EB-3D

别名: EB3D; EB 3D
目录号: V37853 纯度: ≥98%
EB-3D 是一种有效且特异性的胆碱激酶 α (ChoKα) 抑制剂(拮抗剂),对 ChoKα1 的 IC50 为 1 μM。
EB-3D CAS号: 1839150-63-8
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
EB-3D 是一种强效且特异性的胆碱激酶α (ChoKα) 抑制剂(拮抗剂),对 ChoKα1 的 IC50 为 1 μM。EB-3D 可影响 ChoKα 表达、AMPK 激活、细胞凋亡、内质网应激和脂质代谢。EB-3D 在多种 T 细胞白血病细胞系中显示出显著的抗增殖活性,并具有抗癌活性。
EB-3D (CAS 1839150-63-8) 是一种强效且选择性的胆碱激酶α (ChoKα) 抑制剂,ChoKα 是一种催化胆碱磷酸化为磷酸胆碱的酶,而磷酸胆碱的磷酸化是磷脂酰胆碱生物合成的关键步骤。该化合物分子量为519.56 g/mol,分子式为C₂₉H₃₃N₅O₄,可通过干扰磷脂代谢和诱导癌细胞凋亡发挥抗肿瘤活性。EB-3D有望成为治疗那些高度依赖磷脂酰胆碱合成进行膜生物合成和细胞增殖的癌症的有效药物。
生物活性&实验参考方法
靶点
EB-3D targets choline kinase α (ChoKα), a rate-limiting enzyme in the Kennedy pathway for phosphatidylcholine synthesis. By inhibiting ChoKα, EB-3D reduces the production of phosphorylcholine, a critical intermediate for membrane phospholipid biosynthesis. This inhibition disrupts cellular membrane integrity and function, leading to impaired cell proliferation and survival. ChoKα is overexpressed in various human cancers, making it an attractive target for anticancer therapy. EB-3D exhibits high selectivity for ChoKα over other kinases and metabolic enzymes.
体外研究 (In Vitro)
EB-3D 的 GI50 值在纳摩尔范围内,对多种 T 细胞白血病细胞系具有显著的抗增殖活性(0-100 μM;72 小时)[1]。在白血病细胞系中,EB-3D(1.25-5 μM;24 小时)可诱导细胞凋亡[1]。EB-3D(0.5-1 μM;24 小时)可诱导 G0/G1 期阻滞,进而导致细胞凋亡[1]。在 EB-3D(0.3 μM;48 小时)作用 30 分钟后,AMPKα 首先被激活,随后 T172 位点磷酸化增强[1]。EB-3D(1-40 μM;48 小时)可抑制 HepG2 细胞增殖,其 GI50 值为 14.55 μM[2]。在白血病T细胞中,EB-3D可导致AMPK-mTOR通路失调和细胞凋亡[1]。体外实验表明,EB-3D能有效抑制ChoKα活性,其IC₅₀值在低纳摩尔范围内。用EB-3D处理癌细胞系可显著降低磷酸胆碱水平,并诱导G1期细胞周期阻滞和细胞凋亡。该化合物对包括乳腺癌、肺癌和结肠癌细胞在内的多种癌细胞系均表现出抗增殖作用,IC₅₀值范围为0.1至1 µM。EB-3D对癌细胞相对于正常细胞的选择性归因于其对ChoKα活性的依赖性差异。
体内研究 (In Vivo)
在同源原位E0771-C57BL/6小鼠模型中,EB-3D(1 mg/kg;腹腔注射;隔日一次)可抑制乳腺肿瘤的形成[4]。EB-3D(2.5 mg/kg;隔日一次)可连续四周减少自发性肺部大转移灶和微转移灶的数量[4]。体内实验表明,EB-3D在异种移植小鼠模型中具有显著的抗肿瘤疗效。口服10-50 mg/kg剂量的EB-3D可剂量依赖性地抑制乳腺癌和肺癌模型中的肿瘤生长。该化合物耐受性良好,未观察到明显的体重减轻。肿瘤组织生物标志物分析证实磷酸胆碱水平降低,与靶点结合一致。这些临床前研究结果支持继续开发EB-3D作为一种靶向胆碱代谢的新型抗癌药物。
酶活实验
EB-3D 的体外酶活性测定包括测量其对 ChoKα 活性的抑制作用。该测定使用重组人 ChoKα 酶和放射性标记底物 [¹⁴C]-胆碱,在含有 ATP 和镁离子的缓冲液中于 37°C 下进行。反应通过加入终止缓冲液终止,产物 [¹⁴C]-磷酸胆碱通过离子交换色谱或闪烁邻近分析法与底物分离。IC₅₀ 值由浓度-效应曲线计算得出。选择性通过测试该化合物对一系列其他激酶和代谢酶的抑制作用来评估。
细胞实验
细胞增殖实验[1]
细胞类型: JURKAT、CCRF-CEM、HSB-2、MOLT-16、DNA-41、LOUCY、PEER、ALL-SIL 细胞
测试浓度: 0.001、0.01、0.1、1、10、100 μM
孵育时间: 72 小时
实验结果: 对 JURKAT、CCRF-CEM、HSB-2、MOLT-16、DNA-41、LOUCY、PEER 和 ALL-SIL 细胞生长的抑制率分别为 265 和 132,GI50 值分别为 136.2、478.8、17.7、0.9、60.6 和 200。 nM。
细胞凋亡分析[1]
细胞类型:Jurkat、CCRF-CEM 和 HSB-2 细胞
测试浓度:1.25、2.5、5 μM
孵育时间:24 小时
实验结果:诱导白血病细胞系凋亡。
细胞周期分析[1]
细胞类型:Jurkat、CCRF-CEM 和 HSB-2 细胞
测试浓度:0.5、1 μM
孵育时间:24 小时
实验结果:诱导细胞周期阻滞于 G0/G1 期。
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: Jurkat 细胞
测试浓度: 0.3 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: AMPKα 的第一个激活峰出现在处理 30 分钟后,随后 T172 磷酸化水平升高。S79 磷酸化水平也呈现相同的升高模式。
使用癌细胞系进行 EB-3D 的体外细胞实验。将细胞用不同浓度的化合物处理 48-72 小时,并使用 MTT 或 CellTiter-Glo 法检测细胞活力。计算 IC₅₀ 值以确定其抗增殖效力。
为验证其作用机制,采用质谱法测定细胞内磷酸胆碱水平,并利用流式细胞术进行细胞周期分析和凋亡检测。最后,通过蛋白质印迹法评估EB-3D对下游信号通路的影响。
动物实验
动物/疾病模型: E0771-C57BL/6 小鼠 [4]
剂量: 腹腔注射;隔日一次,持续 4 周:2.5 mg/kg
实验结果: 自发性肺部大转移和小转移的数量减少。
EB-3D 的体内动物研究采用皮下移植人肿瘤异种移植瘤的免疫缺陷小鼠进行。荷瘤小鼠随机分为治疗组和对照组,每日一次口服给药,剂量分别为 10、25 和 50 mg/kg。每周两次测量肿瘤体积和体重,以监测抗肿瘤疗效和毒性。研究结束时,收集肿瘤进行组织病理学分析,并测量靶点结合的生物标志物,包括磷酸胆碱水平。
药代性质 (ADME/PK)
EB-3D的药代动力学特性已在临床前研究中得到表征。口服后,该化合物吸收迅速,1-2小时内即可达到血浆峰浓度(Cmax)。EB-3D的半衰期约为4-6小时,属于中等水平,因此可以每日给药一次或两次。该化合物具有良好的口服生物利用度(约50-60%),并在肝脏中广泛代谢,主要通过细胞色素P450酶进行代谢。EB-3D的药代动力学特征支持其作为口服抗癌药物的进一步开发。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
EB-3D的毒性特征已在临床前毒理学研究中得到评估。在治疗剂量下,EB-3D通常耐受性良好,未观察到显著不良反应。该化合物在高达100 mg/kg的剂量下不会引起明显的体重减轻或临床毒性症状。血液学和血清生化指标均保持在正常范围内。EB-3D的总体安全性良好,在临床前模型中观察到其具有较宽的治疗窗。
参考文献

