Amino-Tri-(carboxyethoxymethyl)-methane

别名: PUN62959 PUN 62959 PUN-62959Amino-Tri-(carboxyethoxymethyl)-methane
目录号: V7646 纯度: ≥98%
Amino-Tri-(carboxyethoxymethyl)-methan 是一种可裂解的 PEG ADC 连接体,可用于制备抗体药物缀合物 (ADC)。
Amino-Tri-(carboxyethoxymethyl)-methane CAS号: 174362-95-9
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
50mg
100mg
250mg
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  • Amino-Tri-(carboxyethoxymethyl)-methane HCl
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产品描述
氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷是一种可裂解的PEG-ADC连接剂,可用于制备抗体药物偶联物(ADC)。氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷也是一种PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)连接剂,属于聚乙二醇(PEG)类化合物,可用于制备PROTAC蛋白降解剂。
氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷(ATCEM)(CAS号:174362-95-9)是一种可裂解的异双功能PEG基连接剂,广泛用于抗体药物偶联物(ADC)和蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)的合成。该化合物的特征在于其独特的结构,其中心胺基被三个羧乙氧基甲基臂取代。这种三价结构提供三个末端羧酸基团,可作为反应位点,通过酰胺键的形成与含胺分子(例如抗体或靶向配体)偶联。该连接子被归类为“可裂解”连接子,这意味着它被设计成在特定的生理条件下降解,例如在内体/溶酶体的酸性环境中或在细胞内酶存在的情况下,从而实现有效载荷(例如细胞毒性药物)在靶细胞内的可控释放。氨基-三-(羧乙氧基甲基)-甲烷的分子量为337.32 g/mol,分子式为C13H23NO9。它是一种固体,可溶于DMSO(10 mM)。该化合物在-20°C下以粉末形式稳定保存长达三年,在-80°C下以溶液形式稳定保存两年。除了用于 ADC 和 PROTAC 合成外,ATCEM 还可用作各种工业应用中的螯合剂,包括水处理和可生物降解洗涤剂的配制。
生物活性&实验参考方法
靶点
Amino-Tri-(carboxyethoxymethyl)-methane does not have a specific biological target, as it is a chemical linker rather than a pharmacologically active compound. Its function is purely structural, serving as a covalent connector between two or more molecular components. The "targets" of this linker are the specific functional groups on the molecules it is designed to conjugate. The three terminal carboxylic acid groups are the primary reactive sites, acting as targets for conjugation with molecules that contain primary amine groups. This reaction, typically facilitated by coupling reagents like EDC or HATU, forms stable amide bonds. The central amine group can also serve as a target for further functionalization, for example, by reacting with activated esters. The cleavable nature of the linker means it is designed to be a target for intracellular conditions, such as the acidic pH of lysosomes or the action of specific enzymes, which will break the linker and release the payload. Therefore, the biological "target" is the intracellular environment of the target cell. In the context of ADC design, the linker's role is to ensure that the potent cytotoxic drug is stably attached to the antibody in circulation but is efficiently released once the ADC is internalized by the cancer cell.
