m-Carboxycinnamic acid bishydroxamide

别名: N-羟基-3-[3-(羟基氨基)-3-氧代-1-丙烯-1-基]-苯甲酰胺
目录号: V48283 纯度: ≥98%
m-Carboxycinnamic Acid bisHydroxamide 是一种有效的 HDAC 抑制剂(拮抗剂),HDAC1 和 HDAC3 的体外 ID50 分别为 10 nM 和 70 nM。
m-Carboxycinnamic acid bishydroxamide CAS号: 174664-65-4
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
m-羧基肉桂酸双羟酰胺是一种强效的HDAC抑制剂(拮抗剂),其体外对HDAC1和HDAC3的ID50值分别为10 nM和70 nM。m-羧基肉桂酸双羟酰胺还能诱导细胞凋亡并抑制肿瘤生长。
间羧基肉桂酸双羟酰胺(CAS号:174664-65-4,又称CBHA)是一种强效的组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂。它是一种极性杂合化合物,以其HDAC抑制活性而闻名,体外实验中对HDAC1和HDAC3的ID50值分别为10 nM和70 nM。它被用于癌症和其他疾病的表观遗传学研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
Target: Histone Deacetylases (HDACs), specifically HDAC1 (ID50 = 10 nM) and HDAC3 (ID50 = 70 nM). m-Carboxycinnamic acid bishydroxamide inhibits the activity of class I HDACs by chelating the zinc ion in the active site, preventing deacetylation of histone and non-histone proteins. This leads to accumulation of acetylated histones, relaxed chromatin structure, and activation of transcription of tumor suppressor genes and genes involved in cell cycle arrest, differentiation, and apoptosis.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,间羧基肉桂酸双羟酰胺(CBHA)(0.1-10 uM,24-72 小时)在无细胞实验中可抑制组蛋白去乙酰化酶(HDAC)活性,对 HDAC1 的 ID50 为 10 nM,对 HDAC3 的 ID50 为 70 nM。CBHA 可诱导处理细胞中组蛋白 H3 和 H4 的过度乙酰化,进而导致 p21WAF1/CIP1(一种细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂)表达增加。CBHA 可导致 G1 期细胞周期阻滞,并诱导多种癌细胞系(包括白血病、乳腺癌、前列腺癌和结肠癌细胞)凋亡。此外,CBHA 也是多药耐药蛋白 1 (MRP1) 的底物。
体内研究 (In Vivo)
在体内,间羧基肉桂酸双羟酰胺已在动物癌症模型中进行了研究。它能抑制小鼠白血病、乳腺癌和结肠癌异种移植模型中的肿瘤生长。该化合物具有良好的口服生物利用度,并在啮齿动物中显示出良好的药代动力学特性。在治疗剂量下,它耐受性良好,与其他一些组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂相比,不会引起明显的骨髓抑制。更多详细的疗效数据可参见文献(Richon et al., 1998)。
酶活实验
对于无细胞 HDAC 酶活性测定:将 HeLa 细胞核提取物或重组 HDAC1、HDAC3 酶(50-100 ng)与不同浓度的间羧基肉桂酸双羟酰胺(0.01-10 uM)和荧光标记的乙酰化肽底物(例如 Ac-Lys(Ac)-AMC)在 HDAC 测定缓冲液中于 37℃ 孵育 30-60 分钟。加入含有胰蛋白酶的显色剂终止反应,并在 360/460 nm 处测量荧光强度。根据剂量反应曲线计算 ID50 值(HDAC1 为 10 nM,HDAC3 为 70 nM)。
细胞实验
对于基于细胞的检测:将癌细胞系(例如 HeLa、MCF-7、HL-60、HCT-116)接种于 96 孔板中,并用间羧基肉桂酸双羟酰胺(0.1-20 uM,24-72 小时)处理。采用 MTT 或 CellTiter-Glo 法检测细胞活力。采用 Annexin V/PI 流式细胞术评估细胞凋亡。采用碘化丙啶染色和流式细胞术分析细胞周期分布。采用 Western blot 和 qPCR 检测组蛋白乙酰化(Ac-H3、Ac-H4)以及 p21 和其他靶基因的表达。细胞活力的 IC50 值通常在低微摩尔范围内(1-10 uM),具体数值取决于细胞系。
动物实验
在体内动物研究中:将携带异种移植瘤(例如,人白血病HL-60、乳腺癌MCF-7或结肠癌HCT-116)的裸鼠用间羧基肉桂酸双羟酰胺治疗。该化合物以50-200 mg/kg的剂量,每日一次,腹腔注射(IP)或口服(PO)给药,持续14-21天。研究结束时,用游标卡尺测量肿瘤体积并记录肿瘤重量。收集肿瘤组织,进行组蛋白乙酰化、p21表达和凋亡标志物(cleaved caspase-3、PARP)的Western blot分析。监测体重和器官毒性以评估耐受性。该化合物耐受性良好,并在这些模型中显示出显著的肿瘤生长抑制(TGI)。
药代性质 (ADME/PK)
间羧基肉桂酸双羟酰胺 (CBHA) 的药代动力学特性:在啮齿动物中,口服给药(50-100 mg/kg)后,该化合物显示出中等的口服生物利用度(30-50%)。达峰时间 (Tmax) 为 1-2 小时,血浆半衰期为 2-4 小时。它可溶于二甲基亚砜 (DMSO),并可配制成 10% DMSO + 90% 生理盐水或其他溶剂用于体内给药。该化合物主要通过 II 期结合(葡萄糖醛酸化)代谢,也可能通过 I 期氧化代谢。组织分布研究表明,该化合物在肿瘤组织中蓄积,这有助于其发挥疗效。目前文献中尚未发表正式的药代动力学参数(Cmax、AUC、CL)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
毒性概况:间羧基肉桂酸双羟酰胺在治疗剂量(啮齿动物 50-200 mg/kg)下通常耐受性良好。未观察到明显的急性毒性或体重减轻。与其他 HDAC 抑制剂(例如 SAHA/伏立诺他、TSA)相比,其胃肠道毒性和骨髓抑制(血小板减少症、中性粒细胞减少症)的发生率较低。然而,较高剂量可能导致轻度肝酶升高和可逆性血液学效应。尚未有长期毒性和致癌性研究报告。该化合物仅供研究使用,不得用于人体治疗。
参考文献

