Bromo-PEG1-C2-azide

别名: BromoPEG1C2azide; Bromo PEG1 C2 azide 溴代-聚乙二醇-叠氮,Bromo-PEG1-azide,Bromo-PEG1-N3
目录号: V38043 纯度: ≥98%
Bromo-PEG1-C2-azide 是聚乙二醇 (PEG) 类别的 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)接头,可用于制备 PROTAC 蛋白降解剂。
Bromo-PEG1-C2-azide CAS号: 1144106-65-9
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
溴-PEG1-C2-叠氮化物是一种聚乙二醇(PEG)类PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)连接剂,可用于制备PROTAC蛋白降解剂。溴-PEG1-C2-叠氮化物是一种点击化学试剂。它含有叠氮基(N3),可与带有炔基的化合物发生CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。此外,它还可与带有BCN或DBCO基团的化合物发生SPAAC(应变促进炔-叠氮环加成反应)。
溴-PEG1-C2-叠氮化物(CAS 1144106-65-9)是一种双功能PEG基连接剂,末端带有溴原子和叠氮基。该化合物的分子式为C₄H₈BrN₃O,分子量为194.03 g/mol,可用于生物偶联和PROTAC合成,通过点击化学引入连接基团或连接配体。溴原子可被亲核试剂(如硫醇或胺)取代,从而进行进一步的功能化。叠氮基团可用于铜催化或应变促进的叠氮-炔环加成反应。
生物活性&实验参考方法
靶点
Bromo-PEG1-C2-azide functions as a PEG-based linker in PROTACs, connecting a target protein ligand to an E3 ubiquitin ligase ligand. The bromide group serves as a handle for nucleophilic substitution reactions, enabling the attachment of the linker to thiol- or amine-functionalized ligands. The azide group allows for the conjugation of the linker to alkyne-functionalized ligands via click chemistry. The short PEG spacer provides flexibility and hydrophilicity, improving the solubility of the final conjugate.
体外研究 (In Vitro)
一种配体与E3泛素连接酶结合,另一种配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。
体外实验表明,Bromo-PEG1-C2-叠氮化物可用于合成PROTAC,该PROTAC能够高效降解靶蛋白。连接子的双功能特性允许两个不同配体的顺序或同时连接。溴原子可被一个配体上的亲核试剂取代,而叠氮原子可通过点击化学与另一个配体上的炔烃连接。短的PEG间隔基为三元复合物的形成提供了最佳的间距和灵活性。
体内研究 (In Vivo)
在体内,基于溴-PEG1-C2-叠氮化物的PROTACs由于PEG间隔基的存在,具有改善药代动力学性质的潜力。亲水性PEG链有助于减少聚集和非特异性蛋白结合。然而,与更长的PEG连接基相比,较短的PEG1间隔基可能会限制其灵活性和溶解度的提升。含有该连接基的PROTACs的体内疗效将取决于具体靶点和分子的整体性质。
酶活实验
体外酶/受体结合实验用于评估溴-PEG1-C2-叠氮化物与靶蛋白及E3连接酶的结合亲和力。采用表面等离子共振(SPR)或生物层干涉(BLI)技术测定结合动力学。通过质谱或核磁共振(NMR)证实叠氮基团与炔基功能化配体的点击化学偶联。通过目标偶联物的形成证实溴基团与亲核试剂的反应活性。
细胞实验
为了评估基于溴-PEG1-C2-叠氮化物的PROTAC对靶蛋白的降解作用,我们进行了体外细胞实验。用不同浓度的PROTAC处理细胞,并通过Western blot定量分析靶蛋白的表达水平。根据剂量反应曲线计算DC50和Dmax值。为了验证降解是否由泛素-蛋白酶体系统介导,我们还用蛋白酶体抑制剂(例如MG132)共同处理细胞。
动物实验
基于溴-PEG1-C2-叠氮化物的PROTACs的体内动物研究采用异种移植或转基因小鼠模型进行。PROTACs通过静脉注射、腹腔注射或口服途径以不同剂量给药。采用Western blot或免疫组织化学方法评估组织中靶蛋白的降解情况。同时检测靶蛋白下游的药效学标志物。
药代性质 (ADME/PK)
基于溴-PEG1-C2-叠氮化物的PROTAC的药代动力学性质受短PEG间隔基的影响。PEG链赋予药物一定的亲水性,但其较短的长度可能会限制肾清除率的降低和半衰期的延长。整体药代动力学特征取决于完整PROTAC分子的具体性质。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于聚乙二醇(PEG)具有良好的生物相容性,基于溴代聚乙二醇1-C2叠氮化物的PROTACs的毒性特征通常较为良好。然而,溴原子可能与生物系统中的亲核试剂发生反应,从而导致潜在的脱靶效应。在临床前研究中,毒性评估主要通过监测体重、临床症状以及主要器官的组织病理学变化来进行。
参考文献
[1]. An S, et al. Small-molecule PROTACs: An emerging and promising approach for the development of targeted therapy drugs. EBioMedicine. 2018 Oct;36:553-562
其他信息
溴代聚乙二醇1-C2-叠氮化物(Bromo-PEG1-C2-azide)是一种双功能聚乙二醇(PEG)基连接剂,可用于生物偶联和PROTAC合成。它包含一个末端溴原子和一个叠氮基团。溴原子可用于亲核取代反应,而叠氮基团可用于点击化学偶联。该连接剂具有良好的灵活性和亲水性,是合成PROTAC和其他双功能分子的有效工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C₄H₈BRN₃O
分子量
194.03
精确质量
192.985
CAS号
1144106-65-9
PubChem CID
129984731
外观&性状
Colorless to light yellow liquid
LogP
1.7
tPSA
23.6
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
9
分子复杂度/Complexity
102
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(COCCBr)N=[N+]=[N-]
InChi Key
SBVSTNMRZMYOGF-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C4H8BrN3O/c5-1-3-9-4-2-7-8-6/h1-4H2
化学名
1-azido-2-(2-bromoethoxy)ethane
别名
BromoPEG1C2azide; Bromo PEG1 C2 azide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 5.1538 mL 25.7692 mL 51.5384 mL
5 mM 1.0308 mL 5.1538 mL 10.3077 mL
10 mM 0.5154 mL 2.5769 mL 5.1538 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们