Cyanine5 DBCO

目录号: V43133 纯度: ≥98%
Cyanine5 DBCO (DBCO-Cy5) 是一种低毒叠氮化物反应探针(近红外荧光染料),可通过无铜“点击反应”对叠氮化物标记的生物分子进行成像(Ex=635 nm,Em=650-700纳米)。
Cyanine5 DBCO CAS号: 2360411-64-7
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
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产品描述
花菁5 DBCO (DBCO-Cy5) 是一种低毒性的叠氮反应探针(近红外荧光染料),可通过无铜“点击反应”(激发波长635 nm,发射波长650-700 nm)对叠氮标记的生物分子进行成像。花菁5 DBCO 对细胞和动物无明显毒性,且不影响靶细胞(叠氮标记细胞)以外的其他细胞的生理功能。花菁5 DBCO 可用于体外和体内细胞的标记和追踪。
花菁5 DBCO (DBCO-Cy5) 是一种近红外荧光染料缀合物,由花菁5荧光团与二苯并环辛炔 (DBCO) 基团结合而成。其分子式为 C53H59F6N4O2P,分子量为 929.03 g/mol。 Cyanine5 DBCO 是一种水溶性、低毒性的叠氮反应探针,可通过无铜“点击反应”(激发波长 635 nm,发射波长 650-700 nm)对叠氮标记的生物分子进行成像。DBCO 基团可通过点击化学与叠氮功能化的生物分子进行高效的生物正交偶联。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cyanine5 DBCO does not have a specific biological target as it is a fluorescent labeling reagent. Its function is to provide near-infrared fluorescence for the detection and imaging of azide-labeled biomolecules. The DBCO group reacts specifically with azide groups through a strain-promoted alkyne-azide cycloaddition (SPAAC) click reaction, without the need for copper catalysts. This bioorthogonal conjugation allows for the labeling of proteins, nucleic acids, and other cellular components in living systems.
体外研究 (In Vitro)
建议(以下是我们推荐的步骤;请注意,这仅供参考,应根据您的具体需求进行调整)。细胞标记(例如 A549 细胞)[5][2]:1. 将 2 毫升成熟种子细胞以 3 x 10⁴ 个细胞/细胞的密度接种到 35 毫米玻璃底培养皿中。连续三天,加入 Ac4ManNAz(终浓度 50 μM)以在细胞表面形成叠氮基团。2. 使用 Cyanine5 DBCO(终浓度 20 μM),并在 37°C 下用 DPBS 洗涤细胞 1 小时。3. 用 DPBS(pH 7.4)洗涤细胞后,在 25°C 下用甲醛-戊二醛混合固定液固定细胞。4. 用 DPBS 染色两次(至 pH 7.4),并用 DAPI 标记细胞核。 7. 使用共聚焦激光扫描显微镜测量 Cyanine5 DBCO 荧光团(激发波长 635 nm,发射波长 650-700 nm)。注:1)使用 Ac4ManNAz 处理后,Cyanine5 DBCO 可抑制细胞表面人工引入的叠氮基团超过三天。2)Cyanine5 DBCO 标记量。
Cyanine5 DBCO 可用于体外荧光显微镜、活细胞成像以及叠氮功能化生物分子的标记。它在 635 nm 处激发,在 650-700 nm 处发射,提供近红外荧光。该染料具有高亮度、优异的光稳定性和深层组织穿透性。它通过无铜点击反应用于叠氮标记生物分子的成像。Cyanine5 DBCO 可用于标记蛋白质、核酸和其他细胞成分。
体内研究 (In Vivo)
建议(以下是我们推荐的选择;请注意,这仅供参考,可根据您的具体需求进行调整)。体内细胞追踪[1][2]:1. 在含有2 mL生长培养基的35 mm玻璃底培养皿中,以3×10⁴个细胞(每个细胞的密度可能有所不同)的密度接种细胞并计数。2. 连续三天,加入Ac4ManNAz(终浓度为50 μM)以在细胞表面生成叠氮基团。3. 使用DPBS 4洗涤。4. 麻醉小鼠后,将经Ac4ManNAz处理的细胞注射到肝脏左叶。5. 通过成像系统识别的尾静脉注射200 μL Cyanine5 DBCO(25 μM)。
在体内,Cyanine5 DBCO用于叠氮标记生物分子的近红外荧光成像。其近红外荧光特性使其能够深入组织,并可用于活体追踪蛋白质、核酸和其他细胞成分。该染料毒性低,适用于活体成像应用。Cyanine5 DBCO 可用于研究活细胞和动物模型中的分子相互作用和细胞过程。
酶活实验
使用 Cyanine5 DBCO 进行体外实验通常包括配制 DMSO 储备液(≥80 mg/mL),然后用检测缓冲液稀释。标记反应中,将该化合物与叠氮基功能化的生物分子在合适的缓冲液中于室温下孵育 1-2 小时。标记产物随后通过透析或色谱法纯化。使用分光光度计或成像仪测量荧光,激发波长为 635 nm,发射波长为 650-700 nm。无铜点击反应确保了其与活细胞标记的兼容性。
细胞实验
利用 Cyanine5 DBCO 进行体外细胞分析,以标记和成像活细胞中的叠氮功能化生物分子。首先将细胞与叠氮标记的代谢前体(例如,用于聚糖标记的叠氮糖)孵育,使叠氮基团掺入细胞生物分子中。然后用 Cyanine5 DBCO 处理细胞,该染料通过点击化学与叠氮基团反应。洗涤后,使用荧光显微镜对细胞进行成像,激发波长为 635 nm,发射波长为 650-700 nm。该染料的近红外荧光特性使其能够以低背景进行深层组织成像。
动物实验
利用Cyanine5 DBCO进行体内动物实验,以进行叠氮标记生物分子的近红外荧光成像。将染料或Cyanine5 DBCO标记的分子通过静脉注射或其他途径给药给动物。然后使用激发波长为635 nm、发射波长为650-700 nm的荧光成像系统对动物进行成像。近红外荧光能够穿透深层组织,并对活体动物体内的分子相互作用和细胞过程进行成像。
药代性质 (ADME/PK)
用于体内成像的 Cyanine5 DBCO 的剂量和给药方式取决于具体应用。该染料通常以每只小鼠 1-10 nmol 的剂量进行静脉注射。Cyanine5 DBCO 的分子量为 929.03 g/mol,分子式为 C53H59F6N4O2P。该化合物应干燥密封储存于 -20°C。它在 DMSO 中的溶解度≥80 mg/mL。储备液应分装保存,并在 1 个月内使用。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
花菁5 DBCO被认为毒性较低。作为一种研究用化学品,它仅供实验室使用,不可食用。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施,包括佩戴手套和护目镜。该染料接触皮肤、眼睛和呼吸道后可能会引起刺激。由于其毒性较低,该化合物适用于体内成像应用。
参考文献

