Dansylcadaverine

别名: 丹酰尸胺; N-(5-氨基戊基)-5-(二甲基氨基)萘-1-磺酰胺; 5-二甲基氨基萘-1-(n-(5-氨基戊基))磺酰胺; N-丹酰-1,5-戊二胺;丹酰戊二胺;DANSYL 尸胺
目录号: V34148 纯度: ≥98%
Dansylcadaverine (Monodansyl cadaverine) 是一种自发荧光化合物,用于标记自噬液泡。
Dansylcadaverine CAS号: 10121-91-2
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
丹酰尸胺(单丹酰尸胺)是一种自发荧光化合物,用于标记自噬体。丹酰尸胺是转谷氨酰胺酶的高亲和力底物,可阻断多种配体的受体介导内吞作用。
丹酰尸胺(单丹酰尸胺,DNC)是二氨基戊烷的荧光萘磺酰胺衍生物,最初被开发为转谷氨酰胺酶介导的纤维蛋白交联的特异性抑制剂,作为转谷氨酰胺酶的荧光氨基底物[1]。
它是一种阳离子荧光探针,可与细菌脂多糖和脂质A结合,并可被其他对内毒素具有亲和力的化合物竞争性置换[5]。
该化合物对中国仓鼠卵巢细胞的细胞黏附具有抑制作用,并干扰钙调蛋白依赖性过程[4]。
由于其荧光特性,它已被用作标记自噬液泡和研究各种细胞类型中自噬的工具[2][3]。
生物活性&实验参考方法
靶点
Transglutaminase (serves as a glutaminyl substrate; guinea pig liver transglutaminase) - no specific IC50/Ki values provided for this enzymatic reaction [1]
Transglutaminase (serves as an aminyl substrate) - no specific IC50/Ki values provided [4]
Calmodulin (antagonizes calmodulin-dependent activation of phosphodiesterase) - apparent Ki for calmodulin-stimulated phosphodiesterase: 120 μM [4]
Lipid A (bacterial lipopolysaccharide) - binding with Kd ranging from 16 μM to 26 μM [5]
Core glycolipid (from Salmonella minnesota Re595) - binding with Kd ranging from 22 μM to 28 μM [5]
体外研究 (In Vitro)
丹酰尸胺能够完全抑制纤维蛋白分子的交联,并作为转谷氨酰胺酶的底物,这已通过其抑制活性得到证实[2]。丹酰尸胺是一种阳离子荧光探针,可与脂质A和细菌脂多糖结合。其他对内毒素具有亲和力的物质可以竞争性地取代它[3]。
丹酰尸胺是转谷氨酰胺酶的特异性谷氨酰胺底物,可以荧光标记到胸腺素β4上。胸腺素β4的两个谷氨酰胺残基(Gln-23和Gln-36)主要参与转谷氨酰胺酶反应,而Gln-39的衍生化效率较低。标记衍生物(TG47、TG48、TG51、TG55)能够抑制G-肌动蛋白的聚合[1]。
丹酰尸胺(100-500 μM)以可逆的剂量依赖性方式抑制中国仓鼠卵巢(CHO)细胞在血清包被的基质上的黏附。抑制50%黏附所需的浓度约为300 μM。在100 μM时,未观察到对细胞黏附的影响;在300 μM时,黏附显著受到抑制(15分钟时仅有20%的细胞黏附);在500 μM时,黏附完全受到抑制。该化合物还能诱导形态学变化,包括 500 μM 浓度下圆形和脱落细胞数量的增加 [4]。
丹酰尸胺 (50-100 μM) 以剂量依赖的方式抑制钙调蛋白刺激的脑环核苷酸磷酸二酯酶活性,表观 Ki 值为 120 μM,但不抑制基础磷酸二酯酶活性 [4]。
丹酰尸胺 与明尼苏达沙门氏菌的脂质 A 结合,表观化学计量比为两个等效结合位点,Kd 值为 16.6 × 10⁻⁶ M(通过 Scatchard 分析)或 26 × 10⁻⁶ M(通过 Scatchard 型图)。向丹酰尸胺中添加脂质A可显著增强荧光强度,并伴随发射峰蓝移,稳态发射偏振值从0.031增加到0.157 [5]。
丹酰尸胺与明尼苏达沙门氏菌Re595的核心糖脂(CGL)结合,具有三个看似等效的结合位点,其Kd值分别为22 × 10⁻⁶ M(Scatchard分析)或28.8 × 10⁻⁶ M(Scatchard型图)[5]。
丹酰尸胺可被多粘菌素B以双相方式从脂质A上置换下来,置换曲线表明多粘菌素在脂质A上存在两类不同的结合位点,对应的Kd值分别为0.4 × 10⁻⁶ M和1.5 × 10⁻⁶ M。高亲和力和低亲和力相互作用的表观解离常数分别为 10⁻⁶ M 和 5.8 × 10⁻⁶ M [5]。