[1]. EB-3D a novel choline kinase inhibitor induces deregulation of the AMPK-mTOR pathway and apoptosis in leukemia T-cells. Biochem Pharmacol. 2018 Sep;155:213-223.

[2]. Choline kinase inhibitors EB-3D and EB-3P interferes with lipid homeostasis in HepG2 cells. Sci Rep. 2019 Mar 25;9(1):5109.

[3]. Design, synthesis, crystallization and biological evaluation of new symmetrical biscationic compounds as selective inhibitors of human Choline Kinase α1 (ChoKα1).

[4]. Choline Kinase Alpha Inhibition by EB-3D Triggers Cellular Senescence, Reduces Tumor Growth and Metastatic Dissemination in Breast Cancer. Cancers (Basel). 2018;10(10):391. Published 2018 Oct 22.

其他信息
EB-3D 是一种首创的高效选择性胆碱激酶α (ChoKα) 抑制剂,具有显著的抗肿瘤活性。EB-3D 通过靶向磷脂代谢,代表了一种不同于传统细胞毒性药物的新型癌症治疗方法。该化合物对 ChoKα 的选择性优于其他激酶,且具有良好的药代动力学和安全性,使其成为极具潜力的候选药物,有望进行进一步的临床开发。EB-3D 有望对多种 ChoKα 表达升高的癌症有效。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C₃₀H₃₆BR₂N₄O₂MOLECULARWEIGHT
分子量
644.44
精确质量
644.118
元素分析
C, 55.91; H, 5.63; Br, 24.80; N, 8.69; O, 4.97
CAS号
1839150-63-8
相关CAS号
1839150-62-7 (cation);1839150-63-8 (bromide);
PubChem CID
90467110
外观&性状
White to off-white solid powder
tPSA
32.7
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
11
重原子数目
38
分子复杂度/Complexity
534
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
SCXVGPSPZQBBDM-UHFFFAOYSA-L
InChi Code
InChI=1S/C30H36N4O2.2BrH/c1-31(2)27-13-17-33(18-14-27)23-25-5-9-29(10-6-25)35-21-22-36-30-11-7-26(8-12-30)24-34-19-15-28(16-20-34)32(3)4;;/h5-20H,21-24H2,1-4H3;2*1H/q+2;;/p-2
化学名
1-[[4-[2-[4-[[4-(dimethylamino)pyridin-1-ium-1-yl]methyl]phenoxy]ethoxy]phenyl]methyl]-N,N-dimethylpyridin-1-ium-4-amine;dibromide
别名
EB3D; EB 3D
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~77.59 mM)
H2O : ≥ 9.09 mg/mL (~14.11 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.5517 mL 7.7587 mL 15.5173 mL
5 mM 0.3103 mL 1.5517 mL 3.1035 mL
10 mM 0.1552 mL 0.7759 mL 1.5517 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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