dGTP (2'-Deoxyguanosine-5'-triphosphate)

目录号: V55129 纯度: ≥98%
dGTP(2'-脱氧鸟苷-5'-三磷酸)是一种鸟苷核苷酸,用于合成/制备脱氧核糖核酸。
dGTP (2'-Deoxyguanosine-5'-triphosphate) CAS号: 2564-35-4
产品类别: Nucleoside Antimetabolite/Analog
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
500mg
1g
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产品描述
dGTP(2'-脱氧鸟苷-5'-三磷酸)是一种鸟苷核苷酸,用于合成/制备脱氧核糖核酸(DNA)。鸟苷核苷酸(GDP、GTP、dGDP、dGTP)对氧化损伤高度敏感,易被氧化为8-O-GDP、8-O-dGTP、8-O-GTP和8-O-dGTP。dGTP(2'-脱氧鸟苷-5'-三磷酸,CAS 2564-35-4)是一种天然存在的脱氧核糖核苷酸,是DNA合成的四种基本组成单元之一。其分子式为C10H16N5O13P3,分子量为507.18 g/mol。dGTP是DNA聚合酶的底物,在DNA复制和修复过程中,它会被掺入正在生长的DNA链中,位于胞嘧啶的对面。它在细胞DNA代谢中发挥着至关重要的作用,是所有涉及DNA扩增和测序的分子生物学应用的基础。dGTP也是嘌呤代谢的关键中间体。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary biological target of dGTP is DNA polymerase, the enzyme responsible for DNA synthesis. dGTP serves as a substrate for DNA polymerases during DNA replication, where it is incorporated into the newly synthesized DNA strand complementary to the template guanine residue. Additionally, dGTP is a substrate for reverse transcriptases in retroviruses. The nucleotide also functions as a substrate for various other enzymes involved in nucleic acid metabolism, including terminal deoxynucleotidyl transferase and DNA repair enzymes.
体外研究 (In Vitro)
dGTP在无细胞体系中作为DNA聚合酶的底物表现出强大的体外活性。在聚合酶链式反应(PCR)中,dGTP通常以200-400 μM的浓度掺入扩增的DNA产物中。该核苷酸能够促进高效的DNA合成,其掺入率取决于所使用的特定DNA聚合酶。dGTP还可用作DNA测序反应、体外转录系统以及各种核酸扩增技术(包括环介导等温扩增(LAMP)和滚环扩增)的底物。
体内研究 (In Vivo)
dGTP是一种存在于所有活细胞中的内源性代谢物,它本身并不作为药物发挥直接的细胞活性。在细胞培养应用中,通常无需外源添加dGTP,因为细胞可以通过从头合成和补救途径合成自身的核苷酸库。然而,在无细胞体系中,dGTP可以用于体外DNA合成反应。在细胞环境中,dGTP水平受到严格调控,以确保DNA复制的准确性,dGTP库的失衡会导致突变和基因组不稳定。
酶活实验
dGTP的标准体外检测方法是将其用作DNA聚合酶反应的底物。在PCR反应中,通常将四种dNTP(dATP、dCTP、dGTP、dTTP)的浓度均为200 μM,反应缓冲液包含10-50 mM KCl、1.5-2.5 mM MgCl₂、0.01%明胶或BSA、0.2 μM引物以及1-2.5单位的DNA聚合酶。反应体系进行热循环:94°C变性30秒,55-65°C退火30秒,72°C延伸1分钟/kb,重复25-40个循环。在DNA测序中,dGTP与双脱氧链终止剂一起用于Sanger测序。
细胞实验
在细胞培养中,由于细胞自身能够合成核苷酸,因此通常无需向培养基中添加dGTP。然而,dGTP可用于基于细胞的检测方法来研究核苷酸代谢。将细胞培养于合适的培养基(例如,含10% FBS的DMEM培养基)中,并用核苷酸合成抑制剂处理。提取后,可通过高效液相色谱(HPLC)或液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)测定细胞内dGTP水平。通过使用核苷转运蛋白调节dGTP的细胞内浓度,或通过抑制参与dGTP合成或降解的酶,可以评估dGTP对细胞功能的影响。
动物实验
dGTP是一种天然代谢产物,在动物实验中不作为药物使用。然而,放射性标记或荧光标记的dGTP可用于动物实验,以追踪DNA合成和细胞增殖。典型的实验方案是向小鼠静脉注射标记的dGTP(例如[3H]-dGTP或BrdU),剂量为50-200 mg/kg。在不同时间点(1-24小时)采集组织,并通过闪烁计数或免疫组织化学方法分析其掺入DNA的情况。
药代性质 (ADME/PK)
dGTP是一种内源性核苷酸,在细胞内周转迅速。细胞内dGTP浓度受到严格调控,在哺乳动物细胞中通常为10-50 μM。dGTP可通过核糖核苷酸还原酶由GDP合成,也可通过补救途径由鸟嘌呤合成。该核苷酸会被核苷酸磷酸酶迅速代谢,并在数分钟内从循环中清除。外源性dGTP在血浆中迅速去磷酸化,由于其带负电荷的三磷酸基团,难以被细胞有效摄取。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
dGTP是一种内源性细胞代谢产物,在生理浓度下不被认为具有毒性。dGTP池的失衡会导致突变和基因组不稳定,从而促进癌症的发生发展。高浓度的dGTP可通过反馈调节抑制核糖核苷酸还原酶。在实验室中,dGTP作为一种毒性极低的标准实验室化学品进行操作。该化合物未被列为危险品,但在处理核苷酸溶液时仍应采取标准预防措施。
参考文献

