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KKL-35

别名: KKL-35; KKL 35; KKL35;
目录号: V4223 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
KKL-35 是一种新型、有效的反式翻译标记反应小分子抑制剂，IC50 为 0.9 µM，具有广谱抗生素活性。
KKL-35 CAS号: 865285-29-6
产品类别: Bacterial
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
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纯度: ≥98%

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产品说明书
产品描述
KKL-35 是一种新型、有效的反式翻译标签反应小分子抑制剂，IC50 为 0.9 µM，具有广谱抗生素活性。蛋白质标记和核糖体释放的反式翻译途径对于多种病原体的活力和毒力起着至关重要的作用，但在动物中并未发现。 KKL-35 阻断细菌反式翻译，这是一种校对机制，可消除翻译复合物中缺乏终止密码子的 mRNA。 KKL-35 抑制多种细菌菌株的反式翻译和随后的细胞生长。 KKL-35 在亚微摩尔浓度下抑制所有测试菌株的生长。 KKL-35 对其他导致 LD 的军团菌也具有活性。 KKL-35 对已经进化出大环内酯类耐药性的嗜肺军团菌突变体仍然具有同样的活性。 KKL-35 在感染的几个阶段抑制人巨噬细胞中嗜肺军团菌的增殖。
生物活性&实验参考方法
靶点
trans-translation tagging reaction(IC50= 0.9 µM)
Broad-spectrum antibiotic activity is demonstrated by KKL-35. When B. anthracis and M. smegmatis grow, KKL-35 inhibits their growth with minimum inhibitory concentrations (MIC) less than 6 µM. KKL-35 prevents tagged proteins from being proteolyzed at a certain stage of trans-translation. KKL-35 prevents DHFR-ns from being tagged. Reactions containing the highest concentrations of KKL-35 yield a significant amount of untagged DHFR, suggesting that KKL-35 does not impede translation.When added to a growing culture of S. flexneri, KKL-35 stops growth and inhibits the growth of WT S. flexneri with a MIC of 6 µM. The addition of KKL-35 to a S. flexneri strain that is deleted for ssrA and expresses ArfA does not significantly affect growth rate or viability. With a minimum inhibitory concentration of 0.3 µM, KKL-35 suppresses the growth of E. coli ∆tolC, a strain that lacks small molecule efflux.
体外研究 (In Vitro)
KKL-35 证明了广谱抗生素活性。当炭疽杆菌和耻垢分枝杆菌生长时，KKL-35 可抑制其生长，最低抑制浓度 (MIC) 低于 6 µM。 KKL-35 可防止标记蛋白在反式翻译的某个阶段被蛋白水解。 KKL-35 可防止 DHFR-ns 被标记。含有最高浓度 KKL-35 的反应会产生大量未标记的 DHFR，这表明 KKL-35 不会阻碍翻译。当添加到福氏链霉的生长培养物中时，KKL-35 会停止生长并抑制 WT S 的生长. 福氏菌，MIC 为 6 µM。将 KKL-35 添加到删除了 ssrA 并表达 ArfA 的福氏链球菌菌株中，不会显着影响生长速率或活力。 KKL-35 的最低抑制浓度为 0.3 µM，可抑制大肠杆菌 ΔtolC（一种缺乏小分子外排的菌株）的生长。
KKL-35 在体外以剂量依赖的方式抑制 trans-translation 标记反应，IC₅₀ 为 0.9 μM。它不抑制一般翻译过程，如在含有终止密码子的 DHFR 基因体外翻译实验中所证明。在滤膜结合实验中，KKL-35（100 μM）对 tmRNA 与 SmpB 的结合亲和力没有显著影响（加入 KKL-35 后 Kd = 1.3 ± 0.13 nM，而仅加入 DMSO 的对照组为 1.6 ± 0.35 nM）。[1]
