EMD534085

别名: EMD534085; EMD 534085; EMD;534085 N-[2-(二甲基氨基)乙基]-N'-[[(2R,4AS,5R,10BS)-3,4,4A,5,6,10B-六氢-5-苯基-9-(三氟甲基)-2H-吡喃并[3,2-C]喹啉-2-基]甲基]脲
目录号: V20498
EMD534085 是一种有效且特异性的有丝分裂驱动蛋白-5 抑制剂,IC50 为 8 nM。
EMD534085 CAS号: 858668-07-2
产品类别: Kinesin
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
EMD534085 是一种强效且特异性的有丝分裂驱动蛋白-5抑制剂,IC50 为 8 nM。
EMD534085(CAS#: 858668-07-2)是一种强效且特异性的驱动蛋白纺锤体蛋白 Eg5(也称为 KSP 或有丝分裂驱动蛋白-5)抑制剂,IC50 为 8 nM。Eg5 是一种运动蛋白,对细胞分裂过程中双极有丝分裂纺锤体的形成至关重要。EMD534085 通过抑制 Eg5 来破坏有丝分裂纺锤体的组装,从而导致癌细胞有丝分裂停滞和凋亡。该化合物对 HCT116 结肠癌细胞的增殖具有抑制作用,IC50 为 30 nM,并能诱导 HL-60 白血病细胞有丝分裂停滞和凋亡。在体内,EMD534085(15 和 30 mg/kg)可抑制 COLO 205 结肠癌小鼠异种移植模型中的肿瘤生长。该化合物的分子式为 C25H31F3N4O2,分子量为 476.54。EMD534085 是一种驱动蛋白抑制剂,目前正处于癌症治疗的临床开发阶段。它可用于研究细胞骨架动力学、平滑肌收缩和细胞运动。
生物活性&实验参考方法
靶点
Kinesin-5 (Ki = 8 nM)
EMD534085 targets the kinesin spindle protein Eg5 (also known as KSP or mitotic kinesin-5), a motor protein that is essential for the formation of the bipolar mitotic spindle during cell division. Eg5 is a member of the kinesin-5 family of microtubule-associated motor proteins that are required for the separation of centrosomes and the establishment of the bipolar spindle. By inhibiting Eg5, EMD534085 disrupts mitotic spindle assembly, leading to mitotic arrest. This arrest activates the spindle assembly checkpoint, which prevents the cell from proceeding through mitosis. Prolonged mitotic arrest can lead to apoptosis or cell death. EMD534085 is a potent and specific inhibitor of Eg5, with an IC50 of 8 nM. This high potency indicates that it binds with high affinity to Eg5 and effectively inhibits its motor activity. The specificity of EMD534085 for Eg5 is important for minimizing off-target effects on other kinesins and cellular processes. By targeting Eg5, EMD534085 provides a selective approach to inducing mitotic arrest and apoptosis in rapidly dividing cancer cells. The compound's mechanism of action is distinct from that of microtubule-targeting agents like taxanes and vinca alkaloids, which affect all microtubules and can cause neurotoxicity. This makes Eg5 inhibitors like EMD534085 a promising class of anticancer agents with potentially fewer side effects.
