endo-BCN-PEG12-NHS ester

目录号: V20536 纯度: ≥98%
内切-BCN-PEG12-NHS酯是一种由NHS酯基和BCN基团组成的新型PEG类似物,其中NHS酯可用于标记蛋白质的伯胺(-NH2)、胺修饰的寡核苷酸和其他含胺分子,而 BCN 基团可以与叠氮化物标记的生物分子发生反应。
endo-BCN-PEG12-NHS ester CAS号: 2183440-26-6
产品类别: New12
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
内型-BCN-PEG12-NHS酯是一种新型PEG类似物,由NHS酯基团和BCN基团组成。其中,NHS酯基团可用于标记蛋白质、胺修饰的寡核苷酸和其他含胺分子的伯胺(-NH2),而BCN基团可与叠氮标记的生物分子反应。PEG连接子可用于开发抗体药物偶联物和药物递送方法。
内型-BCN-PEG12-NHS酯是一种异双功能PEG连接子,由内型双环[6.1.0]壬-4-炔(内型-BCN)部分、十二单元聚乙二醇(PEG12)间隔基和N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)酯组成。它是一种专为生物偶联应用而设计的新型PEG类似物。该化合物是开发抗体药物偶联物(ADC)和药物递送方法的宝贵工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
endo-BCN-PEG12-NHS ester does not have a specific biological target; it is a chemical linker for bioconjugation. The NHS ester group reacts with primary amines (-NH₂) on proteins, amine-modified oligonucleotides, and other amine-containing molecules. The BCN group undergoes strain-promoted alkyne-azide cycloaddition (SPAAC) with azide-tagged biomolecules. This orthogonal reactivity enables the creation of complex bioconjugates.
体外研究 (In Vitro)
一种配体与E3泛素连接酶结合,另一种配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。
内切-BCN-PEG12-NHS酯并非传统意义上具有体外活性的生物活性化合物。其用途在于作为生物偶联连接子的化学反应活性。它可用于标记蛋白质、肽和其他分子,从而实现后续的检测、固定或与其他实体偶联。其活性通过这些偶联反应的效率来评估。
体内研究 (In Vivo)
内切-BCN-PEG12-NHS酯不用作治疗剂,也不具有药理学意义上的体内活性。它是一种研究试剂,用于体外合成生物偶联物,例如抗体药物偶联物(ADC),这些偶联物随后可能在动物模型中进行测试。其性质会影响最终偶联物的药代动力学和生物分布特征。
酶活实验
内切BCN-PEG12-NHS酯的非细胞活性测定包括评估其在化学偶联反应中的反应活性。NHS酯基团可与含伯胺的分子反应,酰胺键的形成可通过高效液相色谱(HPLC)或质谱等分析技术进行监测。BCN基团的反应活性可通过其与含叠氮基团的分子进行应变促进的炔-叠氮环加成(SPAAC)反应来评估,并可通过类似的分析方法进行监测。
细胞实验
体外细胞实验不适用于内切BCN-PEG12-NHS酯,因为它是一种用于合成的化学连接剂,而非生物活性分子。它可用于合成偶联物,这些偶联物随后会在细胞实验中测试其靶点结合或生物活性,但连接剂本身不具有直接的细胞效应。它的作用是提供亲水性PEG间隔基和正交功能基团,用于生物偶联。
动物实验
由于内切-BCN-PEG12-NHS酯是一种化学连接剂而非治疗剂,因此不适用于体内动物实验。它用于合成偶联物(例如抗体药物偶联物ADC),这些偶联物可在动物模型中进行测试。PEG12间隔基的性质会影响最终偶联物的药代动力学性质,包括循环半衰期和生物分布。
药代性质 (ADME/PK)
endo-BCN-PEG12-NHS酯的分子量为891.0,分子式为C₄₂H₇₀N₂O₁₈。它是一种固体粉末,可溶于DMSO、DCM和DMF。储存时,应将粉末置于-20℃,避光防潮。它是一种异双功能连接剂,包含用于SPAAC的endo-BCN部分、用于胺偶联的PEG12间隔基和用于胺偶联的NHS酯基。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
内切-BCN-PEG12-NHS酯是一种化学试剂,不可用于治疗用途。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施。它可能引起皮肤、眼睛和呼吸道刺激。应使用适当的个人防护装备。该化合物仅供研究使用。
参考文献
Sano K, Nakajima T, Miyazaki K, Ohuchi Y, Ikegami T, Choyke PL, Kobayashi H. Short PEG-linkers improve the performance of targeted, activatable monoclonal antibody-indocyanine green optical imaging probes. Bioconjug Chem. 2013 May 15;24(5):811-6.
其他信息
内型BCN-PEG12-NHS酯(CAS号:2183440-26-6)是一种异双功能PEG连接剂,它结合了用于应变促进炔-叠氮环加成反应(SPAAC)的内型BCN基团、用于胺偶联的PEG12间隔基和用于胺偶联的NHS酯基团。它是生物偶联的有效工具,可用于开发抗体药物偶联物(ADC)和药物递送方法。该连接剂可从多家商业供应商处获得,用于科研应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C42H70N2O18
分子量
891.007814884186
精确质量
890.462
CAS号
2183440-26-6
PubChem CID
129012711
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
密度
1.2±0.1 g/cm3
折射率
1.522
LogP
-3.67
tPSA
213
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
18
可旋转键数目(RBC)
44
重原子数目
62
分子复杂度/Complexity
1230
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O(C(NCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCC(=O)ON1C(CCC1=O)=O)=O)CC1C2CCC#CCCC21
InChi Key
IBETWWKNNXABHK-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C42H70N2O18/c45-39-7-8-40(46)44(39)62-41(47)9-11-49-13-15-51-17-19-53-21-23-55-25-27-57-29-31-59-33-34-60-32-30-58-28-26-56-24-22-54-20-18-52-16-14-50-12-10-43-42(48)61-35-38-36-5-3-1-2-4-6-37(36)38/h36-38H,3-35H2,(H,43,48)
化学名
(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(9-bicyclo[6.1.0]non-4-ynylmethoxycarbonylamino)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.1223 mL 5.6116 mL 11.2232 mL
5 mM 0.2245 mL 1.1223 mL 2.2446 mL
10 mM 0.1122 mL 0.5612 mL 1.1223 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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