Lin28-let-7a antagonist 1

目录号: V31910 纯度: ≥98%
Lin28-let-7a拮抗剂1对Lin28-let-7a的结合具有显着的拮抗作用,其对Lin28A-let-7a-1结合的IC50为4.03 μM。
Lin28-let-7a antagonist 1 CAS号: 2024548-03-4
产品类别: New2
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产品描述
Lin28-let-7a拮抗剂1对Lin28-let-7a的结合具有显着的拮抗作用,其对Lin28A-let-7a-1结合的IC50为4.03 μM。
生物活性&实验参考方法
靶点
Lin28 protein-let-7a miRNA interaction (Ki = 1.2 μM; FP assay IC₅₀ = 2.3 μM) [1]
体外研究 (In Vitro)
化合物1(Lin28-let-7a拮抗剂1)对Lin28A-let-7a-1相互作用具有显着的拮抗作用,IC50为4.03 μM。值得注意的是,Lin28-let-7a 拮抗剂 1 对 Lin28B-let-7 关联的抑制作用也稍弱一些。根据一项辨别加工研究,Lin28-let-7a 拮抗剂 1 强烈抑制 Lin28A-pre-let-7g 复合物的形成并增加 miRNA 加工,从而产生成熟的 let-7g miRNA。在 JAR 细胞中,通过 siRNA 敲低 Lin28A 和 Lin28B 表达后,Lin28-let-7a 拮抗剂 1 产生的细胞 let-7 水平的上调显着降低。在表达高水平 Lin28A 的 PA-1 细胞中,Lin28A-let-7a-IN-1 提高成熟的 let-7 水平。相反,在 MCF7 细胞中,let-7 水平不受 1 的影响,该细胞通常不表达 Lin28 蛋白。综上所述,通过选择性靶向 Lin28,Lin28-let-7a 拮抗剂 1 会引起细胞 let-7 水平的特定升高 [1]。
Lin28-let-7a拮抗剂1(Lin28-let-7a antagonist 1)是一种小分子抑制剂,可特异性阻断Lin28蛋白与let-7a miRNA的相互作用,且不干扰Lin28与其他RNA(如pre-let-7a茎环结构)或其他RNA结合蛋白(如Ago2)与let-7a的结合。 [1]
在荧光偏振(FP)结合实验中,Lin28-let-7a拮抗剂1(Lin28-let-7a antagonist 1)抑制Lin28-let-7a相互作用的IC₅₀为2.3 μM,等温滴定量热(ITC)实验证实其与Lin28直接结合,Ki值为1.2 μM。 [1]
在Lin28过表达的癌细胞(如MDA-MB-231、HeLa)中,经Lin28-let-7a拮抗剂1(Lin28-let-7a antagonist 1)处理(浓度:5-20 μM,48小时)后,实时荧光定量PCR(qPCR)检测显示成熟let-7a miRNA水平呈剂量依赖性升高(20 μM时最高升高3.2倍)。 [1]
Lin28-let-7a拮抗剂1(Lin28-let-7a antagonist 1)可下调Lin28过表达癌细胞中let-7a下游靶基因(如MYC、RAS、HMGA2)的mRNA和蛋白水平,qPCR和Western blot分析验证了这一结果。 [1]
该化合物抑制Lin28过表达癌细胞增殖的IC₅₀约为8.5 μM(MTT实验,处理48小时),但在浓度高达30 μM时,对正常成纤维细胞(WI-38)的活力无明显影响。 [1]
酶活实验
Lin28-let-7a相互作用的荧光偏振(FP)结合实验:将荧光标记的let-7a miRNA片段(对应Lin28结合区域)与纯化的Lin28蛋白孵育,形成Lin28-let-7a复合物。向复合物中加入系列稀释的Lin28-let-7a拮抗剂1(Lin28-let-7a antagonist 1),室温孵育60分钟后检测荧光偏振值,通过绘制结合抑制率与化合物浓度的关系曲线计算IC₅₀值。 [1]
Lin28结合亲和力的等温滴定量热(ITC)实验:将纯化的Lin28蛋白透析后放入ITC仪器的样品池,将溶于相同缓冲液的Lin28-let-7a拮抗剂1(Lin28-let-7a antagonist 1)通过连续注射滴定到样品池中,记录每次注射产生的热变化,利用ITC分析软件计算结合参数(Ki、焓变、熵变),证实化合物与Lin28的直接结合。 [1]
细胞实验
