D-Ala-D-Ala

别名: D-丙氨酰-D-丙氨酸;D-丙氨酸-D-丙氨酸
目录号: V43804 纯度: ≥98%
D-Ala-D-Ala构成肽聚糖单体的肽部分的末端,并作为底物参与转肽反应。
D-Ala-D-Ala CAS号: 923-16-0
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
50mg
100mg
500mg
1g
Other Sizes

Other Forms of D-Ala-D-Ala:

  • H-丙氨酸-D-丙氨酸羟基
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产品描述
D-丙氨酸-D-丙氨酸(D-Ala-D-Ala)构成肽聚糖单体肽段的末端,并作为底物参与转肽反应。D-丙氨酸-D-丙氨酸由D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶催化。D-丙氨酸-D-丙氨酸是一种内源性细菌代谢产物。
D-丙氨酸-D-丙氨酸(CAS:923-16-0)是一种二肽,由两个D-丙氨酸分子通过肽键连接而成。其分子式为C6H12N2O3,分子量为160.17。D-丙氨酸-D-丙氨酸是一种内源性细菌代谢产物。它构成肽聚糖单体肽段的末端,并作为底物参与转肽反应。它存在于革兰氏阳性菌细胞壁肽聚糖侧链五肽的茎端。D-丙氨酸-D-丙氨酸用于亲和层析和抗生素(如替考拉宁、利斯托霉素和万古霉素)结合机制的研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
D-Ala-D-Ala does not have a direct biological target as a drug. Its significance lies in its role as a structural component of bacterial cell walls. It is the terminal dipeptide moiety of peptidoglycan in bacterial cell walls and is a target of certain antibacterial agents. Antibiotics such as vancomycin bind to D-Ala-D-Ala, inhibiting cell wall synthesis. The enzyme D-Alanine-D-Alanine ligase catalyzes the formation of D-Ala-D-Ala. Replacement of D-Ala-D-Ala with D-Ala-D-lactate reduces the affinity of vancomycin, leading to resistance.
体外研究 (In Vitro)
D-丙氨酸-D-丙氨酸(D-Ala-D-Ala)本身不具有直接的体外药理活性。它是一种细菌内源性代谢产物,也是肽聚糖的组成成分。其价值在于可作为D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶酶活性测定的底物,以及作为亲和层析法研究抗生素结合的配体。它还被用于研究细菌细胞壁合成以及万古霉素等抗生素的作用机制。
体内研究 (In Vivo)
D-丙氨酸(D-Ala)本身不具有体内生物活性,不作为治疗药物。它是细菌的内源性代谢产物。作为细菌细胞壁的组成成分,它是抗生素的作用靶点。该化合物本身不作为药物用于动物或人类。其生物学意义在于其在细菌生理学中的作用以及作为抗菌药物的作用靶点。
酶活实验
利用D-丙氨酸-D-丙氨酸(D-Ala-D-Ala)进行体外试验,以研究抗生素的结合。亲和层析柱固定有D-Ala-D-Ala,用于纯化和研究万古霉素、替考拉宁和利斯托霉素等抗生素的结合。结合试验可采用表面等离子共振(SPR)或等温滴定量热法(ITC)测定抗生素与D-Ala-D-Ala的亲和力。D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶的酶活性测定以D-Ala-D-Ala为产物,用于测定酶活性。
细胞实验
由于D-丙氨酸-D-丙氨酸(D-Ala-D-Ala)是细菌细胞壁的组成成分,而非药理活性物质,因此通常不进行基于细胞的D-Ala-D-Ala检测。然而,细菌培养可用于研究靶向D-Ala-D-Ala的抗生素(例如万古霉素)的作用。可通过测量细菌生长或使用检测细胞壁损伤的荧光探针来评估细胞壁合成的抑制情况。这些检测方法可用于评价抗生素活性和耐药机制。
动物实验
由于D-Ala-D-Ala并非治疗药物,因此不适用于体内动物实验。然而,可以使用细菌感染动物模型来研究靶向D-Ala-D-Ala的抗生素(例如万古霉素)的疗效。感染动物接受抗生素治疗后,评估细菌清除率、存活率和组织病理学变化。实验中不直接给动物服用该化合物。
药代性质 (ADME/PK)
D-Ala-D-Ala 不具有药代动力学性质,因为它并非治疗药物。该化合物的分子式为 C6H12N2O3,分子量为 160.17,为白色至类白色固体。溶解性:溶于水和二甲基亚砜 (DMSO)。储存:-20°C,防潮。该化合物仅用作研究试剂,不可用于人体。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
D-Ala-D-Ala 的毒理学数据不适用,因为该化合物并非治疗药物。它是一种细菌代谢产物,仅供研究使用。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施。该化合物仅供研究使用,不得用于人体治疗。目前尚无具体的 LD50 或毒性数据。
参考文献

[1]. Structure of D-alanine-D-alanine ligase from Thermus thermophilus HB8: cumulative conformational change and enzyme-ligand interactions. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2009 Oct;65(Pt 10):1098-106.

[2]. DD-ligases as a potential target for antibiotics: past, present and future. Curr Med Chem. 2009;16(20):2566-80.

其他信息
D-丙氨酰-D-丙氨酸是一种二肽,由D-丙氨酸和一个连接在其α-氮原子上的D-丙氨酰残基组成。它是细菌肽聚糖的组成部分,也是抗菌药物研发的重要靶点。它是大肠杆菌的代谢产物,是D-丙氨酰-D-丙氨酸的两性离子互变异构体。D-丙氨酰-D-丙氨酸存在于大肠杆菌K12和MG1655菌株中,或由其产生。据报道,D-丙氨酰-D-丙氨酸也存在于水稻(Oryza officinalis)、大粒稻(Oryza grandiglumis)和其他具有相关数据的生物体中。D-丙氨酰-D-丙氨酸的CAS号为923-16-0,分子式为C6H12N2O3,分子量为160.17。它是一种由两个D-丙氨酸分子组成的二肽。它是细菌内源性代谢产物,也是细菌细胞壁肽聚糖的末端二肽部分。它是万古霉素等抗生素的作用靶点。它用于亲和层析和结合机制研究。纯度:通常≥98%。仅供研究用途,不可用于人体。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C6H12N2O3
分子量
160.17108
精确质量
160.085
CAS号
923-16-0
相关CAS号
D-Ala-Ala;1115-78-2
PubChem CID
5460362
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.208 g/cm3
沸点
402.6ºC at 760 mmHg
熔点
286 - 288ºC
闪点
197.3ºC
LogP
0.014
tPSA
92.42
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
11
分子复杂度/Complexity
169
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C[C@H](C(=O)N[C@H](C)C(=O)O)N
InChi Key
DEFJQIDDEAULHB-QWWZWVQMSA-N
InChi Code
InChI=1S/C6H12N2O3/c1-3(7)5(9)8-4(2)6(10)11/h3-4H,7H2,1-2H3,(H,8,9)(H,10,11)/t3-,4-/m1/s1
化学名
(2R)-2-[[(2R)-2-aminopropanoyl]amino]propanoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O : ~100 mg/mL (~624.34 mM)
DMSO : ~2 mg/mL (~12.49 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 6.2434 mL 31.2168 mL 62.4337 mL
5 mM 1.2487 mL 6.2434 mL 12.4867 mL
10 mM 0.6243 mL 3.1217 mL 6.2434 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们