BODIPY Fl C5-Ceramide

目录号: V43238 纯度: ≥98%
高尔基体由单位膜堆叠在一起制成的扁平囊组成。
BODIPY Fl C5-Ceramide CAS号: 133867-53-5
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
高尔基体由层层堆叠的单位膜构成的扁平囊状结构组成。这些扁平囊状结构呈圆形,边缘膨大并有穿孔。高尔基体荧光探针是一种BODIPY标记的神经酰胺类似物。神经酰胺在内质网中合成,高尔基体荧光探针可通过神经酰胺转运蛋白(CERT)或囊泡运输到达高尔基体,从而实现染料的特异性标记。BODIPY Fl C5-神经酰胺是一种高尔基体特异性绿色荧光染料,可用于单细胞可视化。激发/发射波长为505 nm/512 nm。
BODIPY Fl C5-神经酰胺(CAS号:133867-53-5)是一种BODIPY标记的神经酰胺衍生物,可用作高尔基体特异性绿色荧光探针。其分子式为C34H54BF2N3O3,分子量为601.62 g/mol,最大激发波长/发射波长分别为505 nm和512 nm。该荧光染料在内质网中合成,并通过神经酰胺转运蛋白(CERT)或囊泡机制转运至高尔基体,从而实现对单个细胞的特异性染色。
生物活性&实验参考方法
靶点
BODIPY Fl C5-Ceramide targets the Golgi apparatus, specifically the Golgi staining, through specific binding after being transported via ceramide transport protein (CERT) or vesicular transport. It is widely used as a Golgi-specific green fluorescent dye for visualizing individual cells. As a Fluorescent Dye, it belongs to the Others pathway category.
体外研究 (In Vitro)
使用指南 1. 高尔基体工作液的配制 1.1 用DMSO配制5 mM的储备液。注意:为避免反复冻融,建议将储备液避光保存于-20°C或-80°C。 1.2 配制1–10 μM的高尔基体工作液时,可使用预先配制的PBS或培养基溶液。注意:请根据实际情况调整高尔基体1-43工作液的浓度。 2. 悬浮细胞染色 (2.1):将细胞以1000 g、4°C离心3至5分钟,去除上清液。加入PBS后,每次洗涤5分钟。细胞密度为1×10⁶/mL。 2.2 加入1毫升高尔基体工作液(2.3 400 g,4°C),离心3~4分钟,然后弃去上清液。2.4 用PBS洗涤细胞两次,每次5分钟。2.5 将细胞重悬于1毫升无血清骨髓液或PBS中,用流式细胞仪或荧光显微镜观察。3. 贴壁细胞染色 3.1 将贴壁细胞培养于无菌盖玻片上。3.2 取下细胞盖玻片,吸出3.3 100 μL染料工作液,振荡20~30分钟,使细胞充分浸润。3.4 吸出染料工作液,用培养基洗涤两次,每次5分钟,然后用流式细胞仪或荧光显微镜观察。储存条件:-20°C避光保存一年。注意事项:1. 储存液应避免阳光直射,温度为-20℃或-80℃,且不宜频繁冻融。2. 请根据实际情况调整高尔基体1-43工作液的浓度和稀释时间。3. 若细胞利用效果不佳且细胞培养基已达到要求,可使用稀释剂汉克斯平衡盐溶液进行洗涤。4. 本产品不应用于临床诊断或治疗,亦不可用于食品或药品。本产品仅供专业科研用途。5. 为保障您的健康和安全,请穿戴实验服并佩戴安全帽。
在体外,BODIPY Fl C5-神经酰胺可用作高尔基体特异性荧光标记物,用于细胞可视化研究。制备高尔基体工作液的方法是:首先将该化合物溶解于DMSO中,配制成5 mM的储备液,然后用预热的PBS或培养基稀释至1-10 uM的工作浓度。为确保最佳染色效果,工作液应在使用前立即配制。该产品应在-20℃避光保存,在此条件下可稳定保存长达一年。
体内研究 (In Vivo)
BODIPY Fl C5-神经酰胺主要用于体外细胞成像,因此其体内应用受到限制。然而,在活细胞模型中,可以研究其通过CERT或囊泡运输从内质网转运至高尔基体的机制。荧光标记能够实时观察高尔基体的形态和动态变化,但由于该化合物特异性定位于细胞内区室,因此通常不用于整体动物实验。
酶活实验
对于非细胞结合实验,BODIPY Fl C5-神经酰胺与高尔基体的结合可通过荧光显微镜或流式细胞术进行评估。配制 5 mM 的 DMSO 储备液,避光保存于 -20℃ 或 -80℃。染色时,将该储备液用预热的 PBS 或培养基稀释至 1-10 uM 的工作液。细胞在室温下孵育 20-30 分钟后,使用荧光显微镜或流式细胞仪检测荧光强度(激发/发射波长 = 505 nm/512 nm)。
细胞实验
对于体外细胞实验,使用培养在无菌盖玻片上的贴壁细胞。去除培养基后,加入100 uL高尔基体工作液(1-10 uM,用预热的PBS或培养基稀释5 mM DMSO储备液制备),覆盖细胞,孵育20-30分钟。然后去除工作液,用培养基洗涤细胞两次,每次5分钟。使用荧光显微镜或流式细胞仪观察染色后的细胞。悬浮细胞经离心(1000 g,4℃,3-5分钟)后,洗涤,重悬于工作液中,并进行类似染色。
动物实验
对于体内动物模型研究,通常不会给活体动物注射BODIPY Fl C5-神经酰胺。然而,可以进行离体研究,即收集组织样本并采用与细胞实验相同的方案进行染色。例如,可以将组织切片在室温下与高尔基体工作液(1-10 μM,溶于PBS)孵育20-30分钟,洗涤后,通过荧光显微镜分析不同组织类型中高尔基体的形态和分布。
药代性质 (ADME/PK)
BODIPY Fl C5-神经酰胺的分子量为601.62 g/mol,具有高亲脂性,能够高效穿透细胞膜并特异性靶向高尔基体。其激发/发射波长最大值分别为505 nm和512 nm,产生明亮的绿色荧光,适用于多色成像。该化合物在DMSO中的溶解度为50 mg/mL (83.11 mM),可通过超声和60℃加热进行溶解。储存条件为:-20℃避光保存;或溶剂保存于-80℃避光保存6个月,或-20℃避光保存1个月。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
作为一种用于细胞成像的荧光染料,BODIPY Fl C5-神经酰胺在1-10 μM的标准工作浓度下通常被认为毒性较低。在典型的20-30分钟孵育时间内,未见报道该浓度下对细胞活力有显著的细胞毒性作用。然而,该产品仅供研究使用,不得用于诊断或治疗用途。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施。
参考文献

