Boc-aminooxy-amide-PEG4-propargyl

别名: BocaminooxyamidePEG4propargyl; Boc aminooxy amide PEG4 propargyl
目录号: V39466 纯度: ≥98%
Boc-aminooxy-amide-PEG4-propargyl 是一种不可裂解(不可降解)的 ADC 连接体,含有 4 个聚乙二醇 (PEG) 单元,可用于制备活性抗体-药物缀合物 (ADC)。
Boc-aminooxy-amide-PEG4-propargyl CAS号: 2253965-01-2
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Boc-氨基氧酰胺-PEG4-丙炔基是一种不可裂解(不可降解)的抗体药物偶联物(ADC)连接子,含有4个聚乙二醇(PEG)单元,可用于制备活性抗体药物偶联物(ADC)。Boc-氨基氧酰胺-PEG4-丙炔基是一种点击化学试剂。它含有炔基,可以与含有叠氮基的化合物发生CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。
Boc-氨基氧基-酰胺-PEG4-炔丙基是一种异双功能、不可裂解的聚乙二醇(PEG)基连接子,包含一个叔丁氧羰基(Boc)保护的氨基氧基、一个末端炔丙基(炔烃)基团和一个4单元聚乙二醇(PEG4)间隔基。在酸性条件下,Boc保护基可被选择性去除,从而暴露出活性氨基氧基,该氨基氧基可在温和条件下与醛和酮进行化学选择性肟连接反应。炔丙基基团提供了一个炔烃基团,可用于与含叠氮分子进行铜催化叠氮-炔环加成(CuAAC)点击化学反应。PEG4间隔基增强了该连接子的溶解性、柔韧性和生物相容性。该连接子常用于抗体药物偶联物(ADC)、PROTAC和其他生物偶联物的合成。
生物活性&实验参考方法
靶点
This compound functions as a chemical linker for bioconjugation; it does not directly bind to biological receptors or enzymes.
体外研究 (In Vitro)
ADC 细胞毒素通过 ADC 连接器与抗体连接,形成 ADC [1]。
Boc-氨氧基-酰胺-PEG4-丙炔基是一种不可裂解的四单元聚乙二醇(PEG)连接子,常用于抗体药物偶联物(ADC)和PROTAC的合成。Boc保护基对碱不稳定,可在酸性条件下(例如,20-50%三氟乙酸(TFA)的二氯甲烷(DCM)溶液或TFA水溶液)脱除,从而暴露出活性氨氧基。该氨氧基可与醛或酮形成稳定的肟键,从而在温和的水溶液条件(pH 4-6)下实现化学选择性偶联。丙炔基可与叠氮基功能化的分子进行铜催化叠氮-炔环加成(CuAAC)点击化学反应。这种双重正交功能允许将两种不同的分子依次或同时偶联到同一连接子上。 PEG4间隔基赋予化合物水溶性和柔韧性,从而降低空间位阻。作为一种不可裂解的连接基,其形成的键在生理和溶酶体条件下均保持稳定;有效载荷的释放需要通过降解缀合物来实现。该连接基本身不具有生物活性。
体内研究 (In Vivo)
作为连接子,Boc-氨氧基-酰胺-PEG4-丙炔基并非设计用于直接发挥体内活性。其体内疗效取决于使用该连接子合成的完整偶联物(例如,抗体药物偶联物 (ADC) 或 PROTAC)。对于 ADC 而言,不可裂解的连接子具有较高的血浆稳定性和较低的有效载荷过早释放率,从而可以降低全身毒性。然而,它们需要整个偶联物被内化和降解才能释放有效载荷,这可能导致旁观者效应降低。PEG4 间隔基可提高溶解度并可能减少 ADC 聚集,从而改善药代动力学(延长半衰期)并降低免疫原性。对于 PROTAC,连接子的长度和组成(PEG4)会影响三元复合物(靶蛋白、PROTAC、E3 连接酶)的形成和降解效率。Boc 保护的氨氧基允许在连接子连接到其中一个组分后进行选择性脱保护和后续偶联,从而实现模块化合成。目前尚无该连接子单独使用的直接体内活性数据。
酶活实验
