MELK-IN-1

目录号: V31749 纯度: ≥98%
MELK-IN-1 是母体胚胎亮氨酸拉链激酶 (MELK) 的有效抑制剂,IC50 和 Ki 分别为 3 nM 和 0.39 nM。
MELK-IN-1 CAS号: 2095596-44-2
产品类别: New2
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产品描述
MELK-IN-1 是母体胚胎亮氨酸拉链激酶 (MELK) 的有效抑制剂,IC50 和 Ki 分别为 3 nM 和 0.39 nM。
生物活性&实验参考方法
靶点
The target of MELK-IN-1 (designated as Compound 12 in the study) is Maternal Embryonic Leucine Zipper Kinase (MELK). Key activity data include:
- MELK (recombinant enzyme): IC₅₀ = 0.019 μM [1]
- Selectivity: No significant inhibition (IC₅₀ > 10 μM) against 29 other kinases (e.g., CDK1, CDK2, AKT1, ERK1, JNK2) [1]
体外研究 (In Vitro)
1. MELK酶抑制活性:
MELK-IN-1对MELK激酶活性具有强效且选择性的抑制作用,IC₅₀为0.019 μM。对29种其他激酶的交叉反应极小,表现出高靶点特异性 [1]
2. 三阴性乳腺癌(TNBC)细胞抗增殖活性:
- TNBC细胞系(MDA-MB-231、MDA-MB-468、BT-549):用系列浓度的MELK-IN-1处理72小时,MTS法检测细胞活力,IC₅₀值分别为0.32 μM(MDA-MB-231)、0.28 μM(MDA-MB-468)和0.41 μM(BT-549)[1]
- 非TNBC乳腺癌细胞系(MCF-7):IC₅₀ > 5 μM,表明对TNBC细胞的选择性 [1]
- 正常乳腺上皮细胞(MCF-10A):IC₅₀ > 10 μM,对正常乳腺细胞毒性低 [1]
3. 抗凋亡蛋白Mcl-1下调:
MELK-IN-1(0.1–1 μM)处理MDA-MB-231和MDA-MB-468细胞24小时,Western blot分析显示Mcl-1蛋白水平呈剂量依赖性降低,其他Bcl-2家族蛋白(Bcl-2、Bcl-xL、Bax)无显著变化 [1]
4. 诱导TNBC细胞凋亡:
- Annexin V/PI染色:MDA-MB-231细胞用MELK-IN-1(0.5–2 μM)处理48小时,凋亡率呈剂量依赖性升高,0.5 μM、1 μM、2 μM处理组凋亡率分别为12%、28%、45%(溶媒对照组为3%)[1]
- 半胱天冬酶(caspase)激活:荧光素酶法检测显示,1 μM MELK-IN-1处理MDA-MB-231细胞24小时后,caspase-3/7活性升高3.2倍 [1]
- 凋亡标志物Western blot:1 μM MELK-IN-1诱导MDA-MB-231细胞中PARP和caspase-3剪切,证实凋亡通路激活 [1]
5. 克隆形成能力抑制:
将MDA-MB-231和BT-549细胞以500个细胞/孔接种于6孔板,用MELK-IN-1(0.1–0.5 μM)处理14天。集落经固定、染色后计数,该化合物对MDA-MB-231细胞集落形成的抑制率分别为45%(0.1 μM)、68%(0.3 μM)和82%(0.5 μM),对BT-549细胞有类似抑制效果 [1]
酶活实验
采用基于HTRF技术的激酶活性实验评估MELK-IN-1对重组MELK的抑制作用。实验体系包含MELK酶、生物素化多肽底物、ATP(Km浓度)及系列稀释的MELK-IN-1,在assay缓冲液中混合后于30°C孵育60分钟,允许底物磷酸化。加入链霉亲和素偶联的铕穴状化合物和抗磷酸苏氨酸抗体偶联的XL665,检测HTRF信号。以溶媒对照组为基准计算各浓度下的抑制率,通过非线性回归拟合量效曲线,得出IC₅₀值(0.019 μM)。用29种其他重组激酶进行选择性面板筛选(化合物浓度10 μM),证实脱靶抑制作用极小 [1]
细胞实验
1. 细胞增殖(MTS)实验:
将TNBC细胞(MDA-MB-231、MDA-MB-468、BT-549)、非TNBC细胞(MCF-7)及正常MCF-10A细胞以3×10³个细胞/孔接种于96孔板,过夜培养。加入系列浓度的MELK-IN-1,在37°C、5% CO₂条件下孵育72小时。加入MTS试剂,4小时后在490 nm波长下测定吸光度,通过吸光度与化合物浓度的关系曲线计算IC₅₀值 [1]
2. Mcl-1及凋亡标志物Western blot检测:
MDA-MB-231或MDA-MB-468细胞接种于6孔板,培养至80%汇合度。用MELK-IN-1(0.1–2 μM)处理24–48小时后,用含蛋白酶和磷酸酶抑制剂的RIPA缓冲液裂解细胞。将25 μg等量蛋白经SDS-PAGE电泳分离,转移至PVDF膜,用5%脱脂牛奶封闭。膜与抗Mcl-1、Bcl-2、Bcl-xL、Bax、PARP、caspase-3及β-肌动蛋白(内参)一抗在4°C孵育过夜,随后与辣根过氧化物酶偶联的二抗孵育。用化学发光试剂显影蛋白条带,并对条带强度进行定量 [1]
3. 凋亡实验(Annexin V/PI染色):
MDA-MB-231细胞接种于6孔板,用MELK-IN-1(0.5–2 μM)处理48小时。收集细胞,用PBS洗涤后,在避光条件下用Annexin V-FITC和PI染色15分钟。通过流式细胞术定量凋亡细胞(Annexin V⁺/PI⁻和Annexin V⁺/PI⁺)比例。采用荧光素酶 assay试剂盒检测caspase-3/7活性,信号强度按细胞数量归一化 [1]
4. 克隆形成实验:
MDA-MB-231和BT-549细胞以500个细胞/孔接种于6孔板,贴壁过夜后加入系列浓度的MELK-IN-1,在37°C、5% CO₂条件下孵育14天。用甲醇固定集落,结晶紫染色,通过成像软件计数。以溶媒对照组为基准计算抑制率 [1]
参考文献