[1]. Development of background-free tame fluorescent probes for intracellular live cell imaging. Nat Commun. 2016 Jun 20;7:11964.

[2]. Isolation of single Chlamydia-infected cells using laser microdissection. J Microbiol Methods. 2015 Feb;109:123-8.

其他信息
BODIPY Fl C5-神经酰胺是一种广泛应用于细胞生物学研究的高尔基体特异性荧光探针。它因其明亮的绿色荧光、光稳定性以及对高尔基体的特异性靶向性而备受青睐,可用于单个细胞的可视化。该探针在内质网中合成,并通过CERT或囊泡机制特异性地运输至高尔基体,从而能够研究高尔基体的形态、动态和功能。本产品并非药品,也未获得临床批准。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C34H54BN3O3F2
分子量
601.619
精确质量
601.423
CAS号
133867-53-5
PubChem CID
177700110
外观&性状
Brown to red solid powder
tPSA
77.5
氢键供体(HBD)数目
3
可旋转键数目(RBC)
21
重原子数目
43
分子复杂度/Complexity
999
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C(C1=CC=C2C=C3C(C)=CC(C)=N3[B+3]([F-])([F-])[N-]12)CCCC(=O)NC(CO)C(O)C=CCCCCCCCCCCCCC
InChi Key
VRQLSQAURNRUHQ-VYPMXFAASA-N
InChi Code
InChI=1S/C34H54BF2N3O3/c1-4-5-6-7-8-9-10-11-12-13-14-15-16-20-33(42)31(26-41)38-34(43)21-18-17-19-29-22-23-30-25-32-27(2)24-28(3)39(32)35(36,37)40(29)30/h16,20,22-25,31,33,41-42H,4-15,17-19,21,26H2,1-3H3,(H,38,43)/b20-16+/t31-,33+/m0/s1
化学名
5-(2,2-difluoro-10,12-dimethyl-1-aza-3-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-3,5,7,9,11-pentaen-4-yl)-N-[(E,2S,3R)-1,3-dihydroxyoctadec-4-en-2-yl]pentanamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~83.11 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6622 mL 8.3109 mL 16.6218 mL
5 mM 0.3324 mL 1.6622 mL 3.3244 mL
10 mM 0.1662 mL 0.8311 mL 1.6622 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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