| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
BI-3802 is a potent and selective inhibitor of the BTB (Broad-Complex, Tramtrack, and Bric a brac) domain of the transcription factor BCL6 (B-cell lymphoma 6). It inhibits the interaction between the BCL6 BTB domain and transcriptional co-repressors (e.g., NCOR1, SMRT, BCOR) with an IC₅₀ ≤ 3 nM in a biochemical ULight assay. [1]
Additionally, BI-3802 induces rapid, proteasome-dependent degradation of BCL6 protein in cells, a property not solely dependent on its inhibitory potency. [1] |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
BI-3802 的细胞 BCL6 IC50 为 43 nM[1]。 BI-3802 (EC50=64 nM) 可增强 BCL6 和 SIAH1 之间的反应[2]。
BI-3802 在多种弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞系(如 SU-DHL-4, Farage, OCI-Ly1, BJAB)中能诱导 BCL6 蛋白快速且强效的降解,在2小时内使 BCL6 水平降低 ≥90%。降解半衰期约为5分钟。[1] 降解由泛素-蛋白酶体系统介导,因为蛋白酶体抑制剂 MG-132 可阻断此过程,并导致多聚泛素化 BCL6 的积累。[1] 通过 RNA-seq 和 qPCR 检测,BI-3802 能强烈解除 BCL6 靶基因(如 PRDM1, IRF4, CD69, ATM, DUSP5)的抑制,其效果显著强于不诱导降解但抑制效力相当的抑制剂 (BI-3812)。[1] BI-3802 在多种 BCL6 阳性的 DLBCL 细胞系(如 SU-DHL-4, Farage, OCI-Ly1)中表现出抗增殖作用,导致在4-7天内缓慢发生的生长停滞,但未显著诱导细胞凋亡。BCL6 阴性细胞系(如 Toledo, MV-4-11)不敏感。[1] 在 Farage 细胞裂解液中使用固定的 BI-3802 类似物进行化学亲和力下拉实验,鉴定出 BCL6 是其主要靶点,未检测到其他含有 BTB/POZ 结构域的蛋白,表明其高选择性。[1] |
| 酶活实验 |
采用荧光偏振实验监测化合物对荧光标记的 BCOR 肽与重组 BCL6 BTB 结构域蛋白相互作用的抑制。在 384 孔板中进行筛选。实验缓冲液含有 HEPES、NaCl、Triton X-100 和还原型谷胱甘肽。将蛋白和肽加入含化合物的孔中,孵育后在荧光读板仪上读数。[1]
同时使用 ULight 时间分辨荧光共振能量转移实验进行更灵敏的抑制测定。该实验使用生物素化的 BCL6 BTB 结构域蛋白、ULight 标记的 BCOR 肽和链霉亲和素-铕络合物。化合物先与蛋白预孵育,然后加入肽和链霉亲和素-铕混合物。孵育后测量 TR-FRET 信号。使用蛋白浓度更低的改良版“ULight LOW”实验来准确测量低于 50 nM 的 IC₅₀ 值。[1] 使用表面等离子共振技术确认化合物与 BCL6 BTB 结构域的直接、剂量依赖性和可饱和结合,并测定解离常数。[1] |
| 细胞实验 |
为定量 BCL6 降解,将 SU-DHL-4 细胞悬浮并用化合物处理90分钟。然后裂解细胞,使用特异性抗体通过毛细管电泳分析 BCL6 蛋白水平,并用 GAPDH 进行标准化。绘制剂量反应曲线以计算 DC₅₀(半数最大降解浓度)值。[1]
对于长期增殖实验,将 DLBCL 细胞系以特定密度接种于24孔板,并在恒定化合物浓度下维持培养。每3-4天传代一次,通过乘以稀释倍数计算累积细胞数,绘制生长曲线。[1] 通过RNA测序进行基因表达分析。用化合物或 DMSO 处理细胞20小时或7天。对于7天处理,在第3天进行细胞传代并添加新鲜化合物。提取RNA,从 polyA 富集的RNA制备文库并进行测序。使用生物信息学工具进行差异基因表达分析。[1] 使用定量PCR验证基因表达变化。处理细胞、裂解、合成 cDNA,并使用基因特异性引物和内参基因进行扩增。计算相对mRNA丰度。[1] 为检测多聚泛素化的 BCL6,用化合物和蛋白酶体抑制剂处理细胞,然后裂解并进行 BCL6 的免疫沉淀。使用 TUBE 通过蛋白质印迹分析免疫沉淀物以检测泛素链。[1] |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
BI-3802 被定义为一种“降解剂”,这意味着它不仅抑制 BCL6 的 BTB 结构域,还能诱导其快速的泛素-蛋白酶体依赖性降解。这与 BI-3812 等“非降解剂”抑制剂形成对比,后者仅阻断辅阻遏物的结合。[1] BI-3802 诱导的降解需要 BCL6 的 DNA 结合能力(通过其锌指结构域或异源 DNA 结合结构域),但不需要已知的 PEST 结构域、MAPK 磷酸化位点、ATM/ATR 通路或 E3 连接酶 FBXO11。这表明存在一种由化合物结合和 DNA 结合触发的新型降解机制。 [1]
与BI-3812相比,BI-3802具有更强的抗增殖和基因去抑制作用,这表明完全去除BCL6蛋白比仅仅抑制其BTB结构域的功能更有效,这可能是由于BCL6其他区域介导的抑制功能被消除所致。[1] BI-3802可作为一种高效的探针化合物,用于研究BCL6降解对BCL6依赖性淋巴瘤和生发中心反应等细胞过程的影响。[1] |
| 分子式 |
C24H29CLN6O3
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|---|---|
| 分子量 |
484.9785
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| 精确质量 |
484.198
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| CAS号 |
2166387-65-9
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| PubChem CID |
131632978
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
4
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| tPSA |
99.7
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
7
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| 可旋转键数目(RBC) |
6
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| 重原子数目 |
34
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| 分子复杂度/Complexity |
772
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| 定义原子立体中心数目 |
2
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| SMILES |
ClC1=CN=C(N=C1NC1C=CC2=C(C=C(C(N2C)=O)OCC(NC)=O)C=1)N1C[C@H](C)C[C@H](C)C1
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| InChi Key |
GXTJETQFYHZHNB-GASCZTMLSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C24H29ClN6O3/c1-14-7-15(2)12-31(11-14)24-27-10-18(25)22(29-24)28-17-5-6-19-16(8-17)9-20(23(33)30(19)4)34-13-21(32)26-3/h5-6,8-10,14-15H,7,11-13H2,1-4H3,(H,26,32)(H,27,28,29)/t14-,15+
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| 化学名 |
2-((6-((5-Chloro-2-((3S,5R)-3,5-dimethylpiperidin-1-yl)pyrimidin-4-yl)amino)-1-methyl-2-oxo-1,2-dihydroquinolin-3-yl)oxy)-N-methylacetamide
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| 别名 |
BI-3802; U52; BI 3802; U-52; BI3802; U 52
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~6.67 mg/mL (~13.75 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.0619 mL | 10.3097 mL | 20.6194 mL | |
| 5 mM | 0.4124 mL | 2.0619 mL | 4.1239 mL | |
| 10 mM | 0.2062 mL | 1.0310 mL | 2.0619 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。