丹酰尸胺 可被多粘菌素 B 从核心糖脂中置换出来,表观解离常数分别为 1.1 × 10⁻⁶ M 和 5.8 × 10⁻⁶ M [5]。
丹酰尸胺 (50 μmol/l) 用于标记 MCF7 细胞中的酸性囊泡细胞器(自噬小泡)。将细胞与 MDC 在 37°C 下孵育 15 分钟,然后用 PBS 洗涤,最后在荧光显微镜下观察。 CuO NPs(4、6、12 μg/ml)以剂量依赖的方式诱导自噬,MDC 染色显示[2]。
丹酰尸胺染色用于检测用 CYT997(100 nM,24 小时)处理的 HNSCC 细胞(HN12)中的自噬空泡,结果显示药物处理细胞的细胞质和核周区域存在点状结构[3]。
酶活实验
转谷氨酰胺酶活性通过Ca²⁺依赖性地将[³H]丹酰尸胺(15,000 dpm/pmol)掺入酪蛋白来测定。反应混合物包含20 mM Tris-HCl (pH 7.4)、2 mg/ml N,N-二甲基酪蛋白、0.8 μM [³H]丹酰尸胺、15 mM β-巯基乙醇以及5 mM EGTA或5 mM CaCl₂。所有检测均与时间和蛋白质浓度呈线性关系[4]。
通过测量在1 mM CaCl₂、40 mM Tris-HCl (pH 8.0)、1.5 mM脑钙调蛋白、1.25 mg/ml牛血清白蛋白和不同浓度丹酰尸胺(0-500 μM)存在下,[³H]cGMP (2.5 μM)转化为[³H]鸟苷的时间依赖性转化率来测定钙调蛋白刺激的脑环核苷酸磷酸二酯酶活性[4]。
对于结合研究,通过在100 mM磷酸盐缓冲液(pH 7.4)中进行荧光滴定来测定丹酰尸胺与脂质A和核心糖脂的结合参数。激发波长为340 nm。由于非线性双倒数图[5],需要使用基于数据点的二次函数模型,通过单纯形函数最小化算法对Fₘ(单位探针浓度下结合探针的荧光产率)进行非线性外推。
使用丹酰尸胺进行置换实验时,探针的摩尔过量为10-12倍,以确保脂质A或CGL具有较高的结合/游离比。占有率计算公式为(F - F₀)/(Fₘₐₓ - F₀),其中F₀为单独丹酰尸胺的荧光强度,Fₘₐₓ为存在脂质A时的荧光强度,F为不同置换剂浓度下的荧光强度。采用Horovitz-Levitzki法分析位移数据[5]。胸腺素β₄与丹酰尸胺的转谷氨酰胺化反应通过将120 μM胸腺素β₄与5 mM丹酰尸胺在含有10 mM Tris-HCl(pH 7.4)、15 mM CaCl₂和3 mM DTT的缓冲液中孵育进行。加入0.1 U转谷氨酰胺酶启动反应。在指定时间点,取等分试样用0.1% TFA稀释以终止反应,并用高效液相色谱法(HPLC)进行分析[1]。
细胞实验
在细胞黏附实验中,用[³H]亮氨酸代谢标记的CHO细胞与丹酰尸胺(100-500 μM)预孵育30分钟,然后在药物持续存在的情况下检测其在塑料组织培养皿上的黏附情况。分别在15、30、60和90分钟时测量细胞黏附情况。细胞活力采用台盼蓝排除法测定[4]。
在自噬检测中,将MCF7细胞(2.4 × 10⁴)接种于35 mm培养皿中。孵育24小时后,在有或无3-MA(自噬抑制剂)的情况下,加入浓度递增的CuO纳米颗粒(4、6、12 μg/ml),并观察不同时间段。将细胞在 37°C 下与 50 mmol/L 丹酰尸胺 (MDC) 孵育 15 分钟,然后用 1× PBS 洗涤三次,每次间隔 5 分钟。在荧光显微镜下观察细胞 [2]。
为了测量自噬通量,将 MCF7 细胞用 pBABE-puro mCherry-EGFP-LC3B 质粒转染 16 小时,然后用 12 μg/mL 的 CuO 纳米颗粒处理不同时间,处理过程中加入或不加入抑制剂。处理后,洗涤细胞,将其封片于载玻片上,并在荧光显微镜下观察 EGFP 和 m-Cherry 的表达 [2]。
对于头颈部鳞状细胞癌 (HNSCC) 细胞的研究,将 HN12 细胞在有或无 20 μM 羟氯喹 (HCQ) 的情况下,用 100 nM CYT997 处理 24 小时。通过丹酰尸胺染色检测自噬,并在荧光显微镜下观察细胞,以检测细胞质和核周区域的点状结构[3]。
在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)细胞活力检测中,将细胞与丹酰尸胺(作为自噬检测的一部分)和CYT997联合处理。采用MTS法和流式细胞术,使用胺反应性荧光染料Zombie Aqua™检测细胞活力。采用流式细胞术,使用Annexin V-FITC染色和Western blot,使用针对裂解型PARP的抗体检测细胞凋亡[3]。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
浓度高达 500 μM 的丹酰尸胺预孵育 30 分钟后,对 CHO 细胞活力没有影响(台盼蓝排除法测定,所有测试浓度下细胞活力均 >95%)[4]。
丹酰尸胺处理(500 μM,30 分钟)对 CHO 细胞的影响是可逆的;药物稀释 20 倍后,细胞能够贴壁、铺展,并达到与未处理细胞无异的形态[4]。
参考文献

