BLM-IN-1

目录号: V31847 纯度: ≥98%
BLM-IN-1 是布卢姆综合征蛋白 (BLM) 的有效抑制剂。
BLM-IN-1 CAS号: 2056014-40-3
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
BLM-IN-1 是一种强效的布鲁姆综合征蛋白 (BLM) 抑制剂。BLM-IN-1 与 BLM 具有高亲和力,解离常数 (Kd) 为 1.81 μM。BLM-IN-1 对 BLM 具有良好的抑制活性,IC50 为 0.95 μM。BLM-IN-1 可诱导细胞凋亡。BLM-IN-1 可用于研究 DNA 损伤和癌症。
BLM-IN-1 是一种强效的布鲁姆综合征蛋白 (BLM) 抑制剂,BLM 是一种参与 DNA 修复和基因组稳定性的 DNA 解旋酶。它对 BLM 具有很高的结合亲和力,Kd 值为 1.81 microM,IC₅0 值为 0.95 microM。该化合物的分子式为 C2₈H3₅FN4O,分子量为 462.60 g/mol。BLM-IN-1 可诱导癌细胞发生 DNA 损伤反应、凋亡和增殖停滞。它是一种有前景的抗癌药物候选物,有望进一步开发用于癌症治疗。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary target of BLM-IN-1 is the Bloom syndrome protein (BLM), a member of the RecQ family of DNA helicases that plays a critical role in maintaining genomic stability. BLM is involved in DNA repair, recombination, and replication, and its dysfunction is associated with Bloom syndrome, a rare genetic disorder characterized by genomic instability and cancer predisposition. BLM-IN-1 inhibits BLM with an IC₅0 of 0.95 microM and binds with a Kd of 1.81 microM. By inhibiting BLM helicase activity, the compound disrupts DNA repair processes, leading to DNA damage accumulation, apoptosis, and proliferation arrest in cancer cells.
体外研究 (In Vitro)
BLM-IN-1(化合物 29)的解离常数 (KD) 为 1.81 μM,且具有良好的 BLM 结合能力 [1]。BLM-IN-1 的 IC50 为 0.95 μM,可抑制 BLM 的活性 [1]。BLM-IN-1 (1.0 μM) 不仅能阻止 BLM 解旋,还能干扰 BLM 与 DNA 的结合 [1]。BLM-IN-1 (0-1.0 μM) 可抑制 BLM 向双链断裂 (DSB) 位点的募集,从而调控同源重组 [1]。BLM-IN-1 (1.0、2.0 μM;48 小时) 可诱导细胞凋亡和 DNA 损伤反应 [1]。48 小时后,BLM-IN-1 (0.1、1.0 和 2.0 μM) 可导致合成相互作用和增殖停滞 [1]。
体外研究表明,BLM-IN-1 是一种强效的博来霉素 (BLM) 抑制剂,其 IC₅0 为 0.95 uM,Kd 为 1.81 uM。该化合物可诱导癌细胞发生 DNA 损伤反应、凋亡并抑制其增殖。BLM-IN-1 已被证实对多种癌细胞系有效,使其成为一种有前景的抗癌候选药物。该化合物的作用机制涉及抑制 BLM 解旋酶活性,从而导致 DNA 损伤积累并最终导致细胞死亡。BLM-IN-1 可用作研究工具,用于研究 BLM 在 DNA 修复和基因组稳定性中的作用,并验证 BLM 作为治疗靶点的潜力。
体内研究 (In Vivo)
BLM-IN-1的体内研究可能主要集中于评估其在动物癌症模型中的抗肿瘤疗效。作为一种博来霉素(BLM)抑制剂,该化合物能够诱导癌细胞DNA损伤和凋亡,因此具有抑制体内肿瘤生长的潜力。BLM-IN-1可能对依赖BLM进行DNA修复和存活的癌症有效。需要进一步研究以评估其在不同动物模型中的药代动力学特性、生物利用度和疗效。该化合物诱导DNA损伤和凋亡的能力表明,它有望成为抗癌疗法的重要补充,尤其适用于其他DNA修复途径存在缺陷的肿瘤。
酶活实验
在体外酶/受体结合实验中,BLM-IN-1 的评估采用解旋酶活性测定法,该方法通过测量 BLM 对 DNA 的解旋作用来进行。将该化合物与重组 BLM 蛋白、DNA 底物(通常为带有荧光或放射性标记的叉状或双链 DNA)以及不同浓度的 ATP 一起孵育。BLM 介导的 DNA 解旋作用可通过凝胶电泳、荧光偏振或其他检测方法进行定量。IC₅0 值由剂量反应曲线确定。结合亲和力 (Kd) 可通过表面等离子共振 (SPR)、等温滴定量热法 (ITC) 或其他生物物理方法进行测定。可进行针对其他解旋酶的选择性分析以确认其特异性。
细胞实验
Western Blot 分析 [1]
细胞类型: HCT116 细胞
测试浓度: 0.5、1.0 μM
孵育时间: 24 小时
实验结果: 损伤反应中 pATM 和 p-ATR 的水平显著升高。

