DDR-TRK-1

目录号: V32028 纯度: ≥98%
DDR-TRK-1 是盘状受体 1 (DDR1) 的选择性抑制剂,IC50 为 9.4 nM。
DDR-TRK-1 CAS号: 1934246-19-1
产品类别: New2
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产品描述
DDR-TRK-1 是盘状受体 1 (DDR1) 的选择性抑制剂,IC50 为 9.4 nM。DDR-TRK-1 也抑制 TRK 激酶家族。
DDR-TRK-1(CAS号:1934246-19-1)是一种选择性抑制盘状结构域受体1 (DDR1) 的抑制剂,IC50值为9.4 nM。DDR-TRK-1的分子式为C26H23F3N6O,分子量为492.50,它还能抑制TRK激酶家族。DDR-TRK-1是一种化学探针,对DDR1的选择性高于DDR2和Abl1,DDR2和Abl1的IC50值分别为188 nM和>10,000 nM。该化合物能抑制Panc-1胰腺癌细胞的克隆形成和迁移。
生物活性&实验参考方法
靶点
DDR-TRK-1 targets Discoidin Domain Receptor 1 (DDR1), a collagen-activated receptor tyrosine kinase that plays important roles in cell proliferation, migration, and survival. DDR1 is implicated in various pathological processes including cancer progression, fibrosis, and tissue remodeling. DDR-TRK-1 exhibits an IC50 of 9.4 nM for DDR1 and binds to DDR1 with a Kd value of 4.7 nM. The compound is selective for DDR1 over DDR2 (IC50 = 188 nM) and Abl1 (IC50 >10,000 nM). DDR-TRK-1 also inhibits the TRK kinase family.
体外研究 (In Vitro)
DDR-TRK-1 相对于 DDR1 的 IC50 值为 9.4 nM,是一个良好的候选药物。DDR-TRK-1 还表现出合理的药代动力学 (PK) 特征。在大鼠中,口服剂量为 20 mg/kg 时,其口服生物利用度为 66.8%,半衰期 (T1/2) 为 1.25 小时。然而,DDR-TRK-1 在小鼠体内的浓度-时间曲线下面积 (AUC) 值远大于大鼠,表明其在小鼠体内具有较强的吸收性。通过评估 DDR1-IN-3 与 DDR1 蛋白的结合亲和力,进一步验证了 DDR1-IN-3 对 DDR1 的抑制作用。结果表明,DDR-TRK-1 与 DDR1 结合牢固,结合常数 (Kd) 值为 4.7 nM[1]。
体外实验表明,DDR-TRK-1 能有效抑制 DDR1 激酶活性,IC50 值为 9.4 nM,且与 DDR1 的解离常数 Kd 为 4.7 nM。该化合物对 400 种非突变激酶的抑制活性显著降低,表现出优异的选择性。DDR-TRK-1 能抑制 Panc-1 胰腺癌细胞的克隆形成和迁移,表明其具有抑制肿瘤细胞侵袭性的潜力。该化合物还能抑制 TRK 激酶家族,IC50 值为 18-100 nM。该化合物纯度 ≥95%。
体内研究 (In Vivo)
DDR-TRK-1 以剂量依赖的方式抑制博来霉素 (BLM) 引起的这些病理改变。肺组织裂解液中纤维化标志物(如纤连蛋白和 α-平滑肌肌动蛋白 (SMA))的表达水平与这些观察结果相符。进一步研究表明,DDR-TRK-1 的给药可剂量依赖性地降低羟脯氨酸(一种存在于胶原蛋白中的特定氨基酸)的含量。上述所有信息均表明,DDR-TRK-1 在治疗博来霉素诱导的肺纤维化方面具有巨大的治疗潜力 [1]。
在体内实验中,DDR-TRK-1 展现出良好的药代动力学特性,并在博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型中显示出良好的口服治疗效果。该化合物能够抑制 DDR1(纤维化和组织重塑的关键介质),使其成为治疗纤维化疾病的潜在候选药物。其对 DDR1 的选择性优于其他激酶,且具有良好的口服生物利用度,这些都支持其作为治疗纤维化和肿瘤疾病的药物的潜力。
酶活实验
使用纯化的重组DDR1激酶结构域进行DDR-TRK-1受体结合或激酶活性测定。激酶活性通过监测ATP存在下肽底物的磷酸化来测定。将DDR-TRK-1与酶、底物和ATP在合适的激酶测定缓冲液中以不同浓度孵育。终止反应后,使用放射性检测、荧光或发光等方法定量产物生成。IC50值由浓度-效应曲线计算得出。结合亲和力(Kd)使用表面等离子共振(SPR)或等温滴定量热法(ITC)等方法测定。
细胞实验
DDR-TRK-1 的细胞学检测采用表达 DDR1 的癌细胞系,例如 Panc-1 胰腺癌细胞。将细胞培养于合适的培养基中,并用不同浓度的 DDR-TRK-1 处理特定时间。采用 MTT、CellTiter-Glo 或克隆形成实验等标准方法评估细胞活力和增殖能力。采用划痕实验或 Boyden 小室实验评估细胞迁移和侵袭能力。通过 Western blot 检测 DDR1 及其下游信号分子的磷酸化水平来评估 DDR1 信号通路。
动物实验
DDR-TRK-1 的体内研究在纤维化或癌症的小鼠模型中进行,例如博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型。DDR-TRK-1 通过口服或腹腔注射途径,按照既定的剂量和给药方案给药。对于纤维化模型,通过组织学分析、胶原蛋白含量测定和肺功能评估来评价肺纤维化程度。对于癌症模型,通过卡尺测量来监测肿瘤生长。药代动力学参数通过在不同时间点采集的血浆样本进行测定。
药代性质 (ADME/PK)
DDR-TRK-1 的分子量为 492.50,分子式为 C26H23F3N6O。该化合物在临床前模型中展现出良好的药代动力学性质和令人鼓舞的口服治疗效果。该化合物可溶于 DMSO,应储存于 2-8℃。作为一种具有口服生物利用度的选择性 DDR1 抑制剂,DDR-TRK-1 显示出进一步开发用于治疗纤维化和肿瘤疾病的潜力。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
DDR-TRK-1 的全面毒理学数据在公开资料中尚无广泛记载。该化合物仅供研究使用,尚未获准用于人体治疗。在临床前研究中,DDR-TRK-1 已在动物模型中给药,且在用于疗效评估的剂量下未报告显著不良反应。处理该化合物时应遵循标准实验室安全操作规程,包括使用适当的个人防护装备并遵守机构生物安全指南。
参考文献