体外研究 (In Vitro)
EMD 534085 不选择性抑制驱动蛋白-5,而是在 1 μM 或 10 μM 浓度下选择性抑制驱动蛋白-BimC、CEN-PE、铬驱动蛋白、KHC、KIF3C、KIFC3、MKLP-1 和 MCAK。EMD 534085 可与驱动蛋白-5 的变构口袋结合[1]。在有丝分裂阻滞期间,EMD534085 可导致 HL60 细胞快速死亡。当 EMD534085 应用于 HL60 细胞时,caspase-8、-9、-3 和 -7 被激活,Parp1 被切割,Mcl1 和 XIAP 被降解。在用 EMD534085 处理的 HL60 细胞中,胸苷释放后 6 小时开始观察到磷酸化组蛋白 H3 水平显著升高[2]。
EMD534085 具有强大的体外活性,可作为 Eg5 抑制剂和抗癌剂。它对 Eg5 的抑制 IC50 为 8 nM。在基于细胞的实验中,EMD534085 以 30 nM 的 IC50 抑制 HCT116 结肠癌细胞的增殖。它还能诱导 HL-60 白血病细胞发生有丝分裂阻滞和凋亡。从机制上讲,EMD534085 在 HL60 细胞有丝分裂阻滞期间诱导细胞快速死亡,激活 caspase-8、-9、-3 和 -7;切割 Parp1;并降解 Mcl1 和 XIAP。它还能提高胸苷释放后6小时开始的磷酸化组蛋白H3水平,表明有丝分裂停滞。这些效应与通过内源性和外源性途径诱导细胞凋亡相一致。该化合物对多种癌细胞系的强效活性凸显了其作为广谱抗癌药物的潜力。
体内研究 (In Vivo)
在小鼠体内低剂量药代动力学研究中,EMD 534085 的半衰期约为 2.5 小时,分布容积为 7.4 L/kg,平均清除率为 1.8 L/h/kg。在高剂量(>10 mg/kg)研究中,小鼠体内的生物利用度始终高于 50%。腹腔注射 EMD 534085 可使小鼠达到显著的全身暴露,从而显著抑制肿瘤生长且无有害副作用[1]。EMD534085 在 COLO 205 结肠癌小鼠异种移植模型中表现出显著的体内活性,在 15 和 30 mg/kg 的剂量下可抑制肿瘤生长。这表明其在相关的人类癌症体内模型中具有疗效。该化合物是一种驱动蛋白抑制剂,目前正处于癌症治疗的临床开发阶段。这表明其已完成临床前研究,并已在人体中进行评估。体内疗效及其强大的体外活性支持EMD534085作为癌症治疗药物的进一步开发。有关其临床开发和人体疗效的更多详情,请参阅临床文献。
酶活实验
EMD534085 的体外酶/受体结合(非细胞)测定通常包括使用生化分析评估其对 Eg5 的抑制活性。在一个典型的实验方案中,将纯化的 Eg5 蛋白与微管、ATP 和不同浓度的 EMD534085 一起孵育。测定 Eg5 的 ATPase 活性,并利用 EMD534085 对 ATP 水解的抑制作用计算 IC50 值。对于 EMD534085,该方法已用于测定其对 Eg5 的 IC50 值为 8 nM。为了评估其特异性,可以对 EMD534085 进行针对一系列其他驱动蛋白和激酶的筛选。这些测定对于在分子水平上表征该化合物的抑制效力和选择性至关重要。
细胞实验
RO-3306 用于同步 HeLa 和 MCF7 上皮细胞系的 G2 期。用 10 µM RO-3306 处理 16 小时后,取出细胞并置于温热的生长培养基或添加了 500 nM EMD534085 的培养基中[2]。
EMD534085 的体外细胞实验通常包括评估其对癌细胞增殖、有丝分裂阻滞和凋亡的影响。在典型的实验中,将癌细胞(例如 HCT116、HL-60)用不同浓度的 EMD534085 处理特定时间。然后使用 MTT 或类似方法测量细胞增殖,以确定 IC50 值。为了评估有丝分裂阻滞,用针对磷酸化组蛋白 H3(有丝分裂标志物)的抗体对细胞进行染色,并通过流式细胞术或免疫荧光法进行分析。为了评估细胞凋亡,细胞用膜联蛋白V和碘化丙啶染色,并通过流式细胞术进行分析;或者通过蛋白质印迹法检测凋亡标志物,例如caspase激活和Parp1裂解。结果表明,EMD534085可诱导癌细胞发生有丝分裂停滞和凋亡。这些细胞实验对于确认该化合物的作用机制以及在相关的生物学背景下评估其效力和疗效至关重要。
动物实验
EMD534085 的体内动物实验方案通常采用人源肿瘤的小鼠异种移植模型。在典型的研究中,将人源肿瘤细胞(例如 COLO 205 结肠癌细胞)皮下植入免疫缺陷小鼠体内。当肿瘤达到一定大小后,对小鼠进行 EMD534085 治疗,通常采用腹腔注射或口服给药,剂量(例如 15 和 30 mg/kg)和给药方案各不相同。定期测量肿瘤体积以评估肿瘤生长抑制情况。通过比较治疗组小鼠和载体对照组小鼠的肿瘤生长情况来评估化合物的疗效。此外,可在研究结束时收集肿瘤组织,通过免疫组织化学或蛋白质印迹法分析有丝分裂阻滞和细胞凋亡的标志物。这些体内模型对于验证化合物的治疗潜力以及理解其在复杂生物系统中的作用机制至关重要。
药代性质 (ADME/PK)
