BPKDi

目录号: V7097 纯度: ≥98%
BPKDi 是一种有效的联吡啶 PKD 抑制剂(拮抗剂),对 PKD1、PKD2 和 PKD3 的 IC50 值分别为 1 nM、9 nM 和 1 nM。
BPKDi CAS号: 1201673-28-0
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
BPKDi 是一种强效的联吡啶类 PKD 抑制剂(拮抗剂),对 PKD1、PKD2 和 PKD3 的 IC50 值分别为 1 nM、9 nM 和 1 nM。BPKDi 可阻断心肌细胞中 IIa 类 HDAC 的信号依赖性磷酸化和核输出。
BPKDi(CAS 编号:1201673-28-0)是一种强效且选择性的联吡啶类蛋白激酶 D (PKD) 抑制剂,可高效靶向 PKD1、PKD2 和 PKD3 亚型。它是一种小分子拮抗剂,可阻断心肌细胞中 IIa 类组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 的信号依赖性磷酸化和核输出。BPKDi 可用作研究工具,用于研究 PKD 在细胞过程(例如心脏肥大、基因表达和囊泡运输)中的作用。该化合物的分子量为380.49 g/mol,分子式为C21H28N6O。它为灰白色至浅黄色固体粉末,纯度≥98%。BPKDi仅供研究使用,未经批准用于任何临床或治疗用途。
生物活性&实验参考方法
靶点
BPKDi targets protein kinase D (PKD), a family of serine/threonine kinases that includes three isoforms: PKD1, PKD2, and PKD3. PKD is involved in diverse cellular processes including signal transduction, gene expression, vesicular trafficking, and cardiac hypertrophy. BPKDi inhibits PKD1, PKD2, and PKD3 with IC50 values of 1 nM, 9 nM, and 1 nM, respectively. It is selective for PKD over PKCδ and PKCε, as well as over a panel of additional calcium/calmodulin-dependent protein kinase (CaMK) superfamily members, at 1 µM. By inhibiting PKD, BPKDi blocks the phosphorylation and nuclear export of class IIa HDACs, which are key regulators of gene expression in response to stress signals. This mechanism makes BPKDi a valuable tool for studying PKD-mediated signaling pathways in various biological contexts.
体外研究 (In Vitro)
体外研究表明,BPKDi 是一种高效的 PKD 同工酶抑制剂。它对 PKD1、PKD2 和 PKD3 的抑制 IC50 值分别为 1 nM、9 nM 和 1 nM。在 1 µM 浓度下,该化合物对 PKD 的选择性优于 PKCδ 和 PKCε 等相关激酶以及一系列其他 CaMK 超家族成员。在利用分离的新生大鼠心室肌细胞进行的细胞实验中,1 µM 浓度的 BPKDi 可抑制苯肾上腺素诱导的组蛋白去乙酰化酶 4 (HDAC4) 和 HDAC5 的磷酸化和核输出,并减轻苯肾上腺素诱导的这些细胞的肥大。这些结果证实,BPKDi 是一种高效且选择性的 PKD 抑制剂,在心肌细胞中具有功能活性。
体内研究 (In Vivo)
由于 BPKDi 主要用作体外研究的工具,因此其体内活性数据有限。然而,其作用机制——抑制 PKD 介导的 IIa 类 HDAC 的磷酸化和核输出——提示其在研究心脏肥大和其他 PKD 相关疾病方面具有潜在的体内应用价值。该化合物对 PKD 的选择性优于其他激酶,使其成为验证 PKD 作为治疗靶点的体内研究的理想候选药物。然而,现有文献中并未详细描述具体的体内实验方案和结果,例如给药方案、给药途径和药代动力学参数。BPKDi 主要用于体外研究,以解析 PKD 信号通路。
酶活实验
BPKDi 的体外酶活性测定旨在测量其对 PKD 激酶活性的抑制作用。在典型的测定中,将重组 PKD 同工酶(PKD1、PKD2 或 PKD3)与肽底物和 ATP 在不同浓度的 BPKDi 存在下孵育。使用放射性测定法(例如,33P-ATP)或荧光法测量底物中磷酸盐的掺入情况。计算激酶活性的抑制率,并根据剂量-反应曲线确定 IC50 值。对于 BPKDi,PKD1、PKD2 和 PKD3 的 IC50 值分别为 1 nM、9 nM 和 1 nM。为了验证选择性,该化合物还针对一系列其他激酶进行了测试,包括 PKCδ、PKCε 和 CaMK 超家族成员。这些测定从分子水平上定量评估了 BPKDi 的效力和选择性。
细胞实验
体外细胞实验用于研究 BPKDi 在细胞环境中对 PKD 介导的信号通路的影响。常用的模型是分离的新生大鼠心室肌细胞。在这些实验中,用去氧肾上腺素处理细胞以诱导肥大和 PKD 激活。加入浓度为 1 µM 的 BPKDi,并通过蛋白质印迹和免疫荧光法评估其对 HDAC4 和 HDAC5 磷酸化和核输出的影响。通过评估细胞大小或蛋白质合成来衡量该化合物抑制去氧肾上腺素诱导的肥大的能力。这些细胞实验证实,BPKDi 在生理相关的细胞模型中抑制 PKD 活性及其下游信号通路。
动物实验
现有文献中对 BPKDi 的体内动物实验描述并不详尽。作为一种研究化合物,其体内应用取决于具体的研究问题。研究 BPKDi 等 PKD 抑制剂的典型方案是将其应用于心脏肥大或其他 PKD 相关疾病的动物模型。该化合物将被配制成注射剂,其溶剂可能包含 DMSO、PEG 和生理盐水。给药途径可以是腹腔注射 (ip) 或静脉注射 (iv),并按照预定的剂量和时间安排进行。研究终点包括评估心脏功能、肥大标志物和 HDAC 磷酸化水平。然而,现有文献中并未详细描述 BPKDi 的具体实验方案。
药代性质 (ADME/PK)
BPKDi 的分子量为 380.49 g/mol,分子式为 C21H28N6O,logP 值为 2.2。该化合物可溶于 DMSO。建议将粉末储存在 -20°C 下长达 3 年,或在 4°C 下长达 2 年。溶剂保存方面,可在 -80°C 下保存 6 个月,或在 -20°C 下保存 1 个月。该化合物应储存在密封且受保护的环境中(例如,氮气保护下),避免受潮和光照。在运输过程中,该化合物在室温下可稳定数日。其详细的药代动力学性质,例如半衰期、生物利用度和组织分布,尚未得到充分表征。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
标准产品说明书中未提供 BPKDi 的详细毒性数据。作为一种研究化合物,其毒性特征尚未得到充分表征。体外研究表明,该化合物对 PKD 的选择性高于其他激酶,提示其可能具有良好的脱靶安全性。然而,目前尚未有包括急性毒性和慢性毒性研究在内的全面毒理学研究报告。与所有研究用化学品一样,处理 BPKDi 时应遵循标准的实验室安全预防措施。其用途仅限于研究应用,不得用于人类或兽医用途。
参考文献