[1]. Nucleoside Diphosphate Kinase Escalates A-to-C Mutations in MutT-Deficient Strains of Escherichia coli. J Bacteriol. 2019;202(1):e00567-19. Published 2019 Dec 6.

其他信息
DGTP是一种嘌呤2'-脱氧核苷5'-三磷酸,其核碱基为鸟嘌呤。它是人类、酿酒酵母、大肠杆菌、小鼠、拟南芥和植物的代谢产物。它是一种嘌呤2'-脱氧核苷5'-三磷酸、鸟苷脱氧核苷酸和脱氧鸟苷磷酸。它是dGTP(3-)的共轭酸。dGTP存在于大肠杆菌(K12菌株、MG1655菌株)中或由其产生。已有报道称人类体内存在2'-脱氧鸟苷-5'-三磷酸,并有相关数据可供参考。 dGTP存在于酿酒酵母中或由其产生。dGTP是分子生物学中的基础试剂,广泛用于PCR、DNA测序、cDNA合成、DNA标记和各种核酸扩增技术。该化合物以多种盐形式存在,包括二钠盐和锂盐。dGTP也是商业PCR预混液和DNA聚合酶反应缓冲液的关键成分。它并非治疗药物,也未获得任何用于人体的监管批准。通常需要在-20°C的中性pH缓冲液中储存以防止降解。本产品仅供研究和诊断应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H16N5O13P3
分子量
507.18
精确质量
506.995
CAS号
2564-35-4
相关CAS号
Deoxyguanosine triphosphate trisodium salt;93919-41-6
PubChem CID
135398599
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
密度
2.63g/cm3
沸点
989.5ºC at 760 mmHg
闪点
552.2ºC
蒸汽压
0mmHg at 25°C
折射率
1.904
LogP
0.151
tPSA
313.96
氢键供体(HBD)数目
7
氢键受体(HBA)数目
15
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
895
定义原子立体中心数目
3
SMILES
OP(OP(OP(OC[C@H]1[C@H](O)C[C@H](N2C=NC3C(N=C(NC2=3)N)=O)O1)(O)=O)(O)=O)(O)=O
InChi Key
HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H16N5O13P3/c11-10-13-8-7(9(17)14-10)12-3-15(8)6-1-4(16)5(26-6)2-25-30(21,22)28-31(23,24)27-29(18,19)20/h3-6,16H,1-2H2,(H,21,22)(H,23,24)(H2,18,19,20)(H3,11,13,14,17)/t4-,5+,6+/m0/s1
化学名
[[(2R,3S,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9717 mL 9.8584 mL 19.7169 mL
5 mM 0.3943 mL 1.9717 mL 3.9434 mL
10 mM 0.1972 mL 0.9858 mL 1.9717 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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