| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Human telomeric G-quadruplex (ΔTm = 26.6°C at 1 μM); HSP90 promoter G-quadruplex (HSP90A: ΔTm = 33.1°C, HSP90B: ΔTm = 28.6°C at 1 μM) [1]
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|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
3d对多种癌细胞系表现出强效抗增殖活性:MIA PaCa-2(胰腺癌)IC50 = 10 nM,MCF-7(乳腺癌)IC50 = 70 nM,WI-38(正常成纤维细胞)IC50 = 230 nM。在MIA PaCa-2细胞中,它诱导细胞衰老(3–4 nM处理7天后50–60%细胞衰老),但TRAP-LIG实验证实即使10 μM浓度下也不抑制端粒酶活性。
qPCR分析显示剂量依赖性转录调控:20–80 nM处理24小时后,DNA损伤应答基因(CDKN1A、DDT3、GADD45A/G、PPM1D)显著上调,端粒维持基因(hPOT1、PARP1)下调。 FRET熔解实验证明,1 μM浓度下对人端粒G-四链体(ΔTm = 26.6°C)和HSP90启动子G-四链体(ΔTm = 33.1°C/28.6°C)具有高稳定性,且相比早期类似物具有更优的G-四链体/双链DNA选择性。 |
| 酶活实验 |
FRET熔解实验:使用FAM/TAMRA标记的寡核苷酸(人端粒序列:5′-FAM-d[AGGG(TTAGGG)3]-TAMRA-3′;HSP90启动子序列HSP90A/B)。化合物(终浓度1 μM)在60 mM K+二甲胂酸盐缓冲液(pH 7.4)中从30°C加热至100°C(0.5°C/步)。监测荧光(激发光:450–495 nm;发射光:515–545 nm),三次重复实验计算ΔTm值。
TRAP-LIG端粒酶活性检测:MIA PaCa-2细胞提取物(1 μg蛋白)与TS引物孵育,纯化延伸产物,用ACX引物PCR扩增,PAGE/SYBR green染色分析。≤10 μM 3d未观察到端粒酶抑制。 |
| 细胞实验 |
SRB法检测增殖:细胞(MIA PaCa-2、MCF-7、A549、WI-38)用3d的2倍梯度稀释液处理96小时。540 nm吸光度测定细胞活性,IC50值相对于未处理组计算。
衰老检测:MIA PaCa-2细胞经3d(3.3–6.6 nM)处理7天后固定,β-半乳糖苷酶试剂盒染色,显微镜计数衰老(蓝色)细胞。 qPCR阵列:提取3d处理的MIA PaCa-2细胞(20–160 nM, 24 h)总RNA,反转录后使用通路特异性阵列(端粒维持/DNA损伤应答)分析。数据以内参基因标准化,ΔΔCT法计算表达变化倍数。 |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
3d 是一种二吗啉取代的萘二酰亚胺,通过基于结构的优化设计而成。晶体结构(PDB:3UYH)证实其与平行人端粒四链体的3′ G-四联体结合,吗啉基团通过水介导的氢键维持沟槽相互作用。在胰腺癌细胞中,其效力比四-N-甲基哌嗪类似物(4)高10倍,这可能是由于其阳离子特性降低,从而增强了细胞摄取。
从机制上讲,它通过置换POT1破坏端粒维持,并在不抑制端粒酶的情况下诱导细胞衰老,从而触发不同的DNA损伤反应。未报告体内或ADME数据。 末端带正电荷的四取代萘二酰亚胺(ND)衍生物是人端粒和基因启动子DNA四链体的强效稳定剂,并能抑制人癌细胞在体外和体内的生长。本研究报道了利用基于结构的药物设计增强早期ND化合物的药理学特性。三种与人端粒分子内四链体复合物的晶体结构表明,四个强碱性N-甲基哌嗪基团中的两个可以被碱性较弱的吗啉基团取代,而不会损失四链体沟槽中的分子间相互作用。新化合物保持了对人端粒四链体DNA的高亲和力,但对MIA PaCa-2胰腺癌细胞系的抑制活性提高了10倍,IC50值约为10 nM。该先导化合物可诱导细胞衰老,但在抑制细胞增殖所需的纳摩尔剂量水平下,并不抑制端粒酶活性。对用该先导化合物处理的 MIA PaCa-2 细胞进行基因芯片 qPCR 分析显示,一组特定基因的表达呈现显著的剂量依赖性调节,包括强烈诱导 DNA 损伤反应基因 CDKN1A、DDIT3、GADD45A/G 和 PPM1D 的表达,以及抑制参与端粒维持的基因,例如 hPOT1 和 PARP1 的表达。[1] |
| 分子式 |
C44H66N10O6
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|---|---|
| 分子量 |
831.06
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| 精确质量 |
830.5167
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| 元素分析 |
C, 63.59; H, 8.01; N, 16.85; O, 11.55
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| CAS号 |
1429028-96-5
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| PubChem CID |
135566608
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| 外观&性状 |
Blue to purple solid powder
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| LogP |
-0.4
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| tPSA |
140 Ų
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
14
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| 可旋转键数目(RBC) |
17
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| 重原子数目 |
60
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| 分子复杂度/Complexity |
1810
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
C12=CC(NCCCN3CCN(C)CC3)=C3C4C1=C(C(NCCCN1CCN(C)CC1)=CC=4C(=O)N(CCCN1CCOCC1)C3=O)C(=O)N(CCCN1CCOCC1)C2=O
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| InChi Key |
KOQWCTULEQQTBE-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C44H66N10O6/c1-47-15-19-49(20-16-47)9-3-7-45-35-31-33-38-37-34(42(56)53(43(57)39(35)37)13-5-11-51-23-27-59-28-24-51)32-36(46-8-4-10-50-21-17-48(2)18-22-50)40(38)44(58)54(41(33)55)14-6-12-52-25-29-60-30-26-52/h31-32,45,55H,3-30H2,1-2H3
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| 化学名 |
14-hydroxy-3-[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propylamino]-10-[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propylimino]-6,13-bis(3-morpholin-4-ylpropyl)-6,13-diazatetracyclo[6.6.2.04,16.011,15]hexadeca-1(14),2,4(16),8,11(15)-pentaene-5,7,12-trione
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| 别名 |
MM41; 1429028-96-5; MM-41; compound 3d; 4,9-bis((3-(4-methylpiperazin-1-yl)propyl)amino)-2,7-bis(3-morpholinopropyl)benzo[lmn][3,8]phenanthroline-1,3,6,8(2H,7H)-tetraone; 4,9-Bis{[3-(4-Methylpiperazin-1-Yl)propyl]amino}-2,7-Bis[3-(Morpholin-4-Yl)propyl]benzo[lmn][3,8]phenanthroline-1,3,6,8(2h,7h)-Tetrone; 0DX; CHEMBL2335138; SCHEMBL16048175;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~33.33 mg/mL (~40.11 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.2033 mL | 6.0164 mL | 12.0328 mL | |
| 5 mM | 0.2407 mL | 1.2033 mL | 2.4066 mL | |
| 10 mM | 0.1203 mL | 0.6016 mL | 1.2033 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。