[1]. A novel kinase inhibitor establishes a predominant role for protein kinase D as a cardiac class IIa histone deacetylase kinase. FEBS Lett. 2010 Feb 5;584(3):631-7.

其他信息
BPKDi 是一种研究化合物,尚未获准用于任何临床或治疗用途。它是一种强效且选择性的蛋白激酶 D (PKD) 抑制剂,对 PKD1、PKD2 和 PKD3 的 IC50 值分别为 1 nM、9 nM 和 1 nM。BPKDi 可阻断心肌细胞中 IIa 类 HDAC 的信号依赖性磷酸化和核输出。它被用作研究工具,用于研究 PKD 在细胞过程(例如心脏肥大、基因表达和囊泡运输)中的作用。该化合物的作用机制是抑制 PKD 激酶活性,从而阻止 IIa 类 HDAC 的磷酸化和核输出。BPKDi 是解析 PKD 介导的信号通路以及验证 PKD 作为心脏肥大和癌症等疾病治疗靶点的重要工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H28N6O
分子量
380.486623764038
精确质量
380.232
CAS号
1201673-28-0
PubChem CID
46901383
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
2.2
tPSA
96.2
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
505
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(C1C=C(C2C=CN=C(C=2)NC2CCCCC2)N=C(C=1)N1CCNCC1)N
InChi Key
XNWDRALEEPGBHB-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H28N6O/c22-21(28)16-12-18(26-20(14-16)27-10-8-23-9-11-27)15-6-7-24-19(13-15)25-17-4-2-1-3-5-17/h6-7,12-14,17,23H,1-5,8-11H2,(H2,22,28)(H,24,25)
化学名
2-[2-(cyclohexylamino)pyridin-4-yl]-6-piperazin-1-ylpyridine-4-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.6282 mL 13.1409 mL 26.2819 mL
5 mM 0.5256 mL 2.6282 mL 5.2564 mL
10 mM 0.2628 mL 1.3141 mL 2.6282 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们