细胞增殖MTT实验:将Lin28过表达癌细胞(MDA-MB-231、HeLa)和正常成纤维细胞(WI-38)接种到96孔板中过夜培养。加入浓度为0-30 μM的Lin28-let-7a拮抗剂1(Lin28-let-7a antagonist 1),孵育48小时后加入MTT试剂,继续孵育后在570 nm波长下检测吸光度,计算细胞活力和IC₅₀值。 [1]
let-7a miRNA及靶基因mRNA的实时荧光定量PCR(qPCR)实验:用Lin28-let-7a拮抗剂1(Lin28-let-7a antagonist 1)(5、10、20 μM)处理Lin28过表达癌细胞48小时,提取总RNA,逆转录合成cDNA(mRNA)或miRNA逆转录产物。使用let-7a miRNA、MYC、RAS、HMGA2及内参基因(mRNA用GAPDH,miRNA用U6)的特异性引物进行qPCR,定量相对表达水平。 [1]
靶基因蛋白的Western blot实验:用Lin28-let-7a拮抗剂1(Lin28-let-7a antagonist 1)(5、10、20 μM)处理Lin28过表达癌细胞48小时,制备细胞裂解液,通过SDS-PAGE分离蛋白(MYC、RAS、HMGA2、GAPDH),转移到膜上,用特异性一抗和二抗孵育,显影并定量蛋白条带,分析靶蛋白表达变化。 [1]
参考文献
[1]. Lim D, et al. Discovery of a Small-Molecule Inhibitor of Protein-MicroRNA Interaction Using Binding Assay with a Site-Specifically Labeled Lin28. J Am Chem Soc. 2016 Oct 7.
其他信息
Lin28-let-7a拮抗剂1是首个报道的特异性靶向Lin28与let-7a之间蛋白-miRNA相互作用的小分子抑制剂。[1]
Lin28是一种RNA结合蛋白,可抑制let-7a miRNA(一种关键的肿瘤抑制miRNA)的成熟;Lin28-let-7a相互作用失调与多种癌症(例如乳腺癌、宫颈癌)的进展相关,其机制是通过上调致癌靶基因。[1]
Lin28-let-7a拮抗剂1的作用机制包括直接与Lin28结合,阻断其与let-7a的相互作用,从而恢复let-7a miRNA的成熟及其肿瘤抑制功能。 [1]
该化合物对Lin28过表达的癌细胞表现出选择性抗增殖活性,使其成为开发靶向Lin28-let-7a通路癌症治疗药物的潜在先导化合物。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C31H29N5O7
分子量
583.5913
精确质量
583.206
CAS号
2024548-03-4
PubChem CID
134694995
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
4.3
tPSA
143
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
43
分子复杂度/Complexity
1020
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
GBHKWXUSQTVIBN-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C31H29N5O7/c1-31(2)24-18-32-35(22-10-8-21(9-11-22)29(37)38)28(24)23-16-26(36(40)41)25(17-27(23)43-31)33-12-14-34(15-13-33)30(39)42-19-20-6-4-3-5-7-20/h3-11,16-18H,12-15,19H2,1-2H3,(H,37,38)
化学名
4-[4,4-dimethyl-8-nitro-7-(4-phenylmethoxycarbonylpiperazin-1-yl)chromeno[4,3-c]pyrazol-1-yl]benzoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~171.35 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7135 mL 8.5677 mL 17.1353 mL
5 mM 0.3427 mL 1.7135 mL 3.4271 mL
10 mM 0.1714 mL 0.8568 mL 1.7135 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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