DBCO-CONH-S-S-NHS ester

别名: DBCOCONHSSNHS ester; DBCO CONH S S NHS ester
目录号: V39392 纯度: ≥98%
DBCO-CONH-SS-NHS 酯是一种可裂解(可降解)的 ADC(抗体-药物偶联物)接头,可用于制备抗体偶联的活性分子 (ADC)。
DBCO-CONH-S-S-NHS ester CAS号: 1435934-53-4
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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10mg
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产品描述
DBCO-CONH-SS-NHS酯是一种可裂解(可降解)的ADC(抗体-药物偶联物)连接剂,可用于制备抗体偶联活性分子(ADC)。DBCO-CONH-SS-NHS酯是一种点击化学试剂。它含有DBCO基团,可与带有叠氮(N3)基团的化合物发生SPAAC(应变促进的炔-叠氮环加成反应)。
DBCO-CONH-SS-NHS酯是一种异双功能可裂解连接子,包含三个关键功能基团:用于无铜点击化学的二苯并环辛炔(DBCO)基团、用于控制有效载荷释放的二硫键以及用于与伯胺偶联的N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)酯。该连接子专为合成抗体药物偶联物(ADC)和其他生物偶联物而设计,可实现位点特异性偶联和细胞毒性有效载荷的控制释放。DBCO基团无需铜催化剂即可与含叠氮分子发生应变促进的炔-叠氮环加成反应(SPAAC),使其成为生物正交应用的理想选择。NHS酯可选择性地与伯胺(例如抗体上的赖氨酸残基)相互作用。二硫键可实现细胞内裂解和有效载荷释放。
生物活性&实验参考方法
靶点
Antibody lysine residues (via NHS ester); azide-functionalized molecules (via DBCO for SPAAC); the disulfide bond is cleaved intracellularly by reducing agents (e.g., glutathione).
体外研究 (In Vitro)
ADC 细胞毒素通过 ADC 连接器与抗体连接,形成 ADC [1]。
DBCO-CONH-SS-NHS酯是一种可裂解的ADC连接子,它整合了DBCO点击化学基团、二硫键和NHS酯基团。这种组合实现了抗体药物偶联物(ADC)的位点特异性偶联和可控的有效载荷释放。DBCO部分以生物正交的方式与叠氮基团结合,在保持天然生物过程的同时,促进快速选择性偶联。该方法对于构建靶向药物递送系统和诊断检测至关重要。NHS酯基团选择性地与抗体上的伯胺反应,从而实现体外和体内的高效标记和追踪,这对于研究蛋白质在细胞微环境中的动力学、相互作用和定位至关重要。二硫键提供了一种在还原条件下(例如,细胞质中高浓度的谷胱甘肽)控制细胞内药物释放的机制。蛋白质可以标记荧光染料或其他标签,从而拓展出多种成像应用。该连接子本身不具有生物活性。它的功能纯粹是结构性的。
酶活实验
磺基-SPDB是一种化学试剂,而非生物活性化合物,其表征主要通过化学方法而非酶/受体分析进行。HPLC确认其纯度(>95%)。¹H NMR光谱验证了其结构,显示了NHS酯(δ ~2.8 ppm)、吡啶二硫基(吡啶芳香质子δ ~7.2-8.5 ppm)和磺酸基(δ ~3.0-4.0 ppm)的特征信号。质谱(MS)确认其分子量为406.44。NHS酯基团的反应活性和特异性通过与模型伯胺(例如苄胺)在缓冲液(例如PBS,pH 7.4)中反应,并利用LC-MS监测反应物随时间的减少来测试;NHS酯在水性缓冲液中的半衰期通常为1-2小时。吡啶二硫代基团的含量通过硫醇释放试验进行定量:化合物与还原剂(例如二硫苏糖醇,DTT)反应,还原剂还原二硫键,释放出在 343 nm 处有吸收的 2-硫代吡啶酮;浓度使用消光系数 (ε343 = 8,080 M-¹cm-¹) 计算。对于抗体偶联,首先在 pH 8.0 下使 NHS 酯与抗体赖氨酸反应,制备模型抗体药物偶联物 (ADC),然后还原抗体链间二硫键生成游离硫醇,最后与吡啶二硫代基团反应。偶联效率通过 SEC-HPLC 评估,药物抗体比 (DAR) 通过疏水相互作用色谱 (HIC-HPLC) 或 LC-MS 测定。
细胞实验
DBCO-CONH-SS-NHS酯是一种用于合成抗体药物偶联物(ADC)和其他生物偶联物的化学连接剂;它不直接用于基于细胞的检测。最终的ADC或生物偶联物需在基于细胞的检测中进行测试。典型的ADC细胞检测包括对抗原阳性细胞和抗原阴性细胞进行ADC活性测试。将靶细胞以每孔5×10³个细胞的密度接种于96孔板中。加入不同浓度的ADC(通常根据抗体浓度为0.001-100 nM),并孵育72-120小时。使用CellTiter-Glo或MTT法检测细胞活力。计算抗原阳性细胞的IC50值。为了验证二硫键的作用(可裂解机制),可在还原剂(如谷胱甘肽,10 mM)存在下进行检测以增强有效载荷的释放,或在内吞抑制剂(如dynasore)存在下进行检测以阻断活性。对于基于DBCO的点击化学应用,可先用叠氮功能化探针处理细胞,然后加入与荧光团偶联的DBCO-CONH-SS-NHS酯,并通过共聚焦显微镜或流式细胞术观察标记情况。二硫键可被还原剂裂解以释放荧光团。
动物实验
DBCO-CONH-SS-NHS酯不直接用于动物研究。最终的抗体药物偶联物(ADC)或偶联物需进行体内测试。使用该连接子构建的ADC的典型体内实验方案采用小鼠异种移植模型。将5-10×10⁶个抗原阳性肿瘤细胞悬浮于PBS中,并与Matrigel以1:1的比例混合,皮下注射至雌性无胸腺裸鼠体内。当肿瘤体积达到100-200 mm³时,将小鼠随机分为治疗组(n=8-10)。将ADC配制于PBS或合适的载体中,并通过尾静脉注射(iv),剂量为1-10 mg/kg(基于抗体含量)。对照组仅注射载体或非靶向ADC。每3-4天用游标卡尺测量肿瘤体积,并记录体重。通常每周给药一次,持续2-4周。研究结束后,切除肿瘤,称重,并分析靶蛋白表达和有效载荷释放情况。对于成像应用,可将与成像剂(例如近红外染料)偶联的DBCO-CONH-SS-NHS酯注射到携带表达叠氮标记靶向部分的肿瘤的小鼠体内;点击反应在体内发生,并使用体内成像系统(IVIS)可视化信号。
药代性质 (ADME/PK)
DBCO-CONH-SS-NHS酯是一种可裂解的连接子,其药代动力学研究是作为完整的抗体药物偶联物(ADC)或偶联物的一部分进行的。该连接子本身不作为独立实体给药。对于ADC而言,其药代动力学特征主要由抗体部分决定,连接子则影响其稳定性和有效载荷的释放。ADC的药代动力学通常为双相,包括分布相(α相)和末端消除相(β相),基于IgG的ADC的半衰期为4-7天。循环中二硫键的稳定性通过液相色谱-质谱联用(LC-MS)测定血浆中完整ADC与释放的有效载荷浓度随时间的变化来评估。体外血浆稳定性试验:将ADC加入人或小鼠血浆中,在37℃下孵育长达14天,并在多个时间点取样进行分析。DBCO基团在生物体液中稳定。对于小分子偶联物,DBCO基团可与内源性叠氮化物反应或被还原;然而,SPAAC反应具有高度选择性。NHS酯在偶联过程中会发生水解或反应,最终不会出现在偶联产物中。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
DBCO-CONH-SS-NHS酯是一种用于研究的化学连接剂;其毒性评估针对的是完整的抗体药物偶联物(ADC)或偶联物,而非单独的连接剂。对于ADC而言,主要的剂量限制性毒性通常与细胞毒性有效载荷有关(例如,中性粒细胞减少症、周围神经病变、血小板减少症)。二硫键有助于提高安全性,因为它能够使有效载荷靶向释放到肿瘤内部,从而降低全身毒性。在循环系统中过早断裂会增加毒性。DBCO基团被认为是无毒且稳定的。实验室操作时,应按照标准化学安全防护措施处理DBCO-CONH-SS-NHS酯:佩戴手套、实验服和护目镜。NHS酯可与胺类物质(包括皮肤和黏膜中的胺类物质)发生反应,可能引起刺激和致敏。避免吸入和皮肤接触。该化合物应在惰性气氛(氩气或氮气)下于-20℃保存,以防止NHS酯水解和二硫键氧化。溶液应新鲜配制并立即使用。该化合物不适用于人类。目前尚无该特定连接体的详细毒理学数据(LD50、遗传毒性等)。
参考文献