[1]. A class of hybrid polar inducers of transformed cell differentiation inhibits histone deacetylases. Proc Natl Acad Sci U S A. 1998 Mar 17;95(6):3003-7.

[2]. Hybrid polar histone deacetylase inhibitor induces apoptosis and CD95/CD95 ligand expression in human neuroblastoma. Cancer Res. 1999 Sep 1;59(17):4392-9.

其他信息
羧基肉桂酸双(羟酰胺)是一种混合极性化合物,可诱导多种转化细胞发生终末分化和/或凋亡。它是一种组蛋白去乙酰化酶抑制剂。
m-羧基肉桂酸双羟酰胺 (CBHA) 是一种研究用化合物,尚未获得美国食品药品监督管理局 (FDA) 批准用于临床。它是一种有价值的化学探针,可用于研究组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 在表观遗传调控、癌症生物学和其他疾病中的作用。CBHA 已被广泛用作 HDAC 研究的工具化合物,并作为开发更有效、更具选择性的 HDAC 抑制剂的先导化合物。该化合物已进入针对多种癌症(白血病、实体瘤)的临床前开发阶段,但尚未进入临床试验。它常与其他抗癌药物(例如维甲酸、化疗药物)联合使用,以评估协同效应。此外,CBHA 还用于研究 HDAC 抑制剂耐药机制,并作为 HDAC 抑制剂筛选试验的参考标准。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H10N2O4
分子量
222.1974
精确质量
222.064
CAS号
174664-65-4
PubChem CID
5353484
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
折射率
1.668
LogP
-0.09
tPSA
98.66
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
16
分子复杂度/Complexity
291
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ONC(=O)C1C=CC=C(/C=C/C(NO)=O)C=1
InChi Key
OYKBQNOPCSXWBL-SNAWJCMRSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H10N2O4/c13-9(11-15)5-4-7-2-1-3-8(6-7)10(14)12-16/h1-6,15-16H,(H,11,13)(H,12,14)/b5-4+
化学名
N-hydroxy-3-[(E)-3-(hydroxyamino)-3-oxoprop-1-enyl]benzamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.5005 mL 22.5023 mL 45.0045 mL
5 mM 0.9001 mL 4.5005 mL 9.0009 mL
10 mM 0.4500 mL 2.2502 mL 4.5005 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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