Biotin-VAD-FMK

目录号: V33788 纯度: ≥98%
Biotin-VAD-FMK 是一种细胞穿透/可穿透、不可逆、生物素标记的 caspase 抑制剂,用于表征细胞裂解物中的 caspase 活性。
Biotin-VAD-FMK CAS号: 1135688-15-1
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Biotin-VAD-FMK 是一种可穿透细胞的不可逆生物素标记的半胱天冬酶抑制剂,用于表征细胞裂解液中的半胱天冬酶活性。
生物素-VAD-FMK(CAS号:1135688-15-1)是一种细胞可渗透的、不可逆的生物素标记的半胱天冬酶抑制剂。半胱天冬酶是一类半胱氨酸蛋白酶,在细胞凋亡(程序性细胞死亡)中发挥着核心作用。该化合物是一种合成肽,设计为甲酯形式以提高细胞渗透性。生物素-VAD-FMK可用于鉴定和表征细胞裂解液和完整细胞中的活性半胱天冬酶。生物素标记使得可以使用基于链霉亲和素的方法检测和亲和纯化含半胱天冬酶的复合物。该化合物是研究细胞凋亡、半胱天冬酶激活以及半胱天冬酶在各种生理和病理过程中作用的宝贵工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
Biotin-VAD-FMK targets caspases, a family of cysteine-aspartic proteases that are key mediators of apoptosis. Caspases are synthesized as inactive zymogens (procaspases) and are activated by proteolytic cleavage in response to apoptotic stimuli. Once activated, caspases cleave specific substrates, leading to the characteristic morphological and biochemical features of apoptosis. Biotin-VAD-FMK contains the VAD (Val-Ala-Asp) sequence, which is recognized by caspases, and the fluoromethyl ketone (FMK) group, which forms an irreversible covalent bond with the catalytic cysteine residue of active caspases. The biotin moiety enables detection and purification of labeled caspases. The compound is a pan-caspase inhibitor, targeting multiple caspase family members including caspase-1, -3, -4, -7, and -8.
体外研究 (In Vitro)
Biotin-VAD-FMK 是一种合成肽,以甲酯形式配制,以增加细胞通透性。
在体外,生物素-VAD-FMK可用于鉴定细胞裂解液和完整细胞中的活性caspase。该化合物通过FMK基团与活性caspase不可逆结合,从而可通过基于链霉亲和素的方法(例如Western印迹、ELISA或流式细胞术)检测caspase活性。由于甲基酯修饰,该化合物具有良好的细胞渗透性,能够标记活细胞中的caspase,从而研究caspase的激活动态。生物素-VAD-FMK还可用于亲和纯化活性caspase及其相互作用蛋白,以进行蛋白质组学分析。该化合物对caspase具有高度特异性,不会标记其他半胱氨酸蛋白酶。生物素-VAD-FMK是细胞凋亡研究中的标准试剂。
体内研究 (In Vivo)
使用仅能检测活性半胱天冬酶的生物素化半胱天冬酶抑制剂 biotin-VAD-fmk [2],采用体内亲和标记技术来研究在没有蛋白水解切割的情况下半胱天冬酶-2 是否被激活。
由于生物素-VAD-FMK主要用于体外和离体实验,因此其体内数据有限。该化合物的细胞渗透性和不可逆结合使其可能用于体内标记活性半胱天冬酶,但其应用通常仅限于细胞培养和组织裂解液。该化合物仅供研究使用,不得用于人类治疗。在大多数研究环境中,不会将其用于活体动物。其药代动力学特性、生物利用度和组织分布尚未得到充分表征。
酶活实验
生物素-VAD-FMK的体外酶活性测定包括评估caspase活性的抑制和标记。将重组caspase或含有活性caspase的细胞裂解液与浓度为0.1-10 uM的生物素-VAD-FMK在37℃下孵育1-2小时。该化合物与活性caspase的催化半胱氨酸残基不可逆结合。然后使用链霉亲和素-HRP(辣根过氧化物酶)进行Western印迹检测,或使用链霉亲和素包被的酶联免疫吸附试验(ELISA)检测标记的caspase。对于活性测定,使用荧光底物(例如Ac-DEVD-AMC(用于caspase-3/7)或Ac-YVAD-AMC(用于caspase-1))测量caspase活性的抑制情况。测定抑制程度和标记情况。通过与非生物素化 VAD-FMK 的竞争,证实了标记的特异性。
细胞实验
体外细胞实验中,生物素标记的VAD-FMK可用于凋亡细胞或具有组成型活性caspase的细胞。将细胞(例如Jurkat细胞、HeLa细胞或原代细胞)培养于适宜的培养基中,并用凋亡刺激物(例如星形孢菌素、依托泊苷、TNF-α/环己酰亚胺)处理以诱导caspase活化。然后将细胞与生物素标记的VAD-FMK(1-10 μM)在37℃下孵育30-60分钟。洗涤后,固定细胞并进行透化处理,以便使用与荧光染料(例如FITC、PE、APC)偶联的链霉亲和素进行流式细胞术分析。或者,制备细胞裂解液,并使用链霉亲和素-HRP进行Western印迹分析。检测生物素标记的caspase条带,并表征caspase活化的模式。该化合物能够识别哪些半胱天冬酶在特定刺激下被激活。
动物实验
生物素-VAD-FMK 通常不进行体内动物实验,因为它是一种用于体外和离体研究的试剂。该化合物不适用于活体动物。对于半胱天冬酶活性的体内研究,研究人员通常使用非生物素化的半胱天冬酶抑制剂或针对体内应用优化的活性探针。生物素-VAD-FMK 用于研究组织裂解液和细胞提取物中的半胱天冬酶活性。对体内应用感兴趣的研究人员应查阅相关文献以获取最新信息。
药代性质 (ADME/PK)
生物素-VAD-FMK(CAS号:1135688-15-1)的分子式为C30H4₉FN₆O₈S,分子量为672.81。该化合物是一种可透过细胞膜的不可逆生物素标记的半胱天冬酶抑制剂。它包含用于识别半胱天冬酶的VAD(Val-Ala-Asp)序列、用于与催化半胱氨酸发生不可逆共价结合的FMK(氟甲基酮)基团,以及用于检测和亲和纯化的生物素部分。该化合物设计为甲酯形式,以提高其细胞渗透性。它可用于鉴定和表征细胞裂解液和完整细胞中的活性半胱天冬酶。生物素-VAD-FMK为白色至浅黄色固体,纯度≥95%。储存条件:-20℃,可保存长达3年。该化合物仅供研究使用。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于生物素-VAD-FMK 是一种研究试剂,因此其毒理学信息有限。作为一种半胱天冬酶抑制剂,该化合物可能干扰细胞凋亡和其他半胱天冬酶依赖性过程。操作该化合物时应遵循标准实验室防护措施,包括使用个人防护装备并在通风良好的区域工作。避免吸入、摄入和皮肤接触。该化合物应储存在-20℃,并根据机构化学和生物废物处理指南进行处置。
参考文献