目前文献中尚未报道 EMD534085 的具体药代动力学 (PK) 数据,例如半衰期、清除率、分布容积或生物利用度。然而,该化合物在异种移植模型中的体内疗效及其临床开发表明,它具有良好的药代动力学特性。EMD534085 的分子量为 476.54,可溶于 DMSO。有关其药代动力学特性的更多详细信息,请参阅临床文献。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前文献中未报道EMD534085的具体毒性(毒理学)数据。然而,作为一种驱动蛋白抑制剂,其毒性特征预计与其作用机制相关,即干扰快速分裂细胞的有丝分裂。这可能导致骨髓抑制和胃肠道毒性,而这些是靶向细胞分裂的抗癌药物常见的副作用。为支持其临床开发,可能已开展了全面的毒理学评估,包括急性和慢性毒性研究、遗传毒性和致癌性研究。该化合物仅供研究使用,不得用于人类或兽医用途。
参考文献

[1]. The discovery and optimization of hexahydro-2H-pyrano[3,2-c]quinolines (HHPQs) as potent and selective inhibitors of the mitotic kinesin-5. Bioorg Med Chem Lett. 2010 Mar 1;20(5):1491-5.

[2]. Rapid induction of apoptosis during Kinesin-5 inhibitor-induced mitotic arrest in HL60 cells. Cancer Lett. 2011 Nov 1;310(1):15-24.

其他信息
EMD534085 是一种强效且特异性的驱动蛋白纺锤体蛋白 Eg5 抑制剂(IC50 = 8 nM)。它能抑制 HCT116 结肠癌细胞的增殖(IC50 = 30 nM),并诱导 HL-60 白血病细胞发生有丝分裂停滞和凋亡。在体内,EMD534085 可抑制 COLO 205 结肠癌小鼠异种移植模型中的肿瘤生长。该化合物的分子式为 C25H31F3N4O2,分子量为 476.54。EMD534085 是一种驱动蛋白抑制剂,目前正处于癌症治疗的临床开发阶段。它可用于研究细胞骨架动力学、平滑肌收缩和细胞运动。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H31F3N4O2
分子量
476.5345
精确质量
476.239
元素分析
C, 63.01; H, 6.56; F, 11.96; N, 11.76; O, 6.71
CAS号
858668-07-2
相关CAS号
858668-07-2
PubChem CID
23634407
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
609.5±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
322.4±31.5 °C
蒸汽压
0.0±1.7 mmHg at 25°C
折射率
1.532
LogP
3.08
tPSA
69.12
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
671
定义原子立体中心数目
4
SMILES
C([C@H]1CC[C@H]2[C@H](C3C=CC=CC=3)NC3C=CC(C(F)(F)F)=CC=3[C@H]2O1)NC(=O)NCCN(C)C
InChi Key
MARIUIDCPUZLKZ-FUKQBSRTSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H31F3N4O2/c1-32(2)13-12-29-24(33)30-15-18-9-10-19-22(16-6-4-3-5-7-16)31-21-11-8-17(25(26,27)28)14-20(21)23(19)34-18/h3-8,11,14,18-19,22-23,31H,9-10,12-13,15H2,1-2H3,(H2,29,30,33)/t18-,19+,22+,23+/m1/s1
化学名
1-[[(2R,4aS,5R,10bS)-5-phenyl-9-(trifluoromethyl)-3,4,4a,5,6,10b-hexahydro-2H-pyrano[3,2-c]quinolin-2-yl]methyl]-3-[2-(dimethylamino)ethyl]urea
别名
EMD534085; EMD 534085; EMD;534085
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ≥ 26 mg/mL (~54.6 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0985 mL 10.4925 mL 20.9850 mL
5 mM 0.4197 mL 2.0985 mL 4.1970 mL
10 mM 0.2099 mL 1.0493 mL 2.0985 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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