[1]. Structure-Based Design of Tetrahydroisoquinoline-7-carboxamides as Selective Discoidin Domain Receptor 1 (DDR1) Inhibitors. J Med Chem. 2016 Jun 23; 59(12): 5911–5916.

其他信息
DDR-TRK-1 是一种选择性抑制盘状结构域受体 1 (DDR1) 的化合物,IC50 值为 9.4 nM。它还能抑制 TRK 家族,并且对 DDR1 的选择性高于 DDR2 和 Abl1。DDR-TRK-1 与 DDR1 的解离常数 (Kd) 为 4.7 nM,对 400 种非突变激酶的抑制活性显著降低。该化合物已显示出良好的药代动力学特性,并在博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型中展现出良好的口服治疗效果。DDR-TRK-1 仅供研究用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C26H23F3N6O
分子量
492.495635271072
精确质量
492.188
CAS号
1934246-19-1
PubChem CID
121231414
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
4.1
tPSA
75.9
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
36
分子复杂度/Complexity
763
定义原子立体中心数目
1
SMILES
C[C@H]1CN(CC2=C1C=CC(=C2)C(=O)NC3=CC(=CC(=C3)C(F)(F)F)N4C=C(N=C4)C)C5=CN=CN=C5
InChi Key
CMJJZRAAQMUAFH-INIZCTEOSA-N
InChi Code
InChI=1S/C26H23F3N6O/c1-16-11-34(23-9-30-14-31-10-23)13-19-5-18(3-4-24(16)19)25(36)33-21-6-20(26(27,28)29)7-22(8-21)35-12-17(2)32-15-35/h3-10,12,14-16H,11,13H2,1-2H3,(H,33,36)/t16-/m0/s1
化学名
(4R)-4-methyl-N-[3-(4-methylimidazol-1-yl)-5-(trifluoromethyl)phenyl]-2-pyrimidin-5-yl-3,4-dihydro-1H-isoquinoline-7-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0305 mL 10.1523 mL 20.3046 mL
5 mM 0.4061 mL 2.0305 mL 4.0609 mL
10 mM 0.2030 mL 1.0152 mL 2.0305 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们