体外研究 (In Vitro)
抗体药物偶联物(ADC)中的细胞毒素通过ADC连接子与抗体连接形成ADC[1]。PROTAC包含两种不同的配体,一种与E3泛素连接酶结合,另一种与靶蛋白结合,二者通过连接子连接。PROTAC通过细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性地降解靶蛋白[2]。
作为一种化学连接子,氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷本身不具有任何直接的体外生物活性,例如酶抑制、受体结合或细胞毒性。其生物学意义完全是间接的,源于其在生物活性偶联物合成中的应用。该连接子的体外活性是通过对其所合成的最终偶联物的表征来评估的。例如,当用于合成ADC时,偶联物的活性通过基于细胞的靶点结合、内化和细胞毒性检测来评估。可裂解连接子通过确保毒性有效载荷在靶细胞内高效释放,从而提升偶联物的整体活性,这对于抗体药物偶联物(ADC)的效力至关重要。在PROTAC合成中,连接子的作用是连接靶蛋白配体和E3泛素连接酶配体。其长度和柔性对于三元复合物的形成以及随后靶蛋白的泛素化和降解至关重要。因此,氨基-三-(羧乙氧基甲基)-甲烷的“活性”衡量的是其作为稳定、可裂解桥梁的能力,这种桥梁能够用于设计有效的靶向治疗药物。
体内研究 (In Vivo)
作为一种化学连接剂,氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷本身不具有任何直接的体内生物活性。它不作为治疗药物使用,在动物模型中也不表现出药理作用。其体内相关性仅限于作为较大、具有生物活性的偶联物(ADC)的组成部分。当将其整合到抗体药物偶联物(ADC)中时,这种可裂解的连接剂在药物的体内疗效中起着至关重要的作用。该连接剂必须在血液中保持稳定(以防止毒性有效载荷过早释放和全身毒性),但一旦ADC被靶细胞内化,则必须能够迅速裂解(以确保药物的高效释放)。这种特性被称为“旁观者效应”,是ADC设计的关键考虑因素。具体的体内活性(例如肿瘤消退)取决于偶联物的活性基团和靶向配体,但连接剂的稳定性和裂解动力学对于整体治疗效果至关重要。同样,对于PROTAC而言,连接基的性质会影响化合物的口服生物利用度、细胞渗透性和在体内形成三元复合物的能力。因此,虽然氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷本身没有直接的体内活性,但它是影响其所构建的治疗药物的疗效和安全性的关键组分。
酶活实验
由于氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷不是一种与蛋白质相互作用的生物活性化合物,因此目前尚无针对该化合物的特异性体外酶或受体结合试验。它是一种化学试剂,其表征通常采用分析化学技术。连接剂的质量和特性通常通过核磁共振(NMR)光谱、高效液相色谱(HPLC)和质谱(MS)等方法进行确认,以验证其结构和纯度(通常>98%)。如果需要进行试验来确认其反应活性,则应采用化学偶联反应而非生物结合试验。例如,可以通过将该连接剂与含胺模型化合物反应,并通过HPLC或LC-MS监测酰胺键的形成来测试羧酸基团的反应活性。可通过在模拟生理条件下(例如酸性pH缓冲液(如pH 5.0)或特定酶存在下)孵育连接子,并利用高效液相色谱法(HPLC)监测模型有效载荷的释放,在体外测试连接子的可裂解性。这些是质量控制和稳定性研究,而非生物学测定。
细胞实验
由于氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷并非旨在影响细胞功能的生物活性分子,因此目前尚无标准的体外细胞检测方法。它在细胞生物学中的应用是间接的,主要用作构建抗体药物偶联物 (ADC) 或靶向治疗偶联物 (PROTAC) 的试剂。在这种情况下,细胞检测需要用最终偶联的治疗药物处理细胞,然后测量生物学指标,例如细胞活力(用于评估 ADC 的细胞毒性)或靶蛋白水平(用于评估 PROTAC 的降解活性)。连接子的性能将通过偶联物的效力和选择性来评估,而效力和选择性取决于连接子释放有效载荷或促进三元复合物形成的能力。然而,由于连接子本身并非设计用于以未偶联形式与细胞相互作用,因此目前尚无直接针对连接子在细胞内活性的检测方法。该化合物在二甲基亚砜 (DMSO) 中的溶解度 (10 mM) 以及在特定储存条件下的稳定性确保了其能够有效地用于这些应用,而不会造成细胞实验假象。任何涉及氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷的细胞研究都是评估特定治疗偶联物的大型实验设计的一部分。
动物实验
氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷不作为独立化合物用于体内动物实验,因为它本身不具有直接的生物活性。它是合成抗体药物偶联物(ADC)和PROTAC的合成砌块。涉及该化合物的动物研究仅针对最终的、包含该化合物的较大偶联物进行。在这些研究中,将评估连接子对偶联物整体药代动力学和药效学特征的影响。例如,研究人员可能会比较使用可裂解连接子(例如氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷)合成的ADC与使用不可裂解连接子合成的ADC的体内疗效、稳定性和毒性。可裂解连接子有望在肿瘤内部释放毒性有效载荷,从而提高疗效并拓宽治疗指数。然而,目前尚无针对该连接子本身的标准动物实验方案。其用途仅限于研发阶段,用于测试化合物的化学合成。储存建议(粉末-20°C,溶液-80°C)旨在维持试剂的化学完整性。总之,目前尚无氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷作为单一药物的体内动物实验数据。
药代性质 (ADME/PK)
