Amino-PEG3-t-butyl ester

别名: 12-氨基-4,7,10-三氧杂十二烷酸叔丁酯; 氨基三聚乙二醇缬氨酸叔丁酯; 3-[2-(2-(2-氨基乙氧基)乙氧基)乙氧基]丙酸叔丁酯;3-[2-[2-(2-氨基乙氧基)乙氧基]乙氧基]丙酸叔丁酯
目录号: V11108 纯度: ≥98%
氨基-PEG3-叔丁基酯是一种 PEG 类似物,含有氨基和叔丁基保护的羧基。
Amino-PEG3-t-butyl ester CAS号: 252881-74-6
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
氨基-PEG3-叔丁酯是一种PEG类似物,其氨基被叔丁基保护的羧基所取代。氨基可与羧酸、活化的NHS酯、羰基化合物(酮、醛)等反应。叔丁基保护的羧基可在酸性条件下脱保护。PEG连接子可用于抗体药物偶联物的开发。参考文献:Pignatello R, Impallomeni G, Pistarà V, Cupri S, Graziano AC, Cardile V, Ballistreri A. New amphiphilic derivatives of poly(ethylene glycol) (PEG) as surface modifiers of colloidal drug carriers. III. Lipoamino acid conjugates with carboxy- and amino-PEG(5000) polymers. Mater Sci Eng C Mater Biol Appl. 2015 Jan;46:470-81. doi: 10.1016/j.msec.2014.10.054. 2014年10月23日在线发表。PubMed PMID: 25492012。
氨基-PEG3-叔丁酯(CAS号:252881-74-6)是一种聚乙二醇(PEG)基连接剂,含有氨基和叔丁基保护的羧酸(酯)基团。其亲水性PEG间隔基可提高其在水性介质中的溶解度。氨基可与羧酸、活化的NHS酯和羰基反应,而叔丁酯基团则作为保护的羧酸,可在酸性条件下脱保护,从而释放出游离的羧酸基团,用于进一步偶联。氨基-PEG3-叔丁酯属于PROTAC连接剂的PEG类,可用于制备PROTAC蛋白降解剂。
生物活性&实验参考方法
靶点
As a chemical linker, Amino-PEG3-t-butyl ester itself does not have a biological target. Its utility lies in its ability to serve as a hydrophilic, flexible spacer in the synthesis of bifunctional molecules such as PROTACs. In PROTAC design, one ligand binds to the target protein and another ligand binds to an E3 ubiquitin ligase; these two ligands are connected by a linker. The hydrophilic PEG spacer enhances the aqueous solubility and flexibility of the resulting PROTAC, which are critical for optimal ternary complex formation and target protein degradation. The t-butyl ester protecting group allows for selective deprotection and subsequent conjugation.
体外研究 (In Vitro)
一种配体与E3泛素连接酶结合,另一种配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地破坏靶蛋白。[1]
作为一种化学连接子,氨基-PEG3-叔丁酯本身不具有生物活性,因此不具备常规的体外活性。其体外应用体现在PROTAC的合成和评价中,用于将靶蛋白结合配体与E3连接酶结合配体连接起来。使用该连接子合成PROTAC的效率通常通过高效液相色谱(HPLC)和质谱(MS)进行评估。叔丁酯基团可以被选择性地脱保护,从而暴露出羧酸基团,用于进一步的偶联反应,实现正交合成策略。
体内研究 (In Vivo)
作为一种化学连接剂,氨基-PEG3-叔丁酯本身不具有生物活性,因此不采用常规的体内药效模型进行评估。其体内相关性体现在其所促进形成的PROTAC降解剂的生物活性上。该连接剂中的PEG组分有助于改善PROTAC的药代动力学性质,包括提高溶解度和降低免疫原性,这些特性有利于其在体内的应用。
酶活实验
在典型的非细胞偶联实验中,将氨基-PEG3-叔丁酯溶解于合适的溶剂中,例如DMSO或DMF。氨基可在偶联剂存在下与羧酸或活化酯反应生成酰胺键。叔丁酯可使用三氟乙酸(TFA)在二氯甲烷中脱保护,释放出游离的羧酸,该羧酸可被活化用于进一步的酰胺键形成。反应通常在室温下进行。产物通过柱色谱或制备型高效液相色谱纯化,并用核磁共振波谱(NMR)和质谱进行表征。
细胞实验
由于氨基-PEG3-叔丁酯是一种化学连接剂而非药物活性成分,因此标准的体外细胞活性检测方法不能直接用于评估其活性。然而,含有该连接剂的PROTAC降解剂的细胞活性可以在相关的细胞系中进行评估。含有该连接剂的PROTAC可以通过Western blot分析来评估其在癌细胞中降解靶蛋白的能力。降解效率的评估方法通常是:将细胞用不同浓度的PROTAC处理一段时间,然后裂解细胞,并用针对靶蛋白的抗体进行Western blot分析。
动物实验
作为一种化学连接剂,氨基-PEG3-叔丁酯不作为治疗剂用于动物实验。体内研究使用的是含有该连接剂的最终PROTAC偶联物。这些研究通常采用异种移植小鼠模型进行疗效评估,其中荷瘤小鼠通过静脉或口服途径接受PROTAC治疗,并测量肿瘤生长抑制情况。此外,还可以进行PROTAC的药代动力学研究,以评估PEG连接剂对循环半衰期和生物分布的影响。
药代性质 (ADME/PK)
作为一种化学连接剂,氨基-PEG3-叔丁酯并非治疗剂,因此其本身不具有药代动力学特征。该连接剂的药代动力学特性仅在最终的PROTAC偶联物中才具有意义。亲水性PEG间隔基有助于提高偶联物的药代动力学特性,例如增加水溶性和减少聚集。PROTAC的整体药代动力学特征取决于靶点结合配体、E3连接酶结合配体和连接剂的综合特性。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
氨基-PEG3-叔丁酯是一种研究用化学品,不适用于人类治疗用途。作为一种基于PEG的连接剂,它通常被认为具有较低的固有毒性,但在实验室操作时仍应采取适当的安全预防措施。该化合物通常在推荐条件下储存以保持稳定性。最终包含该连接剂的PROTAC偶联物的潜在毒性取决于所使用的特定靶点结合配体和E3连接酶结合配体。
参考文献