作为一种化学连接剂,Boc-氨基氧基-酰胺-PEG4-丙炔基通过化学分析进行表征。HPLC 确认其纯度(≥95%)。通过¹H NMR 光谱和高分辨率质谱 (HRMS) 验证其结构。¹H NMR (CDCl3, 400 MHz) 显示:Boc 基团在 δ ~1.4 ppm 处呈现单峰 (9H, -C(CH3)3),PEG 质子在 δ 3.5-3.7 ppm 处呈现多重峰 (-O-CH2-CH2-O-),酰胺质子在 δ ~6.5-7.5 ppm 处呈现宽单峰,丙炔基在 δ ~2.5 ppm 处呈现三重峰 (≡CH),末端炔烃在 δ ~2.5 ppm 处呈现单峰。分子量通过 ESI-MS 确认。 Boc保护基的含量可通过酸催化水解后,用气相色谱(GC)分析释放的异丁烯或通过核磁共振氢谱(¹H NMR)积分进行定量。氨氧基的含量可通过Boc脱保护后与标准醛或酮反应进行定量。Boc脱保护效率的评估方法为:将化合物在室温下用三氟乙酸(TFA)(20-50%二氯甲烷溶液)处理1-2小时,然后用液相色谱-质谱联用(LC-MS)分析产物,以确认Boc保护基的消失。随后,在室温下,于100 mM乙酸钠缓冲液(pH 4.5)或磷酸盐缓冲液(PBS,pH 6.8)中,测试游离氨氧基与模型醛(例如4-甲酰基苯甲酸)的肟连接反应,并通过LC-MS监测产物的生成。在室温下,于 PBS 或叔丁醇/水中,在 CuSO4 (0.5-1 mM) 和抗坏血酸钠 (1-2 mM) 的存在下,通过 CuAAC 与模型叠氮化物(例如,苄基叠氮化物)反应来定量炔丙基,并通过 HPLC 监测产物的生成。
细胞实验
作为连接子,Boc-氨基氧酰胺-PEG4-丙炔基不直接用于细胞实验。最终的偶联物(例如,抗体药物偶联物 (ADC) 或 PROTAC)需要进行测试。对于使用该连接子合成的 PROTAC,典型的细胞实验包括用不同浓度的 PROTAC(0.001-10 μM)处理靶细胞 4-24 小时。然后裂解细胞,并通过蛋白质印迹法检测靶蛋白的水平。计算半数最大降解浓度 (DC50)。对于 ADC,实验方法与任何 ADC 类似:用 ADC 处理细胞 72-120 小时,并使用 CellTiter-Glo 检测细胞活力。游离连接子(不含保护基团)可用作对照,以确保其无生物活性。正交偶联技术能够合成双标记探针(例如,通过肟连接连接荧光团,通过点击化学连接靶向配体)。此类探针可加入细胞中孵育1-24小时,并通过共聚焦显微镜研究其摄取和定位情况。
动物实验
将最终的偶联物(而非单独的连接子)给药给动物。使用该连接子构建的抗体药物偶联物(ADC)的典型体内实验方案采用小鼠异种移植模型。将5-10×10⁶个抗原阳性肿瘤细胞皮下注射到雌性无胸腺裸鼠体内。当肿瘤体积达到100-200 mm³时,将小鼠随机分为治疗组(n=8-10)。将ADC配制于PBS中,并通过尾静脉以1-10 mg/kg的剂量(基于抗体含量)进行静脉注射(iv)。每2-3天用游标卡尺测量肿瘤体积,并记录体重。通常每周给药一次,持续2-4周。研究结束时,切除肿瘤,称重并进行分析。对于PROTAC,典型的体内实验方案包括构建靶向表达癌细胞的肿瘤异种移植模型,并以10-100 mg/kg的剂量口服或腹腔注射PROTAC。采用Western blot法测定肿瘤中PROTAC的药代动力学和靶蛋白的降解水平。
药代性质 (ADME/PK)
所测量的是最终偶联物的药代动力学 (PK),而非连接子本身的药代动力学。对于使用该连接子构建的抗体药物偶联物 (ADC),其药代动力学特征由抗体决定。PEG4 间隔基可提高亲水性,与非 PEG 化 ADC 相比,这可以降低清除率并略微延长半衰期。Boc 基团在最终偶联前被去除,因此最终产品中不含该基团。脱保护后形成的肟键在生理条件下 (pH 7.4) 稳定,其水解半衰期为数天至数周(取决于肟的结构)。通过 CuAAC 反应形成的三唑环也稳定。对于 PROTAC,PEG4 连接基有助于提高整体亲水性,从而改善溶解度和口服生物利用度。PROTAC 的分布容积 (Vd) 通常适中,清除主要通过肝脏代谢。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
