ITX3

别名: ITX 3; ITX-3; ITX3 (E)-2-[(2,5-二甲基-1-苯基-1H-吡咯-3-基)亚甲基]噻唑并[3,2-a〕苯并咪唑-3(2H)-酮;ITX3
目录号: V22777 纯度: ≥98%
ITX3 是一种特异性、无毒的 TrioN(多域 Trio 蛋白的 N 末端 GEF 结构域)抑制剂(拮抗剂),IC50 为 76 μM。
ITX3 CAS号: 347323-96-0
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
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250mg
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产品描述
ITX3 是一种特异性、无毒的 TrioN(多结构域 Trio 蛋白的 N 端 GEF 结构域)抑制剂(拮抗剂),IC50 为 76 μM。ITX3 可用于活性分子的研究。
ITX3 是一种特异性、无毒且选择性的 TrioN RhoGEF 结构域抑制剂。它是一种可透过细胞膜的噻唑并苯并咪唑酮类化合物。它抑制 TrioN 介导的 RhoG 和 Rac1 上的 GTP 交换。它具有抗癌作用,并被用于研究 RhoG/Rac1 通路。
生物活性&实验参考方法
靶点
ITX3 targets the N-terminal guanine nucleotide exchange factor (GEF) domain of the multidomain protein Trio, known as TrioN. It inhibits the RhoGEF activity of TrioN, which activates the small GTPases RhoG and Rac1. This pathway is involved in cell structure and migration.
体外研究 (In Vitro)
TrioN信号通路可被ITX3(5、10、25、50和100 μM;24小时)抑制[1]。ITX3(50 μM;1小时)可选择性抑制TrioN[1]。在PC12细胞中,ITX3(100 μM;36小时)可抑制神经生长因子(NGF)介导的神经突生长[1]。在Tara-KD细胞中,ITX3(1、10和100 μM)以剂量依赖的方式磷酸化p38信号通路,增加E-钙黏蛋白水平,并抑制Rac1活性[2]。
ITX3抑制TrioN介导的RhoG和Rac1上的GTP交换。它抑制PC12细胞中NGF介导的神经突生长以及REF52成纤维细胞中TrioN诱导的结构形成。其抑制TrioN的IC50值为76 μM。
体内研究 (In Vivo)
ITX3具有抗癌作用。它被用于体内研究Trio/RhoG/Rac1通路的作用。它是一种特异性、无毒的抑制剂,在全细胞实验中具有活性,能够抑制TrioN依赖性细胞结构的形成。
酶活实验
ITX3 的主要检测方法是生化检测,即测量其抑制 TrioN 鸟嘌呤核苷酸交换活性的能力。该方法包括将 TrioN 与 RhoG 或 Rac1 孵育,并测量 GDP 与 GTP 的交换,通常使用荧光标记的 GTP 类似物。其 IC50 值也通过此检测方法确定。
细胞实验
Western Blot 分析[1]
细胞类型:表达 TrioN、GEF337、Tiam1 和 Vav2 的 HEK293 细胞系[1]
测试浓度:50 μM
孵育时间:1 小时
实验结果:TrioN 诱导 Rac 活性降低。
ITX3 的体外细胞实验包括用该化合物处理细胞并测量其对 TrioN 依赖性过程的影响。这包括评估其抑制 TrioN 诱导的 REF52 成纤维细胞中细胞结构形成的能力,以及其对 PC12 细胞神经突生长的影响。
动物实验
ITX3在癌症研究中的应用表明,对其进行体内研究具有重要意义。它可用于异种移植或其他肿瘤模型,以评估其对肿瘤生长和转移的影响。其在全细胞检测中的活性表明,它适合用于体内研究。
药代性质 (ADME/PK)
未提供 ITX3 的详细药代动力学数据。它是一种小分子(分子量 371.46 g/mol),具有细胞渗透性。作为一种研究化合物,其特性使其可用于体外和潜在的体内应用。其稳定性和溶解度将根据实验室应用情况进行表征。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
ITX3 被描述为无毒。然而,所提供的资料中并未详细列出具体的毒理学数据。作为一种研究化合物,它不适用于人体。应遵循标准的实验室安全操作规程。
参考文献
[1]. Bouquier N, et al. A cell active chemical GEF inhibitor selectively targets the Trio/RhoG/Rac1 signaling pathway. Chem Biol. 2009 Jun 26;16(6):657-66.
[2]. Yano T, et al. Tara up-regulates E-cadherin transcription by binding to the Trio RhoGEF and inhibiting Rac signaling. J Cell Biol. 2011 Apr 18;193(2):319-32.
其他信息
ITX3 是一种用于研究 Trio/RhoG/Rac1 信号通路的选择性化学探针。它是研究该通路在细胞迁移、癌症和神经元发育中作用的重要工具。与其他 RhoGEF 相比,ITX3 对 TrioN 具有更高的选择性,使其成为一种非常有用的工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H17N3OS
分子量
371.45
精确质量
371.109
CAS号
347323-96-0
PubChem CID
1362865
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
3.864
tPSA
67.54
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
617
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(/C1=C\C2=C(C)N(C(C)=C2)C3=CC=CC=C3)N4C(S1)=NC5=CC=CC=C45
InChi Key
SJMYMKPBODEZSH-DEDYPNTBSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H17N3OS/c1-14-12-16(15(2)24(14)17-8-4-3-5-9-17)13-20-21(26)25-19-11-7-6-10-18(19)23-22(25)27-20/h3-13H,1-2H3/b20-13+
化学名
(2E)-2-[(2,5-dimethyl-1-phenylpyrrol-3-yl)methylidene]-[1,3]thiazolo[3,2-a]benzimidazol-1-one
别名
ITX 3; ITX-3; ITX3
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~2 mg/mL (~5.38 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.6922 mL 13.4608 mL 26.9215 mL
5 mM 0.5384 mL 2.6922 mL 5.3843 mL
10 mM 0.2692 mL 1.3461 mL 2.6922 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们