[1]. Nitric oxide suppresses apoptosis via interrupting caspase activation and mitochondrial dysfunction in cultured hepatocytes. J Biol Chem. 1999 Jun 11;274(24):17325-33.

[2]. Loss of caspase-9 reveals its essential role for caspase-2 activation and mitochondrial membranedepolarization. Mol Biol Cell. 2007 Jan;18(1):84-93.

其他信息
生物素-VAD-FMK(CAS号:1135688-15-1)是一种细胞可渗透的、不可逆的生物素标记的泛半胱天冬酶抑制剂,可用作检测和表征活性半胱天冬酶的探针。该化合物包含用于识别半胱天冬酶的VAD序列、用于与催化半胱氨酸共价结合的FMK基团以及用于基于链霉亲和素的检测和亲和纯化的生物素部分。生物素-VAD-FMK广泛应用于细胞凋亡研究,用于研究半胱天冬酶的激活、鉴定活性半胱天冬酶种类以及纯化含半胱天冬酶的复合物以进行蛋白质组学分析。该化合物仅供研究使用,尚未获准用于临床或治疗用途。截至目前,生物素-VAD-FMK仍为研究试剂。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C30H49FN6O8S
分子量
672.8089
精确质量
672.331
CAS号
1135688-15-1
PubChem CID
25108682
外观&性状
White to light yellow solid powder
LogP
0.8
tPSA
226
氢键供体(HBD)数目
6
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
22
重原子数目
46
分子复杂度/Complexity
1100
定义原子立体中心数目
6
SMILES
S1C([H])([H])[C@@]2([H])[C@@]([H])([C@]1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C(N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C(N([H])[C@]([H])(C(N([H])[C@@]([H])(C([H])([H])[H])C(N([H])[C@]([H])(C(C([H])([H])F)=O)C([H])([H])C(=O)OC([H])([H])[H])=O)=O)C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])=O)=O)N([H])C(N2[H])=O
InChi Key
MOQLQMKJGYKHCT-VRKQFSAKSA-N
InChi Code
InChI=1S/C30H49FN6O8S/c1-17(2)26(29(43)33-18(3)28(42)34-19(21(38)15-31)14-25(41)45-4)36-24(40)12-6-5-9-13-32-23(39)11-8-7-10-22-27-20(16-46-22)35-30(44)37-27/h17-20,22,26-27H,5-16H2,1-4H3,(H,32,39)(H,33,43)(H,34,42)(H,36,40)(H2,35,37,44)/t18-,19-,20-,22-,26-,27-/m0/s1
化学名
methyl (3S)-3-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[6-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]hexanoylamino]-3-methylbutanoyl]amino]propanoyl]amino]-5-fluoro-4-oxopentanoate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 27.3 mg/mL (~40.58 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.4863 mL 7.4315 mL 14.8630 mL
5 mM 0.2973 mL 1.4863 mL 2.9726 mL
10 mM 0.1486 mL 0.7432 mL 1.4863 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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