[1]. Thymosin beta(4) serves as a glutaminyl substrate of transglutaminase. Labeling with fluorescentdansylcadaverine does not abolish interaction with G-actin. FEBS Lett. 1999 Dec 24;464(1-2):14-20.

[2]. Interplay between autophagy and apoptosis mediated by copper oxide nanoparticles in human breast cancer cells MCF7. Biochim Biophys Acta. 2014 Jan;1840(1):1-9.

[3]. Autophagy blockade sensitizes human head and neck squamous cell carcinoma towards CYT997 through enhancing excessively high reactive oxygen species-induced apoptosis. J Mol Med (Berl). 2018;96(9):929-938.

[4]. Inhibition of the adhesion of Chinese hamster ovary cells by the naphthylsulfonamides dansylcadaverine and N-(6-aminohexyl)-5-chloro-1-naphthylenesulfonamide (W7). Biochim Biophys Acta. 1983;762(3):414-419.

[5]. Analysis of the binding of polymyxin B to endotoxic lipid A and core glycolipid using a fluorescent displacement probe. Biochim Biophys Acta. 1992;1165(2):147-152.

其他信息
单丹硫代氨基甲酸酯是一种磺酰胺,由5-(二甲氨基)萘-1-磺酸的磺酸基团与尸胺的氨基缩合而成。它可用作荧光染料、保护剂和EC 2.3.2.13(蛋白质-谷氨酰胺γ-谷氨酰转移酶)抑制剂。它是一种磺酰胺、氨基萘、叔胺和伯胺化合物。其功能与尸胺相关。
丹酰尸胺最初是作为一种特异性抑制转谷氨酰胺酶介导的纤维蛋白交联的抑制剂而开发的。其抑制活性反映了其作为转谷氨酰胺酶底物并竞争性阻断纤维蛋白分子交联的能力[4]。
丹酰尸胺已被报道是多种分子受体介导内吞作用的强效抑制剂,包括α₂-巨球蛋白、表皮生长因子、儿茶酚胺、胰岛素、三碘甲状腺原氨酸和水疱性口炎病毒[4]。
丹酰尸胺和结构相关的化合物W7(N-(6-氨基己基)-5-氯-1-萘磺酰胺)均为萘磺酰胺类化合物,可抑制钙调蛋白依赖性过程。 W7 拮抗钙调蛋白的效力大约是丹酰尸胺的 4 倍(表观 Ki 为 30 μM 对 120 μM)[4]。
丹酰尸胺在细胞内浓度下(例如,在人血小板中约为 500 μM)可作为转谷氨酰胺酶的谷氨酰胺底物。胸腺素β₄很可能在体内作为因子XIIIa的谷氨酰胺底物[1]。
丹酰尸胺可用作置换探针,定量分析各种物质与脂质A和内毒素的相互作用,为筛选具有脂质A拮抗特性的化合物提供了一种便捷的方法[5]。
丹酰尸胺(单丹酰尸胺,DNC)由n-5-氨基戊基-5-二甲氨基-1-萘磺酰胺合成。采用石油醚/氯仿/甲醇(2:2:1)展开剂,通过硅胶薄层色谱法验证该化合物为均一化合物。270 MHz ¹H NMR、IR和UV光谱证实了其结构[5]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H25N3O2S
分子量
335.4643
精确质量
335.167
CAS号
10121-91-2
PubChem CID
4247
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.19g/cm3
沸点
505.5ºC at 760mmHg
熔点
137-140ºC
闪点
259.5ºC
蒸汽压
9.54E-11mmHg at 25°C
折射率
1.594
LogP
4.485
tPSA
83.81
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
23
分子复杂度/Complexity
447
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
MLEBFEHOJICQQS-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H25N3O2S/c1-20(2)16-10-6-9-15-14(16)8-7-11-17(15)23(21,22)19-13-5-3-4-12-18/h6-11,19H,3-5,12-13,18H2,1-2H3
化学名
N-(5-aminopentyl)-5-(dimethylamino)naphthalene-1-sulfonamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~62.5 mg/mL (~186.31 mM)
H2O : ~1 mg/mL (~2.98 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.9810 mL 14.9049 mL 29.8098 mL
5 mM 0.5962 mL 2.9810 mL 5.9620 mL
10 mM 0.2981 mL 1.4905 mL 2.9810 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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