由于氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷并非治疗药物,因此未对其药代动力学(PK)性质进行研究。然而,其理化性质有助于了解其药代动力学行为。该化合物的分子量为337.32 g/mol,分子式为C13H23NO9,表明其为一种相对较小的高极性分子,具有多个可电离的羧酸基团(pKa约为4-5)。这些性质提示其在生理pH条件下具有较高的水溶性,但其logP值尚未报道。作为一种小型亲水分子,预计其进入血液循环后半衰期较短,可能通过肾脏滤过迅速清除。然而,当与抗体等较大分子偶联时,其整体药代动力学主要受较大组分的影响。该化合物为固体,可溶于DMSO(10 mM)。建议将其储存在-20°C,在此温度下可稳定保存长达三年;在-80°C的溶液中可稳定保存两年。因此,该连接子的“PK”特性并非独立考虑因素,而是其所构建的生物偶联物的设计和性能不可或缺的一部分,特别是其可裂解特性,旨在将有效载荷特异性地释放到靶组织中。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
作为一种基于聚乙二醇(PEG)的连接剂,氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷被认为毒性较低。PEG聚合物被广泛认为具有生物相容性、无毒且无免疫原性,因此常用于制药和生物医学研究。该化合物被归类为研究试剂,操作时应遵循标准的实验室安全预防措施。该连接剂的安全性主要在其用于抗体药物偶联物(ADC)的背景下进行考虑。可裂解连接剂的设计目的是在循环系统中保持稳定,并在靶细胞内释放其有效载荷。如果连接剂过早裂解,可能导致有毒有效载荷释放到血液中,造成脱靶毒性。因此,主要关注点并非连接剂本身的毒性,而是如果连接剂未能正确发挥其功能,其所携带的有效载荷可能产生的毒性。其毒性特征尚未经过广泛的独立研究,但根据其预期用途和化学类别,预计不会产生急性毒性。所有操作均应在通风良好的区域内进行,并佩戴适当的个人防护装备 (PPE)。
参考文献
[1]. Markus Ribbert, et al. Self coupling recombinant antibody fusion proteins. WO2009013359A2.
[2]. David Margulies, et al. Fluorescent molecular sensor for targeting changes in protein surfaces, and methods of use thereof. WO2015166491A2.
其他信息
氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷是一种仅供研究使用的试剂,并非药物,也未获准用于任何临床或治疗用途。它是一种用途广泛的化学工具,在生物医学研究和工业领域具有关键应用。其主要用途是作为可裂解的聚乙二醇(PEG)连接剂,用于合成抗体药物偶联物(ADC)和PROTAC。在ADC中,它作为桥梁,将强效细胞毒性药物与靶向抗体连接起来,确保药物特异性地递送至癌细胞并在细胞内释放。在PROTAC中,它将靶蛋白配体与E3泛素连接酶配体连接起来,促进靶向蛋白降解。除了这些前沿的治疗应用外,氨基三(羧乙氧基甲基)甲烷还可用作多种行业的螯合剂。它用于水处理,以结合和螯合金属离子,防止水垢形成并去除重金属。它也是可生物降解洗涤剂和清洁剂的关键成分,其螯合特性可增强清洁效果,同时兼顾环境可持续性。其三官能团结构和可裂解特性使其成为一种独特且极具价值的化合物,可用于先进的药物递送和工业应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C13H23NO9
分子量
337.323024988174
精确质量
337.137
CAS号
174362-95-9
相关CAS号
Amino-Tri-(carboxyethoxymethyl)-methane hydrochloride;1416771-72-6
PubChem CID
58107553
外观&性状
Colorless to off-white Solid-Liquid Mixture
LogP
-5.1
tPSA
166
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
15
重原子数目
23
分子复杂度/Complexity
331
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(COCC(COCCC(=O)O)(COCCC(=O)O)N)C(=O)O
InChi Key
PZOSHMSOMAHCEX-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C13H23NO9/c14-13(7-21-4-1-10(15)16,8-22-5-2-11(17)18)9-23-6-3-12(19)20/h1-9,14H2,(H,15,16)(H,17,18)(H,19,20)
化学名
3-[2-amino-3-(2-carboxyethoxy)-2-(2-carboxyethoxymethyl)propoxy]propanoic acid
别名
PUN62959 PUN 62959 PUN-62959Amino-Tri-(carboxyethoxymethyl)-methane
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.9645 mL 14.8227 mL 29.6454 mL
5 mM 0.5929 mL 2.9645 mL 5.9291 mL
10 mM 0.2965 mL 1.4823 mL 2.9645 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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