(例如,AMCA 标记的抗体或肽)可用于某些实验条件下的离体组织染色或体内成像。对于离体组织染色,将石蜡包埋或冷冻的组织切片与浓度为 4-10 μg/mL 的 AMCA 标记抗体在室温下孵育 1-2 小时,然后洗涤并用不含 DAPI 的封片剂封片。
药代性质 (ADME/PK)
AMCA-X SE 是一种标记试剂,并非具有 ADME 特性的候选药物。该染料以固体粉末形式供应。在 -20℃ 避光防潮条件下储存可保持稳定。储备液用无水 DMF 或 DMSO 配制,浓度为 10 mg/mL,应立即使用。标记的缀合物在 4℃ 或 -20℃ 避光保存下可稳定数月至数年,具体稳定性取决于生物分子。激发/发射波长最大值:~350/450 nm。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于AMCA-X SE是一种用于体外应用而非体内应用的化学标记试剂,因此未记录其毒性数据。应遵循标准实验室安全预防措施:避免吸入、摄入和皮肤接触;使用个人防护装备;处理粉末或储备液时应在通风橱内进行;避光保存。根据机构指南处置废弃物。
参考文献

[1]. Surface modification of the polyethyleneimine layer on silicone oxide film via UV radiation. Applied surface science, 2009, 255(12): 6103-6106.

其他信息
本品为仅供研究使用的荧光染料,并非已获批准的药品。它是一种香豆素衍生物,其核心结构为7-氨基-4-甲基香豆素,通过间隔基(X = 氨基己酸)与琥珀酰亚胺酯连接。AMCA-X SE广泛用于免疫荧光、流式细胞术和蛋白质印迹法中抗体的标记。分子式:C22H25N3O7;分子量:443.46;纯度:≥95%。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H25N3O7
分子量
443.4498
精确质量
429.19
CAS号
216309-02-3
PubChem CID
59866294
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
3.342
tPSA
135.43
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
10
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
806
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC1=C(C(=O)OC2=C1C=CC(=C2)N)CC(=O)NCCCCCC(=O)ON3C(=O)CCC3=O
InChi Key
QYSJBOMZRLAPJR-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H25N3O7/c1-13-15-7-6-14(23)11-17(15)31-22(30)16(13)12-18(26)24-10-4-2-3-5-21(29)32-25-19(27)8-9-20(25)28/h6-7,11H,2-5,8-10,12,23H2,1H3,(H,24,26)
化学名
(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 6-[[2-(7-amino-4-methyl-2-oxochromen-3-yl)acetyl]amino]hexanoate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2550 mL 11.2752 mL 22.5505 mL
5 mM 0.4510 mL 2.2550 mL 4.5101 mL
10 mM 0.2255 mL 1.1275 mL 2.2550 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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