CDK9-IN-10

别名: CDK9IN10; CDK9 IN 10 7-benzyloxy-5,8-dihydroxy-2-phenyl-chromen-4-one
目录号: V38214 纯度: ≥98%
CDK9-IN-10 是一种有效的 CDK9 抑制剂。
CDK9-IN-10 CAS号: 3542-63-0
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
50mg
100mg
250mg
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产品描述
CDK9-IN-10 是一种强效的 CDK9 抑制剂,也是 PROTAC CDK9 降解剂-2 的配体。
CDK9-IN-10(CAS 3542-63-0)是一种强效的 CDK9 抑制剂,是 PROTAC CDK9 降解剂-2 的配体。其分子式为 C22H16O5,分子量为 360.36 g/mol。CDK9-IN-10 用作 PROTAC 合成中的靶蛋白配体,用于靶向降解 CDK9。它在细胞模型中显示出强大的抑制活性,并广泛应用于肿瘤学、表观遗传学和转录生物学研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
CDK9-IN-10 targets cyclin-dependent kinase 9 (CDK9), a member of the cyclin-dependent kinase family involved in transcriptional regulation. CDK9 is a key component of the positive transcription elongation factor b (P-TEFb) complex, which regulates transcriptional elongation by phosphorylating RNA polymerase II. Inhibition of CDK9 leads to suppression of transcription and induction of apoptosis in cancer cells. CDK9-IN-10 is also used as a ligand in PROTACs for targeted CDK9 degradation.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,CDK9-IN-10 对 CDK9 具有强效抑制活性,并在细胞模型中展现出显著的抑制作用。该化合物可用于研究转录调控、细胞凋亡和肿瘤进展。作为一种 PROTAC 配体,它能够促进 CDK9 降解剂的开发,从而诱导 CDK9 的蛋白酶体降解。该化合物广泛应用于肿瘤学、表观遗传学和转录生物学领域,用于探索 CDK9 依赖性信号通路。
体内研究 (In Vivo)
在体内,CDK9-IN-10 已被用作研究 CDK9 在癌症和其他疾病中作用的工具。CDK9 抑制剂在多种临床前模型中均显示出抗肿瘤作用。作为一种 PROTAC 配体,CDK9-IN-10 可用于合成 CDK9 降解剂,与传统抑制剂相比,这些降解剂可能具有更高的疗效和选择性。体内研究评估了 CDK9 降解剂抑制肿瘤生长和诱导细胞凋亡的能力。
酶活实验
CDK9-IN-10 的非细胞酶/受体结合分析方案包括测量 CDK9 抑制情况。CDK9 激酶活性通过重组 CDK9/cyclin T1 和肽底物进行激酶活性测定来评估。IC50 值通过测量化合物在不同浓度下对激酶活性的抑制作用来确定。针对其他 CDK 和激酶的选择性测定用于确认特异性。结合研究可采用表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 进行。
细胞实验
CDK9-IN-10 的细胞活性检测方案包括用该化合物处理癌细胞系。将细胞与不同浓度的 CDK9-IN-10 孵育 24-72 小时。通过蛋白质印迹法检测 RNA 聚合酶 II 及其下游靶点的磷酸化水平来评估 CDK9 抑制情况。使用 MTT 或 CellTiter-Glo 法评估细胞活力。通过 Annexin V 染色或 caspase 活性检测来评估细胞凋亡。使用流式细胞术进行细胞周期分析。
动物实验
CDK9-IN-10 或含有该配体的 CDK9 降解剂的体内动物实验方案通常采用免疫缺陷小鼠的肿瘤异种移植模型。该化合物以不同剂量经口服或腹腔注射给药。定期测量肿瘤体积以评估抗肿瘤疗效。监测体重以评估毒性。研究结束时,收集肿瘤进行药代动力学/药效学分析,包括测量化合物浓度以及评估 CDK9 抑制及其下游效应。
药代性质 (ADME/PK)
CDK9-IN-10 的药代动力学性质已得到表征。作为一种小分子(分子量 360.36 g/mol),预计其具有良好的生物利用度。储存条件:4°C,密封保存,避光防潮;溶剂保存:-80°C 可保存 6 个月,-20°C 可保存 1 个月。需要进一步的药代动力学研究来全面表征其吸收、分布、代谢和排泄情况。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
CDK9-IN-10的毒性尚未得到广泛报道。作为一种CDK9抑制剂,它可能影响正常的细胞转录过程。标准的毒理学评估包括啮齿动物急性及亚慢性毒性研究、遗传毒性试验和心血管安全性评估。该化合物仅供研究使用,不得用于人类治疗。
参考文献

[1]. Discovery of Wogonin-based PROTACs against CDK9 and capable of achieving antitumor activity. Bioorg Chem. 2018 Dec;81:373-381.

其他信息
CDK9-IN-10(CAS:3542-63-0)分子式为C22H16O5,分子量为360.36 g/mol。它是一种强效的CDK9抑制剂,是PROTAC CDK9降解剂-2的配体。在细胞模型中显示出强大的抑制活性,并广泛应用于肿瘤学、表观遗传学和转录生物学领域。储存方法:4℃密封保存,避光防潮;溶剂保存:-80℃可保存6个月,-20℃可保存1个月。本产品仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C₂₂H₁₆O₅
分子量
360.36
精确质量
360.1
CAS号
3542-63-0
PubChem CID
15108688
外观&性状
Yellow to brown solid powder
LogP
4.45
tPSA
79.9
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
547
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC=C(C=C1)COC2=C(C3=C(C(=C2)O)C(=O)C=C(O3)C4=CC=CC=C4)O
InChi Key
OQHAZMRRNANBMN-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H16O5/c23-16-11-18(15-9-5-2-6-10-15)27-22-20(16)17(24)12-19(21(22)25)26-13-14-7-3-1-4-8-14/h1-12,24-25H,13H2
化学名
5,8-dihydroxy-2-phenyl-7-phenylmethoxychromen-4-one
别名
CDK9IN10; CDK9 IN 10
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 100 mg/mL (~277.50 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7750 mL 13.8750 mL 27.7500 mL
5 mM 0.5550 mL 2.7750 mL 5.5500 mL
10 mM 0.2775 mL 1.3875 mL 2.7750 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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