Cyanosafracin B

目录号: V41388 纯度: ≥98%
Cyanosafracin B 是合成 Ecteinascidin ET-743 和 Phthalascidin Pt-650 的起始原料。
Cyanosafracin B CAS号: 96996-50-8
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
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产品描述
氰沙法林B是合成Ecteinascidin ET-743和Phthalascidin Pt-650的起始原料。
氰沙法林B是一种天然抗生素化合物,由荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)产生,属于沙法林类抗肿瘤药物。它是合成Ecteinascidin ET-743(曲贝替定,Yondelis)和Phthalascidin Pt-650的前体分子。氰沙法林B通过干扰DNA合成,表现出强效的细胞毒性和抗菌活性。它是工业合成曲贝替定的关键起始原料,曲贝替定是一种已获批准的抗癌药物,用于治疗软组织肉瘤(脂肪肉瘤和平滑肌肉瘤)。该化合物的复杂分子结构包含多个稠合环和功能基团。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cyanosafracin B is a DNA-interacting agent that exhibits potent cytotoxic activity by interfering with DNA synthesis. As a member of the safracin family, it binds to DNA and disrupts replication and transcription processes, leading to cell death. The compound's mechanism of action is similar to that of trabectedin, which binds to the minor groove of DNA and interferes with transcription-coupled nucleotide excision repair. Cyanosafracin B is a precursor to trabectedin and phthalascidin, both of which are DNA binding agents with antitumor activity.
体外研究 (In Vitro)
氰沙法辛B通过干扰DNA合成,在体外表现出强效的细胞毒性和抗菌活性。该化合物是曲贝替定(ET-743)的前体,曲贝替定具有明确的抗肿瘤活性。氰沙法辛B是合成酞菁Pt-650和依克替纳西定ET-743的起始原料。该化合物的活性已在多种体外细胞毒性和抗菌活性试验中得到证实。
体内研究 (In Vivo)
作为一种合成前体,氰沙法辛B本身并不直接用作治疗药物。然而,其衍生物曲贝替定(ET-743)已在体内展现出强大的抗肿瘤活性,并获批用于治疗软组织肉瘤。曲贝替定对既往接受过治疗的晚期软组织肉瘤患者(包括脂肪肉瘤和平滑肌肉瘤)也显示出疗效。由于氰沙法辛B主要用作药物合成的起始原料,因此其自身的体内活性尚未得到充分研究。
酶活实验
使用多种癌细胞系进行氰黄素B的细胞毒性试验。将细胞接种于96孔板中,并用不同浓度的氰黄素B处理48-72小时。采用MTT、CCK-8或CellTiter-Glo法评估细胞活力。IC50值由浓度-效应曲线计算得出。使用标准肉汤微量稀释法评估该化合物对多种细菌菌株的抗菌活性。可使用DNA结合试验(例如凝胶迁移试验或荧光嵌入试验)研究其与DNA相互作用的机制。
细胞实验
氰黄素B的细胞毒性检测采用多种癌细胞系。将细胞用该化合物处理24-72小时后,检测细胞活力。通过Annexin V/PI染色评估细胞凋亡。采用碘化丙啶染色进行细胞周期分析。通过测量γ-H2AX灶的形成来评估DNA损伤。可通过测量标记核苷酸(例如[3H]-胸苷或EdU)的掺入来评估该化合物对DNA合成的影响。可使用耐药细胞系研究耐药机制。
动物实验
作为一种合成前体,氰黄素B通常不用于动物药效研究。然而,其衍生物曲贝替定已在小鼠异种移植模型和临床试验中得到广泛研究。在临床前研究中,曲贝替定在多种异种移植模型中均显示出抗肿瘤活性,包括肉瘤、乳腺癌和卵巢癌。该化合物的疗效、安全性和药代动力学已在广泛的临床开发项目中得到充分表征。
药代性质 (ADME/PK)
氰黄素B的分子式为C29H35N5O6,分子量为549.62。它是合成酞菁素Pt-650和依克替那素ET-743(曲贝替定)的起始原料。该化合物在水中的溶解度有限(25℃时为0.22 g/L)。它通常用作化学合成的研究试剂和参考标准品。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于氰黄素B是一种合成前体,因此其毒理学数据有限。然而,其衍生物曲贝替定已在毒理学研究中得到广泛表征。曲贝替定与肝毒性、骨髓抑制和横纹肌溶解症相关。鉴于其细胞毒性,该化合物应在实验室中采取适当的安全预防措施进行操作。作为一种DNA相互作用剂,它可能具有遗传毒性。
参考文献

[1]. Synthesis of ecteinascidin ET-743 and phthalascidin Pt-650 from cyanosafracin B. Org Lett. 2000 Aug 10;2(16):2545-8.

其他信息
氰黄素B是由荧光假单胞菌产生的一种天然抗生素。它是工业合成曲贝替定(ET-743,Yondelis)的关键起始原料,曲贝替定是一种已获批准用于治疗软组织肉瘤的抗癌药物。该化合物也用于合成酞菁Pt-650。它通过干扰DNA合成而表现出强效的细胞毒性和抗菌活性。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H35N5O6
分子量
549.61810708046
精确质量
549.258
CAS号
96996-50-8
PubChem CID
11353355
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
0.6
tPSA
158
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
40
分子复杂度/Complexity
1220
定义原子立体中心数目
6
SMILES
C([C@H]1C2C(C(=C(C(C=2C[C@H]2[C@@H]3N(C)[C@H]([C@@H](N12)C#N)CC1C=C(C(=C(C3=1)O)OC)C)=O)C)OC)=O)NC(=O)[C@@H](N)C
InChi Key
BHINEHROXMLHMV-BVRLQDJESA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H35N5O6/c1-12-7-15-8-17-19(10-30)34-18(23(33(17)4)21(15)25(36)27(12)39-5)9-16-22(20(34)11-32-29(38)14(3)31)26(37)28(40-6)13(2)24(16)35/h7,14,17-20,23,36H,8-9,11,31H2,1-6H3,(H,32,38)/t14-,17-,18-,19-,20-,23-/m0/s1
化学名
(2S)-2-amino-N-[[(1R,2S,10R,12R,13S)-12-cyano-19-hydroxy-7,18-dimethoxy-6,17,21-trimethyl-5,8-dioxo-11,21-diazapentacyclo[11.7.1.02,11.04,9.015,20]henicosa-4(9),6,15(20),16,18-pentaen-10-yl]methyl]propanamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~25 mg/mL (~45.49 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8194 mL 9.0972 mL 18.1944 mL
5 mM 0.3639 mL 1.8194 mL 3.6389 mL
10 mM 0.1819 mL 0.9097 mL 1.8194 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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