FKBP12 PROTAC dTAG-13

别名: FKBP12 PROTAC dTAG-13 dTAG-13 dTAG13 dTAG 13
目录号: V40664 纯度: ≥98%
FKBP12 PROTAC dTAG-13 (dTAG-13) 是一种新型有效的 PROTAC 降解剂,用于降解 FKBP12F36V 融合嵌合体。
FKBP12 PROTAC dTAG-13 CAS号: 2064175-41-1
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
2mg
5mg
10mg
25mg
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产品描述
FKBP12 PROTAC dTAG-13 (dTAG-13) 是一种新型高效的 PROTAC 降解剂,用于降解 FKBP12F36V 融合嵌合体。FKBP12 PROTAC dTAG-13 (dTAG-13) 是一种 FKBP12F36V 降解剂,其 FKBP12F36V 与目标蛋白同框表达。 FKBP12 PROTAC dTAG-13 (dTAG-13) 通过将 BET 溴结构域与 E3 泛素连接酶 CRBN 连接,特异性降解 BET 溴结构域转录共激活因子 BRD4。
FKBP12 PROTAC dTAG-13 (CAS#: 2064175-41-1) 是一种异双功能 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体),可选择性降解 FKBP12F36V 融合蛋白。它同时与 FKBP12F36V 和 E3 泛素连接酶 CRBN(Cereblon)结合,导致 FKBP12F36V 被 CRBN 介导快速且选择性地降解。该化合物用于药物发现中的靶点验证以及蛋白质降解技术的研究。dTAG-13 是一种邻位取代的异双功能降解剂,具有体内活性。
生物活性&实验参考方法
靶点
FKBP12 PROTAC dTAG-13 targets FKBP12F36V, a mutant form of FKBP12 that can be fused in-frame to a protein of interest. The compound also engages CRBN, an E3 ubiquitin ligase, which mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of the target protein. By linking FKBP12F36V to CRBN, dTAG-13 induces selective degradation of FKBP12F36V fusion proteins without affecting wild-type FKBP12. This system enables inducible protein degradation for functional studies.
体外研究 (In Vitro)
在 293FTWT 细胞中,TAG-13(1-1000 nM;4 小时;293FTWT 细胞)处理成功降低了 FKBP12F36V-Nluc 的水平,表明 CRBN 是观察到的结果所必需的 [1]。当将 dTAG-13 应用于表达 BRD4(short)-FKBP12F36V 的 MV4;11 细胞时,BRD4 被严重降解。BRD4 在接受 dTAG-13 处理后不到一小时内迅速降解。在杂合和纯合敲入克隆中,dTAG-13 处理可使 BRD4 融合嵌合体快速有效地降解,但对内源性 FKBP12WT 无影响 [1]。
体外实验表明,FKBP12 PROTAC dTAG-13 是一种小分子 PROTAC,可选择性地降解 FKBP12F36V 融合蛋白,而不影响野生型 FKBP12。在 293T、PATU-8988T 和 EOL-1 等细胞系中,用 dTAG-13(500 nM,4 小时)处理可有效降解 FKBP12F36V 融合靶蛋白,例如 FKBP12F36V-KRASG12V 或 FKBP12F36V-ABL1,并抑制下游信号传导。在 10-500 nM 的浓度范围内,降解活性呈剂量依赖性。这使得 dTAG-13 成为研究蛋白质功能和验证药物靶点的有力工具。
体内研究 (In Vivo)
将表达luc-FKBP12F36V的MV4;11细胞移植到小鼠骨髓后,评估了载体或dTAG-13给药后的生物发光信号。注射dTAG-13四小时后,观察到生物发光信号受到强烈、快速且持久的影响,表明luc-FKBP12F36V被有效降解。末次治疗28小时后,细胞生物发光恢复至与载体组和dTAG-13治疗组相当的水平[1]。
体内实验表明,FKBP12 PROTAC dTAG-13在携带PATU-8988T FKBP12F36V-KRASG12V异种移植瘤的NOD/SCID小鼠模型中具有疗效。单次腹腔注射35 mg/kg剂量可在2小时内显著降低肿瘤组织中融合蛋白的表达,且该作用至少持续12小时。这种快速且持续的降解表明该化合物具有进行体内靶点验证和药效学研究的潜力。dTAG-13 的体内活性支持其用于研究生理环境下的蛋白质功能。
酶活实验
用于检测 FKBP12 PROTAC dTAG-13 的无细胞分析包括评估该化合物与 FKBP12F36V 和 CRBN 蛋白的结合亲和力。结合分析通常采用表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 来确定结合动力学和热力学。该化合物诱导 FKBP12F36V 和 CRBN 之间形成三元复合物的能力可以通过 AlphaScreen 或 FRET 等生化分析进行评估。这些分析可以量化 PROTAC 将靶蛋白和 E3 连接酶拉近的效率。
细胞实验
Western blot分析[1]
细胞类型: 293FTWT细胞
测试浓度: 1 nM、10 nM、100 nM、1000 nM
孵育时间: 4小时
实验结果: 在293FTWT细胞中,FKBP12F36V-Nluc水平显著降低。
在体外细胞实验中,FKBP12 PROTAC dTAG-13通常溶解于DMSO中,并用细胞培养基稀释。表达FKBP12F36V融合蛋白的细胞用浓度为10-500 nM的dTAG-13处理4-24小时。通过蛋白质印迹法,使用针对融合蛋白或FKBP12的抗体来评估靶蛋白的降解情况。下游信号抑制情况则通过磷酸化特异性抗体进行评估。剂量反应和时间进程实验用于确定最佳降解条件。
动物实验
FKBP12 PROTAC dTAG-13 的体内动物研究在携带表达 FKBP12F36V 融合蛋白的异种移植瘤的免疫缺陷小鼠中进行。该化合物以 35 mg/kg 的剂量腹腔注射 (ip) 给药。在给药后不同时间点(2、4、8、12 和 24 小时)收集肿瘤组织。通过蛋白质印迹法和免疫组织化学法评估融合蛋白的降解情况。药效学研究评估体内靶点降解的持续时间和程度。
药代性质 (ADME/PK)
FKBP12 PROTAC dTAG-13 的药代动力学特性包括分子量为 1049.17 g/mol,分子式为 C57H68N4O15。该化合物的预测密度为 1.260 g/cm3。粉末在 -20°C 下可稳定保存长达 3 年,溶剂在 -80°C 下可稳定保存 1 年。该化合物通常使用合适的溶剂(例如 DMSO、PEG300 和生理盐水)配制成体内给药制剂。有关该化合物的具体药代动力学参数,可参考已发表的研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
FKBP12 PROTAC dTAG-13 的毒性特征已在临床前研究中得到评估。在小鼠异种移植模型中,单次腹腔注射 35 mg/kg 的剂量耐受性良好。标准毒理学研究将包括评估体重变化、器官组织病理学和临床化学参数。与所有 PROTAC 一样,应考虑潜在的脱靶降解和免疫原性风险。该化合物仅供研究使用,不得用于人类治疗。
参考文献