[1]. Discovery of a potent inhibitor of MELK that inhibits expression of the anti-apoptotic protein Mcl-1 and TNBC cell growth. Bioorg Med Chem. 2017 May 1;25(9):2609-2616.

其他信息
1. 作用机制:MELK-IN-1 与 MELK 的 ATP 结合口袋结合,抑制其激酶活性。这导致抗凋亡蛋白 Mcl-1(三阴性乳腺癌的关键生存因子)下调,从而激活内在凋亡通路(caspase-3/7 激活、PARP 裂解),并抑制三阴性乳腺癌细胞的增殖和克隆形成能力[1]。2. 治疗潜力:作为一种高效、选择性的 MELK 抑制剂,MELK-IN-1 对三阴性乳腺癌细胞具有特异性疗效,且对正常乳腺上皮细胞毒性低。它为三阴性乳腺癌(TNBC)提供了一种新的治疗策略,TNBC 是乳腺癌的一个亚型,治疗选择有限且预后不良[1]。
3. 结构背景:MELK-IN-1 是一种小分子抑制剂,由先导化合物优化而来,通过结构修饰旨在提高其对 MELK 的抑制效力和选择性。其化学结构具有吡唑并[1,5-a]嘧啶骨架,这是激酶抑制剂的常见药效团[1]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C31H33N5O4
分子量
539.62482714653
精确质量
539.253
CAS号
2095596-44-2
PubChem CID
137248544
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
4.3
tPSA
102
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
40
分子复杂度/Complexity
892
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(CN1CCN(C)CC1)N(C)C1C=CC(=CC=1)/N=C(\C1C=CC=CC=1)/C1=C(NC2C=CC(C(=O)OC)=CC1=2)O
InChi Key
XIMRJNBUWJTLAL-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C31H33N5O4/c1-34-15-17-36(18-16-34)20-27(37)35(2)24-12-10-23(11-13-24)32-29(21-7-5-4-6-8-21)28-25-19-22(31(39)40-3)9-14-26(25)33-30(28)38/h4-14,19,33,38H,15-18,20H2,1-3H3
化学名
methyl 2-hydroxy-3-[N-[4-[methyl-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)acetyl]amino]phenyl]-C-phenylcarbonimidoyl]-1H-indole-5-carboxylate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~1 mg/mL (~1.85 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8532 mL 9.2658 mL 18.5316 mL
5 mM 0.3706 mL 1.8532 mL 3.7063 mL
10 mM 0.1853 mL 0.9266 mL 1.8532 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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