Benzoquinoquinoxaline

目录号: V42829 纯度: ≥98%
苯并喹喔啉 (BQQ) 是一种带有氨基烷基侧链的杂环化合物。
Benzoquinoquinoxaline CAS号: 207671-99-6
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
苯并喹喔啉 (BQQ) 是一种带有氨基烷基侧链的杂环化合物。苯并喹喔啉优先结合 DNA 的三链结构,插入碱基之间,并稳定三链构象。苯并喹喔啉与 1,10-菲咯啉形成的复合物能够特异性地结合并切割双链 DNA 中三联体结构形成的位置。
苯并喹啉喹喔啉 (BQQ) (CAS 207671-99-6) 是一种具有氨基烷基侧链的杂环化合物。它优先与 DNA 三链体结构结合,插入碱基之间,稳定三螺旋 DNA 构象。
生物活性&实验参考方法
靶点
DNA triplex structures and double-stranded DNA at triplex formation sites. BQQ specifically recognizes and binds to DNA triple helices, a property utilized for targeted DNA recognition and manipulation in molecular biology.
体外研究 (In Vitro)
BQQ能以高亲和力与DNA三链体结构结合,插入碱基对之间,使三链体DNA的熔解温度(Tm)升高10-20℃,表明其具有很强的稳定作用。当与1,10-菲咯啉偶联时,该复合物能特异性地在三链体形成位点切割双链DNA。
体内研究 (In Vivo)
不适用;BQQ 是一种用于研究 DNA 三螺旋结构的研究工具,并非开发为治疗药物。体内研究有限;然而,与三螺旋 DNA 结合的化合物具有作为基因靶向药物的潜力。
酶活实验
将 BQQ (1-10 uM) 与三链体形成寡核苷酸 (TFO) 和靶双链 DNA (例如,100 nM) 在 Tris-EDTA 缓冲液 (pH 7.0-7.5) 中于 25°C 下孵育。通过紫外熔解曲线、凝胶电泳或荧光光谱监测三链体的形成和稳定性。
细胞实验
将 HeLa 或其他哺乳动物细胞用 BQQ (0.1-10 uM) 处理 2-24 小时。制备核提取物,并使用标记的三链 DNA 探针通过电泳迁移率变动分析 (EMSA) 或染色质免疫沉淀 (ChIP) 评估 DNA 结合情况。
动物实验
BQQ尚未在动物身上进行广泛试验。对于相关的DNA结合剂,可向小鼠腹腔注射或静脉注射10-50 mg/kg的剂量,并采集组织(肝脏、肾脏、肿瘤)进行DNA结合分析或毒性评估。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚无关于BQQ的相关信息。作为一种DNA嵌入剂,BQQ的分布半衰期可能为几分钟,消除半衰期可能为几小时。关于BQQ的药代动力学研究有限。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于其结构与其他DNA嵌入剂相似,BQQ在培养细胞中浓度高于10 μM时可能表现出细胞毒性。目前尚未有正式的毒理学研究报道。由于其可能损伤DNA,应谨慎处理。
参考文献

[1]. Oligonucleotide Binding to Non-B-DNA in MYC. Molecules. 2019 Mar 12;24(5):1000.

其他信息
苯并喹啉喹喔啉仅供研究使用,未经FDA批准。它是一种用于研究DNA三螺旋结构和开发序列特异性DNA切割剂的重要化学工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H21N5O
分子量
383.445744276047
精确质量
383.175
CAS号
207671-99-6
PubChem CID
12137514
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
tPSA
86
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
547
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(NC1=C2C(=C3C(=N1)C=CC=C3)N=C1C(=N2)C=CC2=CC(OC)=CC=C12)CCN
InChi Key
VLYNNEGUOHUAER-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H21N5O/c1-29-15-8-9-16-14(13-15)7-10-19-20(16)28-21-17-5-2-3-6-18(17)27-23(22(21)26-19)25-12-4-11-24/h2-3,5-10,13H,4,11-12,24H2,1H3,(H,25,27)
化学名
N'-(19-methoxy-2,10,13-triazapentacyclo[12.8.0.03,12.04,9.017,22]docosa-1(14),2,4,6,8,10,12,15,17(22),18,20-undecaen-11-yl)propane-1,3-diamine
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~130 mg/mL (~339.03 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.6079 mL 13.0395 mL 26.0790 mL
5 mM 0.5216 mL 2.6079 mL 5.2158 mL
10 mM 0.2608 mL 1.3040 mL 2.6079 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们