[1]. Cell labeling and tracking method without distorted signals by phagocytosis of macrophages. Theranostics. 2014 Feb 12;4(4):420-31.

[2]. Coupling Aptamer-based Protein Tagging with Metabolic Glycan Labeling for In Situ Visualization and Biological Function Study of Exosomal Protein-Specific Glycosylation. Angew Chem Int Ed Engl. 2021 Aug 9;60(33):18111-18115.

[3]. In Situ One-Step Fluorescence Labeling Strategy of Exosomes via Bioorthogonal Click Chemistry for Real-Time Exosome Tracking In Vitro and In Vivo. Bioconjug Chem. 2020 May 20;31(5):1562-1574.

其他信息
花菁5 DBCO(CAS 2360411-64-7)是一种近红外荧光染料缀合物,由花菁5荧光团与DBCO基团结合而成。它也被称为DBCO-Cy5,分子式为C53H59F6N4O2P。该化合物是一种水溶性、低毒性的叠氮反应探针,可通过无铜点击反应(激发波长635 nm,发射波长650-700 nm)对叠氮标记的生物分子进行成像。花菁5 DBCO具有高亮度、优异的光稳定性和深层组织穿透性,可用于荧光显微镜、活细胞成像和体内追踪。该化合物仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C53H59F6N4O2P
分子量
929.05
精确质量
928.427
CAS号
2360411-64-7
PubChem CID
164577372
外观&性状
Dark purple to black solid powder
tPSA
55.7
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
15
重原子数目
66
分子复杂度/Complexity
1720
定义原子立体中心数目
0
SMILES
[P+5]([F-])([F-])([F-])([F-])([F-])[F-].C([N+]1=C(C(C)(C)C2=CC=CC=C12)C=CC=CC=C1N(C2=CC=CC=C2C1(C)C)C)CCCCC(=O)NCCCCCC(N1CC2=CC=CC=C2C#CC2=CC=CC=C12)=O
InChi Key
YPXNDZYXPDFNEL-UHFFFAOYSA-O
InChi Code
InChI=1S/C53H58N4O2.F6P/c1-52(2)43-26-16-19-29-46(43)55(5)48(52)31-9-6-10-32-49-53(3,4)44-27-17-20-30-47(44)56(49)38-22-8-11-33-50(58)54-37-21-7-12-34-51(59)57-39-42-25-14-13-23-40(42)35-36-41-24-15-18-28-45(41)57;1-7(2,3,4,5)6/h6,9-10,13-20,23-32H,7-8,11-12,21-22,33-34,37-39H2,1-5H3;/q;-1/p+1
化学名
N-[6-(2-azatricyclo[10.4.0.04,9]hexadeca-1(16),4,6,8,12,14-hexaen-10-yn-2-yl)-6-oxohexyl]-6-[3,3-dimethyl-2-[5-(1,3,3-trimethylindol-1-ium-2-yl)penta-2,4-dienylidene]indol-1-yl]hexanamide;hexafluorophosphate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~125 mg/mL (~134.55 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.0764 mL 5.3818 mL 10.7637 mL
5 mM 0.2153 mL 1.0764 mL 2.1527 mL
10 mM 0.1076 mL 0.5382 mL 1.0764 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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