β-catenin-IN-3

目录号: V47577 纯度: ≥98%
β-catenin-IN-3 (compound C2) 是一种有效且特异性的 β-catenin (β-catenin) 抑制剂(拮抗剂),Kd 为 54.96 nM。
β-catenin-IN-3 CAS号: 1005288-15-2
产品类别: New3
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产品描述
β-catenin-IN-3(化合物C2)是一种强效且特异性的β-catenin抑制剂(拮抗剂),其Kd值为54.96 nM。它通过靶向β-catenin中一个隐蔽的变构调节位点发挥作用。β-catenin-IN-3可显著降低β-catenin驱动的癌细胞/肿瘤细胞的活力。
beta-catenin-IN-3(1005288-15-2,化合物 C2)是一种选择性小分子变构抑制剂,可抑制 beta-catenin(CTNNB1),后者是 Wnt 信号通路的关键介质。它与 beta-catenin 表面一个隐蔽的变构调节位点结合,KD 值为 54.96 nM,可显著降低 beta-catenin 驱动的癌症(如结直肠癌、肝细胞癌等)的细胞活力。
生物活性&实验参考方法
靶点
Target: beta-catenin (CTNNB1, KD = 54.96 nM). beta-catenin-IN-3 binds to an allosteric site on the surface of beta-catenin, distinct from the binding site of TCF/LEF transcription factors. This binding destabilizes beta-catenin or prevents its interaction with TCF/LEF, blocking the transcription of Wnt target genes (c-MYC, cyclin D1, AXIN2, LGR5) and reducing beta-catenin-driven cancer cell proliferation.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,β-catenin-IN-3 与 β-catenin 的结合亲和力(KD)为 54.96 nM(通过表面等离子共振测定)。它能显著抑制 β-catenin 驱动的癌细胞系(包括结直肠癌 (HCT116, DLD1) 和肝细胞癌 (HCC) 细胞)的活力,其 EC50 值在低微摩尔范围内 (1-10 uM)。在 5-10 uM 的浓度下,它能使 β-catenin/TCF 转录活性降低 50% 以上。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未发表β-catenin-IN-3的体内疗效数据。基于其在体外表现出的强效β-catenin结合能力和抗增殖活性,预计该化合物能够抑制结直肠癌、肝细胞癌及其他Wnt信号通路驱动型癌症异种移植模型中的肿瘤生长。该化合物有望成为开发β-catenin靶向癌症疗法的先导化合物。
酶活实验
对于无细胞结合实验(SPR):将重组β-catenin蛋白(50-100 ug)固定在CM5传感器芯片上。将不同浓度的β-catenin-IN-3(0.1-1000 nM)以30 uL/min的流速注入运行缓冲液(10 mM HEPES,pH 7.4,150 mM NaCl,0.05% Tween-20)中。监测结合和解离过程。使用BIAevaluation软件计算KD值(54.96 nM)。对于荧光偏振竞争实验:使用标记的β-catenin抑制剂探针测量位移。
细胞实验
对于基于细胞的检测:将β-catenin驱动的癌细胞系(HCT116、DLD1结直肠癌细胞系;HepG2、Huh7肝癌细胞系)接种于96孔板中,并用β-catenin-IN-3(0.1-100 uM,48-72小时)处理。采用MTT或CellTiter-Glo法检测细胞活力。采用TOPFlash/FOPFlash荧光素酶报告基因检测法检测β-catenin/TCF转录活性。将细胞与Super 8× TOPFlash或FOPFlash报告基因质粒共转染,并用化合物处理24-48小时。荧光素酶活性以Renilla荧光素酶进行标准化。采用qPCR和Western blot检测c-MYC和cyclin D1的表达。
动物实验
对于体内动物研究:潜在方案包括使用携带HCT116或DLD1结直肠癌细胞或HepG2肝癌细胞的异种移植小鼠模型。β-catenin-IN-3将通过腹腔注射或口服给药(10-50 mg/kg),每日一次,持续2-3周。使用游标卡尺测量肿瘤体积。收集肿瘤组织,用于c-MYC、cyclin D1和β-catenin靶基因的Western blot分析以及免疫组织化学染色(Ki67、cleaved caspase-3)。目前尚无已发表的数据。
药代性质 (ADME/PK)
β-catenin-IN-3 的药代动力学特性:对于一种小分子 β-catenin 抑制剂(分子量 484.25,ClogP 值约为 4.5),预测其口服给药后在啮齿动物体内的药代动力学特征为:中等口服生物利用度(约 20-40%),达峰时间 (Tmax) 为 2-4 小时,血浆半衰期为 4-8 小时。分布容积为中等至较大(约 3-5 L/kg),提示其组织分布广泛。血浆蛋白结合率高(>90%)。代谢途径可能为 CYP450 介导的氧化。该化合物可溶于 DMSO,体内制剂可使用 DMSO:PEG300:Tween80:生理盐水 (10:40:5:45) 配制。目前尚未发表正式的药代动力学研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚未有关于β-catenin-IN-3毒性数据的报道。根据其作用机制,抑制正常组织中的β-catenin可能导致不良反应,包括肠道稳态受损(因为Wnt/β-catenin信号通路对维持肠道干细胞至关重要)、骨形成减少(通过影响成骨细胞)以及潜在的脱发(因为β-catenin是毛囊发育所必需的)。目前尚未发表急性毒性或LD50研究结果。该化合物仅供研究使用。
参考文献

[1]. Allosteric inhibitor of β-catenin selectively targets oncogenic Wnt signaling in colon cancer. Sci Rep. 2020;10(1):8096. Published 2020 May 15.

其他信息
β-catenin-IN-3 是一种尚未获准用于临床的研究化合物。它是一种有价值的化学探针,可用于研究 Wnt/β-catenin 信号通路,并验证 β-catenin 作为癌症治疗靶点的有效性。它在结直肠癌(APC 突变导致 β-catenin 激活)、肝细胞癌、胰腺癌和其他 Wnt 信号通路驱动的恶性肿瘤中具有潜在的应用价值。它有望成为开发选择性靶向变构位点的 β-catenin 靶向疗法的先导化合物,从而可能克服脱靶毒性。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H20BR2N2OS
分子量
484.25
精确质量
483.964
CAS号
1005288-15-2
PubChem CID
5913409
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
5
tPSA
76.4
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
2
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
584
定义原子立体中心数目
0
SMILES
N(C=CC1=CC(Br)=CC(Br)=C1O)C(NC1CC2CC1C1C2CC=C1)=S
InChi Key
VPOJWIBWEJWBKC-SNAWJCMRSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H20Br2N2OS/c20-12-6-10(18(24)16(21)9-12)4-5-22-19(25)23-17-8-11-7-15(17)14-3-1-2-13(11)14/h1,3-6,9,11,13-15,17,24H,2,7-8H2,(H2,22,23,25)/b5-4+
化学名
1-[(E)-2-(3,5-dibromo-2-hydroxyphenyl)ethenyl]-3-(8-tricyclo[5.2.1.02,6]dec-4-enyl)thiourea
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0650 mL 10.3252 mL 20.6505 mL
5 mM 0.4130 mL 2.0650 mL 4.1301 mL
10 mM 0.2065 mL 1.0325 mL 2.0650 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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