[1]. Strategies and challenges for the next generation of antibody-drug conjugates. Nat Rev Drug Discov. 2017 May;16(5):315-337.

其他信息
DBCO-CONH-SS-NHS酯是一种用途广泛的可裂解连接子,广泛应用于抗体药物偶联物(ADC)、生物偶联物和成像探针的合成。它通过DBCO-SPAAC反应实现无铜点击化学,该反应具有高选择性和快速性,二级反应速率常数高达1 M⁻¹s⁻¹。二硫键允许在还原性环境中(例如,细胞内谷胱甘肽浓度约为1-10 mM,而血浆浓度约为2-20 μM)控制有效载荷的释放。NHS酯用于与抗体、蛋白质或肽上的伯胺基团偶联。该连接子属于不断增长的“可裂解”ADC连接子类别,该类别还包括蛋白酶可裂解连接子(Val-Cit)和pH敏感连接子(腙)。本产品仅供研发用途,不得用于人体治疗。该化合物应储存在-20℃的干燥避光环境中。二硫键易被含硫醇化合物还原;避免与还原剂(如 DTT、TCEP 或 β-巯基乙醇)一起储存。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C28H27N3O6S2
分子量
565.660484552383
精确质量
565.134
CAS号
1435934-53-4
PubChem CID
98233194
外观&性状
White to light yellow solid powder
LogP
1.7
tPSA
164
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
12
重原子数目
39
分子复杂度/Complexity
992
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S(CCNC(CCC(N1C2C=CC=CC=2C#CC2C=CC=CC=2C1)=O)=O)SCCC(=O)ON1C(CCC1=O)=O
InChi Key
RPNGUSKTYYIUDE-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C28H27N3O6S2/c32-24(29-16-18-39-38-17-15-28(36)37-31-26(34)13-14-27(31)35)11-12-25(33)30-19-22-7-2-1-5-20(22)9-10-21-6-3-4-8-23(21)30/h1-8H,11-19H2,(H,29,32)
化学名
(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-[2-[[4-(2-azatricyclo[10.4.0.04,9]hexadeca-1(16),4,6,8,12,14-hexaen-10-yn-2-yl)-4-oxobutanoyl]amino]ethyldisulfanyl]propanoate
别名
DBCOCONHSSNHS ester; DBCO CONH S S NHS ester
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~176.78 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7678 mL 8.8392 mL 17.6785 mL
5 mM 0.3536 mL 1.7678 mL 3.5357 mL
10 mM 0.1768 mL 0.8839 mL 1.7678 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们