BA-53038B

别名: BA-53038B; AKOS040732521; MS-23535; HY-114314; CS-0082064;
目录号: V24024 纯度: ≥98%
BA-53038B (BA53038B)是一种新型、有效的乙型肝炎病毒核衣壳组装抑制剂,也称为HBV核心蛋白变构调节剂(CpAM)。
BA-53038B CAS号: 2306195-65-1
产品类别: HBV
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
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产品描述
BA-53038B (BA53038B) 是一种新型高效的乙型肝炎病毒核衣壳组装抑制剂,也称为乙型肝炎病毒核心蛋白变构调节剂 (CpAM)。它通过与 HAP 口袋结合,以独特的方式调节乙型肝炎病毒衣壳的组装,其 EC50 值为 3.32 μM。
BA-53038B (CAS#: 2306195-65-1) 是一种合成的小分子苯甲酰胺衍生物,作为乙型肝炎病毒 (HBV) 核心蛋白变构调节剂 (CpAM) 发挥作用。BA-53038B 与 HBV 核心蛋白上的疏水性 HAP(杂芳基二氢嘧啶)口袋结合,并以独特的方式调节乙型肝炎病毒衣壳的组装。该化合物对乙型肝炎病毒具有抗病毒活性,EC50 值为 3.32 μM。 BA-53038B 通过调节衣壳组装来破坏感染性病毒颗粒的形成,使其成为慢性乙型肝炎研究的一个有希望的候选药物。CpAMs 代表了一类新型抗病毒药物,其靶向 HBV 核心蛋白,该蛋白是病毒衣壳的关键组成部分,对病毒复制至关重要。
生物活性&实验参考方法
靶点
BA-53038B targets the hepatitis B virus (HBV) core protein, which is the structural protein that forms the viral capsid. The core protein is essential for HBV replication, as it encapsidates the viral pregenomic RNA and reverse transcriptase, facilitating the formation of infectious viral particles. BA-53038B binds to the hydrophobic HAP pocket on the core protein, an allosteric site that is distinct from the active site of the viral polymerase. By binding to this pocket, BA-53038B induces conformational changes in the core protein that modulate capsid assembly. Depending on the specific CpAM, this modulation can result in the formation of empty capsids, aberrant capsid structures, or the inhibition of capsid assembly altogether. BA-53038B's distinct mode of modulation sets it apart from other CpAMs and makes it a valuable tool for studying the mechanisms of HBV capsid assembly and disassembly.
体外研究 (In Vitro)
BA-53038B 具有抗 HBV 活性,其 EC50 值为 3.32 μM [1]。BA-53038B 具有细胞毒性,其 CC50 值大于 100 μM [1]。BA-53038B(5 μM;48 小时)可降低低磷酸化核心蛋白的含量并改变衣壳/核衣壳的运动性 [1]。BA-53038B(0–20 μM;2 或 6 天)可抑制 HBV 核衣壳的组装 [1]。BA-53038B(5 μM;2 天)通过抑制 pgRNA 的包装来降低低磷酸化核心蛋白和含 DNA 衣壳的含量 [1]。BA-53038B(2 μM;6 小时)通过与 HAP 口袋结合来改变 HBV 衣壳的组装 [1]。瞬时转染pHBV1.3/core-V124W的HepG2细胞对HBV衣壳表现出抗性,对BA-53038B的EC50值>10 μM [1]。体外实验表明,BA-53038B在细胞培养模型中具有抗HBV病毒活性。该化合物抑制HBV复制的EC50值为3.32 μM。在HBV感染的肝癌细胞(如HepG2.2.15细胞或原代人肝细胞)中,BA-53038B处理可降低细胞外HBV DNA、细胞内HBV DNA和HBV表面抗原(HBsAg)的水平。该化合物的抗病毒活性呈浓度依赖性,其对衣壳组装的影响可通过电子显微镜或衣壳组装实验进行观察。 BA-53038B 的作用机制与核苷/核苷酸类似物(如拉米夫定或替诺福韦)的作用机制不同,后者靶向病毒聚合酶,因此 BA-53038B 有可能成为联合疗法的候选药物。
体内研究 (In Vivo)
在体内,BA-53038B 已在乙型肝炎病毒 (HBV) 感染的动物模型中进行研究,例如 HBV 转基因小鼠模型或人源化肝脏小鼠模型。在这些模型中,给予 BA-53038B 可降低血清 HBV DNA 水平和 HBsAg 水平,表明其具有抗病毒功效。该化合物的口服生物利用度和药代动力学特性使其适用于体内研究。然而,由于该化合物主要是一种研究工具,现有文献中关于 BA-53038B 的具体体内数据有限。
酶活实验
BA-53038B 的非细胞活性检测包括测量其与 HBV 核心蛋白的结合及其对衣壳组装的影响。在典型的结合实验中,将重组 HBV 核心蛋白与 BA-53038B 孵育,并使用表面等离子共振或等温滴定量热法测定其结合亲和力。在衣壳组装实验中,将核心蛋白与 BA-53038B 在促进衣壳组装的缓冲液中孵育,并通过尺寸排阻色谱、动态光散射或电子显微镜监测衣壳的形成。通过比较在有无 BA-53038B 存在下形成的衣壳的数量和结构,评估该化合物调节衣壳组装的能力。
细胞实验
Western Blot 分析 [1]
细胞类型: AML12HBV10 细胞
测试浓度: 5 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: 低磷酸化核心蛋白的量减少,促进空衣壳的组装,并降低电泳迁移率。

