Didemnin B

别名: NSC-325319; NSC 325319; Didemnin B
目录号: V19814 纯度: ≥98%
Didemnin B 是一种在海洋被囊类三苯胺蓝细菌中发现的缩酚肽。
Didemnin B CAS号: 77327-05-0
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
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产品描述
Didemnin B 是一种存在于海洋被囊动物三苯胺蓝藻中的环状肽。Didemnin B 可用于癌症相关研究。
Didemnin B(CAS 77327-05-0)是一种从海洋被囊动物 Trididemnum solidum 中分离得到的环状环状肽。它具有强大的抗病毒、抗肿瘤和免疫抑制特性。它通过与延伸因子 1-α (eEF1A) 结合,有效抑制真核生物蛋白质合成。
生物活性&实验参考方法
靶点
Didemnin B targets elongation factor 1-alpha (eEF1A), blocking aminoacyl-tRNA accommodation on the ribosome. This inhibition of protein synthesis is the primary mechanism underlying its antiviral and antitumor activities. It also activates caspase, thereby inducing apoptosis.
体外研究 (In Vitro)
地德宁B对M5076肉瘤、P388白血病和mirine B16黑色素瘤均表现出抗肿瘤活性[1]。体外实验表明,地德宁B是L1210白血病细胞生长的强效抑制剂。在80 nM浓度下,它能抑制HepG2细胞中GRP78蛋白的表达上调,并持续抑制蛋白质合成。它对多种癌细胞系均表现出显著的抗肿瘤活性。
体内研究 (In Vivo)
地德明B是L1210细胞生长的强效抑制剂[1]。
体内研究表明,地德明B对M5076肉瘤、P388白血病和鼠B16黑色素瘤具有抗肿瘤活性。它是一种潜在的抗癌、抗病毒和免疫抑制剂。
酶活实验
体外检测地德明B通常测定其抑制蛋白质合成的能力。将细胞用该化合物处理后,测量放射性标记氨基酸掺入蛋白质的情况。该化合物与eEF1A的结合可通过下拉实验或表面等离子共振实验进行评估。
细胞实验
针对地德明B的细胞活性检测包括用该化合物处理多种癌细胞系,并测量细胞活力、增殖和凋亡情况。该检测旨在评估该化合物抑制蛋白质合成和诱导细胞死亡的能力。
动物实验
地德明B的体内动物研究通常采用小鼠癌症模型。研究评估肿瘤生长抑制、生存率和药效学终点。该化合物对M5076肉瘤、P388白血病和B16黑色素瘤的疗效已得到证实。
药代性质 (ADME/PK)
已在临床前模型中研究了地德明B的药代动力学特性。该化合物的分子式为C₅₇H₈₉N₇O₁₅,分子量为1112.37 g/mol。它是一种环状缩肽,具有复杂的药代动力学特性。大鼠静脉注射LD50为860 pg/kg,小鼠为1530 pg/kg。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
毒性数据
大鼠(静脉注射):LD50:860 pg/kg
小鼠(静脉注射):LD50:1530 pg/kg
犬(静脉注射):LD50:418 g/kg
在临床前研究中评估了二氢吡啶B的毒理学特征。该化合物表现出强效活性,其毒性特征与其作为蛋白质合成抑制剂的作用机制相符。犬的静脉注射LD50为418 g/kg。
参考文献

[1]. A phase I clinical trial of didemnin B. Cancer. 1991;68(12):2550-2554.

[2]. Li LH, Timmins LG, Wallace TL, Krueger WC, Prairie MD, Im WB. Mechanism of action of didemnin B, a depsipeptide from the sea. Cancer Lett. 1984;23(3):279-288.

[3]. Grubb DR, Wolvetang EJ, Lawen A. Didemnin B induces cell death by apoptosis: the fastest induction of apoptosis ever described. Biochem Biophys Res Commun. 1995;215(3):1130-1136.

其他信息
Didemnin B 是一种类似 Didemnin 的化合物,具有代谢产物的功能。据报道,它存在于蓝海鞘(Trididemnum cyanophorum)、固海鞘(Trididemnum solidum)以及其他具有相关数据的生物体中。Didemnin B 是一种从加勒比海鞘(Trididemnum cyanophorum)中提取的环状肽。Didemnin B 可激活 caspase,从而诱导细胞凋亡,并抑制真核延伸因子 2 (eEF-2) 依赖性转位,从而抑制蛋白质合成。该化合物还具有免疫抑制和抗病毒特性。(NCI04)
Didemnin B 是一种具有重要研究价值的海洋天然产物。它尚未获准用于人类治疗,但可作为抗癌和抗病毒药物开发的先导化合物。其作为 eEF1A 抑制剂的作用机制使其成为研究蛋白质合成的宝贵工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C57H89N7O15
分子量
1112.37
精确质量
1111.64
CAS号
77327-05-0
PubChem CID
122651
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.24g/cm3
沸点
1274.4ºC at 760 mmHg
闪点
724.5ºC
折射率
1.569
LogP
3.178
tPSA
287.9
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
15
可旋转键数目(RBC)
15
重原子数目
79
分子复杂度/Complexity
2150
定义原子立体中心数目
13
SMILES
CC[C@H](C)[C@@H]1[C@H](CC(=O)O[C@H](C(=O)[C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N2CCC[C@H]2C(=O)N([C@H](C(=O)O[C@@H]([C@@H](C(=O)N1)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)N(C)C(=O)[C@@H]3CCCN3C(=O)[C@H](C)O)C)CC4=CC=C(C=C4)OC)C)CC(C)C)C)C(C)C)O
InChi Key
KYHUYMLIVQFXRI-SJPGYWQQSA-N
InChi Code
InChI=1S/C57H89N7O15/c1-15-33(8)46-44(66)29-45(67)79-49(32(6)7)48(68)34(9)50(69)58-39(26-30(2)3)54(73)64-25-17-19-41(64)56(75)62(13)43(28-37-20-22-38(77-14)23-21-37)57(76)78-36(11)47(52(71)59-46)60-51(70)42(27-31(4)5)61(12)55(74)40-18-16-24-63(40)53(72)35(10)65/h20-23,30-36,39-44,46-47,49,65-66H,15-19,24-29H2,1-14H3,(H,58,69)(H,59,71)(H,60,70)/t33-,34-,35-,36+,39-,40-,41-,42+,43-,44-,46+,47-,49-/m0/s1
化学名
(2S)-N-[(2R)-1-[[(3S,6S,8S,12S,13R,16S,17R,20S,23S)-13-[(2S)-butan-2-yl]-12-hydroxy-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-2,5,7,10,15,19,22-heptaoxo-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-1-[(2S)-2-hydroxypropanoyl]-N-methylpyrrolidine-2-carboxamide
别名
NSC-325319; NSC 325319; Didemnin B
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~89.90 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.8990 mL 4.4949 mL 8.9898 mL
5 mM 0.1798 mL 0.8990 mL 1.7980 mL
10 mM 0.0899 mL 0.4495 mL 0.8990 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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