[1]. Small-molecule PROTACs: An emerging and promising approach for the development of targeted therapy drugs. EBioMedicine. 2018 Oct;36:553-562.

其他信息
氨基-PEG3-叔丁酯是一种用于PROTAC开发领域的异双功能PEG连接剂。该化合物包含一个氨基和一个叔丁基保护的羧酸基团,可实现正交偶联策略。叔丁酯保护基赋予合成灵活性,允许选择性脱保护和偶联。三单元PEG间隔基为所得偶联物提供最佳的灵活性和溶解性。该化合物常用于靶向蛋白降解疗法的研究开发,但尚未获批上市。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C13H27NO5
分子量
277.3572
精确质量
277.189
CAS号
252881-74-6
相关CAS号
252881-74-6;
PubChem CID
16218573
外观&性状
Colorless to light yellow liquid
闪点
169.7ºC
LogP
1.427
tPSA
80.01
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
13
重原子数目
19
分子复杂度/Complexity
228
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O(C(C([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C([H])([H])N([H])[H])=O)C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H]
InChi Key
CWFSAZJIJBTKRC-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C13H27NO5/c1-13(2,3)19-12(15)4-6-16-8-10-18-11-9-17-7-5-14/h4-11,14H2,1-3H3
化学名
tert-butyl 3-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethoxy]propanoate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.6054 mL 18.0271 mL 36.0542 mL
5 mM 0.7211 mL 3.6054 mL 7.2108 mL
10 mM 0.3605 mL 1.8027 mL 3.6054 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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