[1]. The dTAG system for immediate and target-specific protein degradation. Nat Chem Biol. 2018 May;14(5):431-441.

其他信息
FKBP12 PROTAC dTAG-13 是一种基于 PROTAC 的异双功能降解剂,简称 fKBP12 PROTAC dTAG-13 (dTAG-13)。它能选择性降解 FKBP12F36V,而 FKBP12F36V 与靶蛋白共框表达。FKBP12 PROTAC dTAG-13 能有效结合 FKBP12F36V 和 CRBN,从而选择性降解 FKBP12F36V。
FKBP12 PROTAC dTAG-13 是一种异双功能降解剂,它能与 FKBP12F36V 和 CRBN 结合,以 CRBN 依赖的方式选择性降解 FKBP12F36V 融合蛋白。它可用于药物发现中的靶点验证和蛋白质功能研究。体外实验表明,dTAG-13(500 nM,4 小时)能有效降解 FKBP12F36V 融合靶点,并以剂量依赖的方式(10-500 nM)抑制下游信号通路。体内实验表明,单次腹腔注射 35 mg/kg 的 dTAG-13 可在 2 小时内降低异种移植瘤中融合蛋白的表达,且该作用至少持续 12 小时。dTAG-13 尚未进入临床试验阶段,目前仅用于研究用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C₅₇H₆₈N₄O₁₅
分子量
1049.16763687134
精确质量
1048.468
CAS号
2064175-41-1
相关CAS号
2064175-41-1;
PubChem CID
124187630
外观&性状
White to light yellow solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
1134.0±65.0 °C at 760 mmHg
闪点
639.6±34.3 °C
蒸汽压
0.0±0.3 mmHg at 25°C
折射率
1.581
LogP
6.98
tPSA
224
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
15
可旋转键数目(RBC)
27
重原子数目
76
分子复杂度/Complexity
1930
定义原子立体中心数目
3
SMILES
CC[C@@H](C1=CC(=C(C(=C1)OC)OC)OC)C(=O)N2CCCC[C@H]2C(=O)O[C@H](CCC3=CC(=C(C=C3)OC)OC)C4=CC=CC=C4OCC(=O)NCCCCCCOC5=CC=CC6=C5C(=O)N(C6=O)C7CCC(=O)NC7=O
InChi Key
BJFBRLAWLPZOMJ-VOSOTEEESA-N
InChi Code
InChI=1S/C57H68N4O15/c1-7-37(36-32-47(71-4)52(73-6)48(33-36)72-5)54(65)60-29-14-12-19-41(60)57(68)76-43(25-22-35-23-26-44(69-2)46(31-35)70-3)38-17-10-11-20-42(38)75-34-50(63)58-28-13-8-9-15-30-74-45-21-16-18-39-51(45)56(67)61(55(39)66)40-24-27-49(62)59-53(40)64/h10-11,16-18,20-21,23,26,31-33,37,40-41,43H,7-9,12-15,19,22,24-25,27-30,34H2,1-6H3,(H,58,63)(H,59,62,64)/t37?,40?,41-,43+/m0/s1
化学名
(1R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-(2-(2-((6-((2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindolin-4-yl)oxy)hexyl)amino)-2-oxoethoxy)phenyl)propyl (2S)-1-(2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl)piperidine-2-carboxylate
别名
FKBP12 PROTAC dTAG-13 dTAG-13 dTAG13 dTAG 13
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~180 mg/mL (~171.56 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.9531 mL 4.7657 mL 9.5313 mL
5 mM 0.1906 mL 0.9531 mL 1.9063 mL
10 mM 0.0953 mL 0.4766 mL 0.9531 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们