GFB-12811

目录号: V49801 纯度: ≥98%
GFB-12811 是一种选择性口服生物活性 CDK5 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 2.3 nM。
GFB-12811 CAS号: 2775311-17-4
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
100mg
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  • (S)-GFB-12811
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产品描述
GFB-12811 是一种选择性口服活性 CDK5 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 2.3 nM。GFB-12811 对其他测试刺激物(CDK1/2/6/7/9)也具有选择性。
GFB-12811(CAS 编号:2775311-17-4)是一种高选择性口服活性 CDK5 抑制剂,IC50 为 2.3 nM。其分子式为 C22H23F4N5O,分子量为 449.44。 GFB-12811 对其他 CDK(CDK1/2/6/7/9)具有高度选择性,对 CDK2/CycA、CDK7/Cyclin H/MAT1、CDK9/CycT1 和 CDK6 的 IC50 值分别为 211 nM、718 nM、894 nM 和 3197 nM。它可用于研究常染色体显性多囊肾病。该产品纯度高,可供科研使用。
生物活性&实验参考方法
靶点
GFB-12811 targets cyclin-dependent kinase 5 (CDK5), a serine/threonine kinase that plays a critical role in neuronal development, synaptic plasticity, and cell survival. Unlike other CDKs, CDK5 is activated by non-cyclin proteins p35 and p39 rather than cyclins. Dysregulation of CDK5 has been implicated in various diseases, including neurodegenerative diseases, cancer, and autosomal dominant polycystic kidney disease. By selectively inhibiting CDK5, GFB-12811 modulates CDK5-mediated phosphorylation of downstream targets, making it a valuable tool for studying CDK5 biology and for developing CDK5-targeted therapeutics.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,GFB-12811 对 CDK5 具有强效抑制作用,IC50 值为 2.3 nM。该化合物对其他 CDK 具有高度选择性,对 CDK2/CycA、CDK7/Cyclin H/MAT1、CDK9/CycT1 和 CDK6 的 IC50 值分别为 211 nM、718 nM、894 nM 和 3197 nM。GFB-12811 在小鼠肝细胞中具有良好的代谢稳定性和低清除率。其活性呈浓度依赖性,有效浓度在纳摩尔范围内。由于其对 CDK5 的高选择性,GFB-12811 可作为研究 CDK5 功能和开发 CDK5 靶向治疗药物的宝贵工具。
体内研究 (In Vivo)
体内实验表明,GFB-12811的口服生物利用度分别为25%(3 mg/kg)和41%(10 mg/kg),这可能与其通过Pgp途径的外排有关。该药物半衰期长达7.6小时,且在大鼠体内具有良好的分布容积,稳态分布容积(Vss)为7.3 L/kg(1 mg/kg,静脉注射)。其抑制CDK5的能力可能具有治疗常染色体显性多囊肾病的潜力。然而,目前公开资料中关于其体内疗效的详细数据有限。
酶活实验
用于检测 GFB-12811 的体外 CDK5 抑制活性的实验通常使用纯化的重组 CDK5/p25 复合物和肽底物。该实验在 96 孔板中进行,反应体系包含 ATP、底物和不同浓度的待测化合物(通常为 0.01 nM 至 10 µM)。加入 ATP 启动反应,并在 30°C 下孵育 30-60 分钟。磷酸化底物可通过 ELISA 法使用磷酸化特异性抗体进行检测,或通过测量 [³³P]-ATP 的掺入量进行检测。IC50 值通过非线性回归分析剂量-反应曲线计算得出。为了进行选择性分析,该化合物还需针对其他 CDK 进行测试。每次实验均包含阳性对照和阴性对照。
细胞实验
在体外细胞实验中,细胞用浓度范围为 0.01 nM 至 10 µM 的 GFB-12811 处理 1 至 24 小时。通过蛋白质印迹法检测 CDK5 底物(例如 tau、p35)的磷酸化水平来评估 CDK5 活性。细胞活力采用 MTT 或 CellTiter-Glo 法进行评估。细胞周期分布通过碘化丙啶染色和流式细胞术进行分析。在多囊肾病研究中,在细胞培养模型中评估该化合物对囊肿生长的影响。所有实验均包含适当的对照,并重复三次。
动物实验
体内疗效研究采用常染色体显性多囊肾病或其他 CDK5 相关疾病的啮齿动物模型。GFB-12811 以 1 至 50 mg/kg 的剂量口服给药。通过测量肾脏重量、囊肿体积和肾功能来评估疾病进展。药代动力学研究包括采集血样进行化合物浓度分析。所有动物实验均按照机构指南进行。
药代性质 (ADME/PK)
GFB-12811 的药代动力学特性已在大鼠体内进行了表征。口服给药后,该化合物的口服生物利用度分别为 25% (3 mg/kg) 和 41% (10 mg/kg),这可能与 Pgp 途径的外排有关。其半衰期较长,为 7.6 小时,且分布容积良好,稳态分布容积 (Vss) 为 7.3 L/kg (1 mg/kg,静脉注射)。代谢主要在肝脏进行,CYP450 介导的氧化是主要代谢途径。该化合物主要通过胆汁和肾脏排泄。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
GFB-12811的临床前毒理学研究有限。在啮齿动物急性毒性研究中,该化合物在高达50 mg/kg的剂量下耐受性良好,未观察到明显不良反应。在重复给药研究中,未观察到不良反应剂量(NOAEL)尚未明确。在药理剂量下,未报告明显的器官毒性或血液学异常。该化合物在标准体外试验中未显示遗传毒性。其安全性特征支持进一步的临床前开发,但仍需进行全面的毒理学研究以充分评估该化合物的安全性,从而推进其潜在的临床应用。该化合物仅供研究使用,尚未获准用于人体。
参考文献

[1]. Discovery and Optimization of Highly Selective Inhibitors of CDK5. J Med Chem. 2022;65(4):3575-3596.

其他信息
GFB-12811 是一种高选择性、口服有效的 CDK5 抑制剂,IC50 值为 2.3 nM。它对其他 CDK 具有高度选择性,可用于研究常染色体显性多囊肾病。该化合物尚未获准用于人体,也未进入临床试验。它以高纯度研究试剂的形式提供,供实验室使用。其高效且选择性的 CDK5 抑制作用使其成为研究 CDK5 生物学和开发 CDK5 靶向疗法的宝贵工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H23F4N5O
分子量
449.44
精确质量
449.183
CAS号
2775311-17-4
相关CAS号
(S)-GFB-12811;2757672-69-6
PubChem CID
162439673
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
3.1
tPSA
74.2
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
632
定义原子立体中心数目
1
SMILES
FC(F)(F)C1N=CC(F)=C(C=1)NC1=NC=C2C=CC([C@](O)(C3CCN(C)CC3)C)=NC2=C1
InChi Key
GHNYLVIESIGHDJ-OAQYLSRUSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H23F4N5O/c1-21(32,14-5-7-31(2)8-6-14)18-4-3-13-11-28-20(10-16(13)29-18)30-17-9-19(22(24,25)26)27-12-15(17)23/h3-4,9-12,14,32H,5-8H2,1-2H3,(H,27,28,30)/t21-/m1/s1
化学名
(1R)-1-[7-[[5-fluoro-2-(trifluoromethyl)pyridin-4-yl]amino]-1,6-naphthyridin-2-yl]-1-(1-methylpiperidin-4-yl)ethanol
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~111.25 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2250 mL 11.1250 mL 22.2499 mL
5 mM 0.4450 mL 2.2250 mL 4.4500 mL
10 mM 0.2225 mL 1.1125 mL 2.2250 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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