Mal-C6-amine TFA salt

别名: N-(6-氨基己基)马来酰亚胺三氟乙酸酯; 1-(6-氨基己基)-1H-吡咯-2,5-二酮2,2,2-三氟乙酸盐; 1-(6-氨基己基)-1H-吡咯-2,5-二酮 2,2,2-三氟乙酸盐
目录号: V24956 纯度: ≥97%
Mal-C6-胺 (TFA) 是烷基链类的 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)接头,可用于制备 PROTAC 蛋白降解剂。
Mal-C6-amine TFA salt CAS号: 731862-92-3
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Mal-C6-胺(TFA)是一种烷基链类PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)连接剂,可用于制备PROTAC蛋白降解剂。
Mal-C6-胺TFA盐是一种异双功能化学连接剂,属于烷基链类PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)连接剂。它是一种不可裂解的连接剂,专为生物偶联应用而设计,一端带有马来酰亚胺基团,另一端带有伯胺基团。马来酰亚胺基团在pH 6.5至7.5时可与巯基(-SH)特异性反应,形成稳定的硫醚键;而伯胺基团可与羧酸、活化的NHS酯和其他羰基化合物反应。TFA(三氟乙酸)盐形式可增强该化合物的稳定性和溶解度。这种连接子是构建靶向蛋白降解剂(例如PROTAC)的关键化学工具,也用于抗体药物偶联物(ADC)和其他生物偶联物的合成。它仅供研究使用,尚未获准用于人体治疗。
生物活性&实验参考方法
靶点
Mal-C6-amine TFA salt does not have a specific biological target itself; rather, it is a chemical building block. Its "target" is the functional groups present on biomolecules, specifically thiol groups (from cysteine residues in proteins) and primary amine groups (from lysine residues or N-termini). The maleimide group provides a site for selective conjugation to thiol-containing molecules, while the amine group offers a handle for further derivatization with carboxylic acids or activated esters. This dual functionality allows it to act as a bridge, linking two different molecules together. In the context of PROTACs, this linker connects a ligand for an E3 ubiquitin ligase to a ligand for a target protein, enabling the targeted degradation of the protein of interest.
体外研究 (In Vitro)
一种配体与E3泛素连接酶结合,另一种配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。
Mal-C6-胺TFA盐本身在体外不表现出直接的生物学或药理学活性。其活性通过其化学功能和生物偶联反应的效率来衡量。它的特点是在温和条件下(pH 6.5-7.5)能够与巯基反应形成稳定的硫醚键。其纯度通常很高(≥97%),并且在各种溶剂中的溶解度是其用于合成的关键参数。作为PROTAC连接子,其体外活性是通过评估完整PROTAC分子的性能来间接评价的,即通过细胞实验评估其降解靶蛋白的能力。
体内研究 (In Vivo)
在体内,Mal-C6-胺TFA盐不作为治疗药物使用。其体内行为仅在将其整合到完整的生物偶联物(例如PROTAC或ADC)中时才具有意义。在这种情况下,连接子的性质,例如其稳定性、疏水性和长度,会影响最终构建体的药代动力学和药效学。C6烷基链的不可裂解性表明该连接子的设计旨在提高稳定性,确保偶联物在到达靶点之前保持完整。然而,其体内活性并未直接评估;而是研究偶联分子的疗效。
酶活实验
体外“酶/受体结合”研究不适用于Mal-C6-胺TFA盐,因为它并非与酶或受体结合的药物。该连接子的标准表征方法包括化学分析,以确认其结构和纯度。核磁共振(NMR)和高效液相色谱(HPLC)等技术用于验证其结构和纯度(>97%)。通过偶联效率测定来确认其反应活性,在该测定中,连接子与含硫醇和胺的模型化合物反应,并监测目标产物的生成。
细胞实验
由于Mal-C6-胺TFA盐本身缺乏生物活性,因此不单独进行体外细胞实验。然而,当将其整合到PROTAC中时,则可通过细胞实验评估其性能。典型的实验方案是将培养的癌细胞用完整的PROTAC分子处理。关键的检测指标是靶蛋白的表达水平(通过Western blotting检测)以及对细胞活力的影响(通过MTT或CellTiter-Glo等方法评估)。连接子的作用至关重要,因为其长度和组成会影响PROTAC的细胞摄取和疗效。
动物实验
单独使用Mal-C6-胺TFA盐不进行体内动物研究。当用于PROTAC或ADC时,需在动物模型(例如用于肿瘤研究的异种移植小鼠模型)中研究完整的偶联物。用偶联物治疗荷瘤小鼠,终点指标包括肿瘤体积测量、生存分析以及肿瘤组织中靶点结合和降解的药效学评估。连接子的稳定性和性质对偶联物的整体药代动力学特征和治疗效果至关重要。
药代性质 (ADME/PK)
Mal-C6-胺三氟乙酸盐的药代动力学性质尚未作为治疗药物进行表征。然而,其理化性质,例如分子量(310.27 g/mol)、亲脂性以及三氟乙酸盐的存在,对于其作为试剂的操作和应用至关重要。为保持稳定性,该化合物通常以粉末形式在-20°C下保存长达3年。其在二甲基亚砜(DMSO)和其他有机溶剂中的溶解性是其在化学合成中应用的关键性质。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
Mal-C6-胺三氟乙酸盐是一种研究用化学品,不适用于人类治疗用途。该化合物的标准安全数据有限。然而,作为一种化学试剂,应采取适当的实验室安全预防措施进行操作,包括使用个人防护装备。由于此类连接剂不用于活体生物,因此通常不进行毒性研究。
参考文献
[1]. An S, et al. Small-molecule PROTACs: An emerging and promising approach for the development of targeted therapy drugs. EBioMedicine. 2018 Oct;36:553-562
其他信息
Mal-C6-胺三氟乙酸盐是一种仅供研究使用的化学结构单元,属于烷基链PROTAC连接剂。其CAS号为731862-92-3。它也被称为1-(6-氨基己基)-1H-吡咯-2,5-二酮2,2,2-三氟乙酸盐和N-(6-氨基己基)马来酰亚胺三氟乙酸盐。它是靶向蛋白降解和生物偶联领域的重要工具。目前尚未获准用于临床,也没有已确立的治疗适应症。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C12H17F3N2O4
分子量
310.2696
精确质量
310.114
CAS号
731862-92-3
PubChem CID
57383514
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
1.702
tPSA
100.7
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
21
分子复杂度/Complexity
314
定义原子立体中心数目
0
SMILES
FC(C(=O)O[H])(F)F.O=C1C([H])=C([H])C(N1C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])N([H])[H])=O
InChi Key
RBQIUIPYPXTLRY-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H16N2O2.C2HF3O2/c11-7-3-1-2-4-8-12-9(13)5-6-10(12)14;3-2(4,5)1(6)7/h5-6H,1-4,7-8,11H2;(H,6,7)
化学名
1-(6-aminohexyl)pyrrole-2,5-dione;2,2,2-trifluoroacetic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.2230 mL 16.1150 mL 32.2300 mL
5 mM 0.6446 mL 3.2230 mL 6.4460 mL
10 mM 0.3223 mL 1.6115 mL 3.2230 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们