RT-PCR[1]
细胞类型:AML12HBV10 和 HepDES19 细胞
测试浓度:0-20 μM
孵育时间:2 或 6 天
实验结果:抑制 AML12HBV10 和 HepDES19 细胞中的 HBV 复制。
BA-53038B 的细胞活性测定包括用该化合物处理 HBV 感染的肝癌细胞,并测量其对病毒复制和衣壳组装的影响。将细胞培养于多孔板中,并用不同浓度的 BA-53038B 处理数天。通过实时 PCR 定量细胞外 HBV DNA,并通过 PCR 或 Northern 印迹法检测细胞内 HBV DNA 和 HBV RNA。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测培养上清液中的HBsAg和HBeAg水平。通过免疫沉淀法从细胞裂解液中分离衣壳,然后进行核心蛋白的Western印迹分析,评估衣壳组装情况。使用标准细胞活力检测方法评估化合物的细胞毒性,以确保观察到的抗病毒作用并非由非特异性细胞毒性引起。
动物实验
BA-53038B 的体内动物研究通常采用 HBV 转基因小鼠模型或人源化肝小鼠模型。在携带完整 HBV 基因组并能产生感染性病毒的 HBV 转基因小鼠中,每日口服不同剂量(通常为 10-50 mg/kg)的 BA-53038B,持续数周。定期采用实时 PCR 检测血清 HBV DNA 水平,并采用 ELISA 检测血清 HBsAg 和 HBeAg 水平。研究结束时,收集肝组织用于检测肝内 HBV DNA 水平和进行组织病理学检查。将 BA-53038B 的疗效与恩替卡韦或替诺福韦等标准 HBV 抗病毒药物进行比较。在含有人类肝细胞并支持 HBV 感染的人源化肝小鼠模型中,评估类似的终点指标。
药代性质 (ADME/PK)
BA-53038B 的分子量为 249.74 g/mol,分子式为 C₁₄H₁₆ClNO。该化合物是一种小分子苯甲酰胺衍生物,在 DMSO 和其他有机溶剂中具有良好的溶解性。应将其以粉末形式储存于 -20°C,并避光防潮。其药代动力学性质,包括口服生物利用度和半衰期,已在临床前研究中得到表征。该化合物通常配制成合适的载体,用于体内研究中的口服给药。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在用于抗病毒疗效研究的剂量下,BA-53038B 在临床前研究中通常具有良好的耐受性。然而,由于该化合物主要用作研究工具,因此全面的毒理学数据有限。该化合物尚未获准用于临床,仅供研究用途。
参考文献

[1]. Discovery of Novel Hepatitis B Virus Nucleocapsid Assembly Inhibitors. ACS Infect Dis. 2019 May 10;5(5):759-768.

其他信息
BA-53038B 是一种合成的小分子乙型肝炎病毒 (HBV) 核心蛋白变构调节剂 (CpAM),其开发目的是为了研究 HBV 衣壳组装和慢性乙型肝炎。它与 HBV 核心蛋白上的 HAP 口袋结合,并具有独特的衣壳调节模式,使其成为理解 HBV 复制机制和验证核心蛋白作为治疗靶点的宝贵工具。该化合物对 HBV 具有抗病毒活性 (EC50 = 3.32 μM),并且与核苷/核苷酸类似物联合治疗的潜力凸显了其作为开发新型 HBV 疗法的先导化合物的潜力。BA-53038B 的治疗潜力及其作为 HBV 生物学研究工具的价值仍在持续研究中。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C14H16CLNO
分子量
249.735942840576
精确质量
249.092
CAS号
2306195-65-1
PubChem CID
138454763
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
3.9
tPSA
29.1
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
1
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
17
分子复杂度/Complexity
295
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1=CC=CC(=C1)NC(C1C2CCCCC21)=O
InChi Key
ZLCICHYECNOTGG-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C14H16ClNO/c15-9-4-3-5-10(8-9)16-14(17)13-11-6-1-2-7-12(11)13/h3-5,8,11-13H,1-2,6-7H2,(H,16,17)
化学名
N-(3-chlorophenyl)bicyclo[4.1.0]heptane-7-carboxamide
别名
BA-53038B; AKOS040732521; MS-23535; HY-114314; CS-0082064;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~250 mg/mL (~1001.04 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.0042 mL 20.0208 mL 40.0416 mL
5 mM 0.8008 mL 4.0042 mL 8.0083 mL
10 mM 0.4004 mL 2.0021 mL 4.0042 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们