评估的是最终偶联物的毒性,而非连接子本身的毒性。对于使用不可裂解连接子构建的抗体药物偶联物(ADC),由于有效载荷过早释放减少,其脱靶毒性通常低于使用可裂解连接子构建的ADC。然而,如果ADC通过非特异性摄取被非靶细胞内化,有效载荷在溶酶体降解后仍会释放,从而可能导致毒性。PEG4间隔臂可减少聚集,从而降低免疫原性和非特异性摄取。对于PROTAC,毒性取决于靶蛋白和脱靶降解情况。实验室操作连接子时,应遵循标准化学安全预防措施:佩戴手套、实验服和护目镜。Boc基团无害。该化合物仅供研究使用。请在-20℃干燥避光处保存。Boc基团在碱性和中性条件下稳定,但在强酸性条件下不稳定。避免接触强酸。
参考文献
[1]. Beck A, et al. Strategies and challenges for the next generation of antibody-drug conjugates. Nat Rev Drug Discov. 2017 May;16(5):315-337.
其他信息
Boc-氨氧基-酰胺-PEG4-丙炔基是一种不可裂解的四单元聚乙二醇 (PEG) 连接剂,常用于抗体药物偶联物 (ADC) 和 PROTAC 的合成。它也是一种点击化学试剂,含有炔基,可用于与叠氮化物进行 CuAAC 反应。Boc 保护的氨氧基可进行选择性脱保护和肟连接,从而提供正交偶联策略。PEG4 间隔基(4 个乙二醇单元)赋予其适中的水溶性和柔韧性。该化合物可从化学供应商处购买,仅供研究使用。Boc 基团可在标准酸性条件下脱除(例如,50% TFA 的二氯甲烷溶液,1 小时)。脱保护后,游离的氨氧基可在 pH 4-6 的条件下与醛或酮反应,形成稳定的肟键。炔基(丙炔基)经修饰后,可通过 CuAAC 反应与叠氮化物反应,或通过 SPAAC 反应与张力炔烃反应。该化合物是一种用途广泛的结构单元,可用于模块化构建复杂的生物偶联物。应在干燥避光的环境中于 -20℃ 保存。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H32N2O8
分子量
404.4553
精确质量
404.215
CAS号
2253965-01-2
PubChem CID
146026151
外观&性状
Colorless to light yellow liquid(Density:1.125 g/cm3)
LogP
-0.2
tPSA
114
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
18
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
470
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC(C)(C)OC(=O)NOCC(=O)NCCOCCOCCOCCOCC#C
InChi Key
XDRDVAXJEVQKKC-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H32N2O8/c1-5-7-23-9-11-25-13-14-26-12-10-24-8-6-19-16(21)15-27-20-17(22)28-18(2,3)4/h1H,6-15H2,2-4H3,(H,19,21)(H,20,22)
化学名
tert-butyl N-[2-oxo-2-[2-[2-[2-(2-prop-2-ynoxyethoxy)ethoxy]ethoxy]ethylamino]ethoxy]carbamate
别名
BocaminooxyamidePEG4propargyl; Boc aminooxy amide PEG4 propargyl
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4724 mL 12.3622 mL 24.7243 mL
5 mM 0.4945 mL 2.4724 mL 4.9449 mL
10 mM 0.2472 mL 1.2362 mL 2.4724 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们