体内研究 (In Vivo)
研究指出，KKL-35 对反式翻译释放不间断翻译复合物的抑制是其体内效应的根源。需要反式翻译的弗氏酵母菌株无法生长，因为 KKL-35 抑制反式翻译。遗传和药理学实验表明，释放不间断翻译复合物的替代机制可以缓解 KKL-35 的生长抑制，支持反式翻译抑制与生长之间的相关性[1]。
KKL-35 在肉汤微量稀释实验中表现出广谱抗菌活性。它能抑制福氏志贺菌（MIC = 6 μM）、炭疽杆菌（MIC ≤ 6 μM）、耻垢分枝杆菌（MIC ≤ 6 μM）和大肠杆菌 ΔtolC（MIC = 0.3 μM）的生长。在福氏志贺菌中，表达替代拯救因子 ArfA 可以挽救由 KKL-35 引起的生长抑制，证实其抗菌作用源于 trans-translation 抑制。嘌呤霉素（0.1 μg/mL）也能挽救大肠杆菌 ΔtolC 在 KKL-35 存在下的生长，进一步支持生长抑制是由于 nonstop 翻译复合物的积累所致。[1]
酶活实验
体外 trans-translation 实验使用偶联的转录/翻译系统进行。以不含终止密码子的 DHFR 基因（DHFR-ns）为模板。加入 tmRNA 和 SmpB 至终浓度 2 μM 以实现标记。加入 KKL-35 或其他化合物至终浓度 10 μM（或不同浓度用于剂量反应）。反应在 37°C 孵育 1–3 小时，用丙酮沉淀，通过 SDS-PAGE 分离并显影。标记效率计算为标记的 DHFR 与总 DHFR 的比值。[1]
细胞实验
使用基于细胞的荧光素酶报告基因实验进行高通量筛选。用化合物处理表达非终止荧光素酶 mRNA（luc-trpAt）的大肠杆菌细胞。如果 trans-translation 被抑制，活性荧光素酶积累并产生发光信号。对于荧光报告基因实验，将表达 mCherry-trpAt 或 mCherry-tag 的菌株培养至 OD₆₀₀ = 0.2，用 IPTG 诱导，并用化合物处理。通过显微镜测量荧光强度，将强度高于 DMSO 对照组平均值 2 个标准差以上的细胞计为阳性。[1]
参考文献
[1]. Small molecule inhibitors of trans-translation have broad-spectrum antibiotic activity. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Jun 18;110(25):10282-7.
其他信息
KKL-35 是通过对 663,000 种化合物进行高通量筛选，并利用基于细胞的转译报告基因检测方法鉴定出来的。它是一种小分子抑制剂，能够阻断转译过程中的标记步骤。转译是细菌生存和毒力所必需的途径，但在动物体内不存在。KKL-35 具有广谱抗菌活性，被认为是一种很有前景的抗生素候选药物，尤其适用于对抗耐药病原体。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C15H9CLFN3O2
分子量
317.70
精确质量
317.036
元素分析
C, 49.73; H, 4.55; Cl, 13.34; N, 26.36; O, 6.02
CAS号
865285-29-6
PubChem CID
4128171
外观&性状
Solid powder
密度
1.5±0.1 g/cm3
折射率
1.639
LogP
4.13
tPSA
68
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
22
分子复杂度/Complexity
385
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(C1C=CC(Cl)=CC=1)NC1OC(C2C=CC(F)=CC=2)=NN=1
InChi Key
IBRCUOMIAFDQTM-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C11H12ClN5O/c1-2-6-17-11(14-15-16-17)13-10(18)8-4-3-5-9(12)7-8/h3-5,7H,2,6H2,1H3,(H,13,14,16,18)
化学名
3-chloro-N-(1-propyl-1H-tetrazol-5-yl)benzamide
别名
KKL-35; KKL 35; KKL35;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 6.25~32 mg/mL (19.67~100.72 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.1476 mL 15.7381 mL 31.4762 mL
5 mM 0.6295 mL 3.1476 mL 6.2952 mL
10 mM 0.3148 mL 1.5738 mL 3.1476 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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