免疫荧光 [1]
细胞类型: HCT116 细胞
测试浓度: 1.0 μM
孵育时间: 24 小时
实验结果: 诱导 RAD51 在 DSB 位点积累。细胞增殖实验[1]
细胞类型: HCT116 细胞
测试浓度: 0.1、1.0、2.0 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: HCT116 细胞的增殖受到剂量依赖性的显著抑制。

细胞凋亡分析[1]
细胞类型: HCT116 细胞
测试浓度: 1.0、2.0 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: 凋亡细胞比例呈浓度依赖性增加,cleaved caspase-3 和 cleaved caspase-7 的表达水平上调,以及 PARP 的切割。
在体外细胞实验中,BLM-IN-1 用于癌细胞系,以评估其对细胞活力、增殖和 DNA 损伤的影响。细胞在合适的培养基中培养,并用不同浓度的化合物(通常为纳摩尔至微摩尔浓度)处理。细胞活力和增殖通过 MTT、CellTiter-Glo 或克隆形成实验进行评估。DNA 损伤通过 γ-H2AX 染色、彗星试验或其他 DNA 损伤标记物进行评估。细胞凋亡通过 Annexin V 染色、caspase 活性检测或 TUNEL 染色进行评估。细胞周期分析通过流式细胞术进行。化合物对 BLM 蛋白水平和活性的影响可通过蛋白质印迹法进行验证。
动物实验
在体内动物实验中,BLM-IN-1 可通过多种途径给药,包括灌胃、静脉注射或腹腔注射,具体取决于其溶解度和药代动力学特性。使用人癌细胞系构建的免疫缺陷小鼠异种移植模型常用于评估抗肿瘤疗效。典型的给药方案为每日或间歇给药,剂量范围为 1 至 50 mg/kg。定期测量肿瘤体积并计算肿瘤生长抑制率。通过免疫组织化学或蛋白质印迹法评估肿瘤中的 DNA 损伤和细胞凋亡标志物。监测体重和整体健康状况。测量药代动力学参数以关联药物暴露量与疗效。
药代性质 (ADME/PK)
公开文献中对BLM-IN-1的药代动力学特性描述尚不详尽。作为一种分子量为462.60 g/mol的小分子,它可能具有良好的口服生物利用度和组织分布。该化合物中氟的存在及其亲脂性可能影响其代谢稳定性和清除率。需要通过在相关动物模型中进行全面的药代动力学研究来确定Cₘₐₓ、Tₘₐₓ、AUC、半衰期和清除率等详细参数。该化合物的蛋白结合、代谢和排泄途径仍有待充分阐明。可能需要进行制剂开发以实现最佳的体内给药效果。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于BLM-IN-1主要用作研究工具,其毒理学数据有限。初步研究表明,BLM-IN-1可诱导癌细胞DNA损伤和凋亡,也可能影响正常快速分裂的细胞。为进一步开发,需要开展包括急性毒性、重复给药毒性、遗传毒性和心脏毒性评估在内的全面毒理学研究。作为一种DNA解旋酶抑制剂,应考虑其与BLM在正常DNA修复中的作用相关的潜在靶向效应。处理该化合物时应采取适当的安全预防措施,包括使用个人防护装备并遵守机构安全指南。
参考文献

[1]. Discovery of Isaindigotone Derivatives as Novel Bloom's Syndrome Protein (BLM) Helicase Inhibitors That Disrupt the BLM/DNA Interactions and Regulate the Homologous Recombination Repair. J Med Chem. 2019 Mar 28;62(6):3147-3162.

其他信息
BLM-IN-1 是一种用于研究博来霉素 (BLM) 生物学和开发靶向 BLM 的抗癌疗法的研究化合物。目前尚未有关于该化合物作为治疗药物的临床试验或监管批准的报道。它仅供研究用途,可从多家化学品供应商处获得。该化合物是一种强效的 BLM 抑制剂,IC₅₀ 为 0.95 μM,Kd 为 1.81 μM。BLM-IN-1 可诱导癌细胞发生 DNA 损伤反应、凋亡和增殖抑制,使其成为一种有前景的抗癌疗法候选药物。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C28H35FN4O
分子量
462.602110147476
精确质量
462.279
CAS号
2056014-40-3
PubChem CID
137649032
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
5.3
tPSA
47.9
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
754
定义原子立体中心数目
0
SMILES
FC1=CC2=C(C=C1NCCCN(CC)CC)N=C1/C(=C/C3C=CC(=CC=3)C(C)C)/CCN1C2=O
InChi Key
GZSNGNPLURZQGM-CJLVFECKSA-N
InChi Code
InChI=1S/C28H35FN4O/c1-5-32(6-2)14-7-13-30-26-18-25-23(17-24(26)29)28(34)33-15-12-22(27(33)31-25)16-20-8-10-21(11-9-20)19(3)4/h8-11,16-19,30H,5-7,12-15H2,1-4H3/b22-16+
化学名
(3E)-6-[3-(diethylamino)propylamino]-7-fluoro-3-[(4-propan-2-ylphenyl)methylidene]-1,2-dihydropyrrolo[2,1-b]quinazolin-9-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~8.33 mg/mL (~18.01 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1617 mL 10.8085 mL 21.6169 mL
5 mM 0.4323 mL 2.1617 mL 4.3234 mL
10 mM 0.2162 mL 1.0808 mL 2.1617 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们