N-(Azido-PEG4)-N-bis(PEG4-NHS ester)

目录号: V26153 纯度: ≥95%
N-(叠氮基-PEG4)-N-双(PEG4-NHS酯)是聚乙二醇(PEG)类别的PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)接头,可用于制备PROTAC蛋白降解剂。
N-(Azido-PEG4)-N-bis(PEG4-NHS ester) CAS号: 2182601-77-8
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
500mg
5g
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
N-(叠氮基-PEG4)-N-双(PEG4-NHS酯)是一种聚乙二醇(PEG)类PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)连接剂,可用于制备PROTAC蛋白降解剂。N-(叠氮基-PEG4)-N-双(PEG4-NHS酯)也是一种点击化学试剂。它含有叠氮基(N3),可与含有炔基的化合物发生CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。 SPAAC(应变促进的炔烃-叠氮环加成反应)也可能发生在带有BCN或DBCO基团的化合物中。
N-(叠氮基-PEG4)-N-双(PEG4-NHS酯)(CAS 2182601-77-8)是一种支链PEG衍生物,含有一个叠氮基和两个N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)酯基。其分子式为C₄₀H₆₈N₆O₂₀,分子量约为953 g/mol。该化合物是一种点击化学试剂,其叠氮基团可与含炔烃的化合物发生CuAAc反应。两个NHS酯基可与伯胺反应形成稳定的酰胺键。该化合物是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于PROTAC的合成。它是一种研究级化学品,仅供实验室使用。为了长期保持化合物的稳定性,应将其储存在-20°C下。
生物活性&实验参考方法
靶点
As a chemical linker, this compound does not bind to biological targets. Its functional "targets" are the chemical groups on molecules to which it conjugates. In PROTAC applications, the linker connects an E3 ubiquitin ligase ligand to a target protein ligand. The azide group enables Click Chemistry reactions (CuAAc or SPAAC) with alkyne-bearing compounds. The two NHS ester groups react specifically with primary amines (e.g., lysine residues in proteins) to form stable amide bonds. The branched architecture allows for the creation of multi-functional PROTACs and bioconjugates. The PEG4 spacers improve aqueous solubility and reduce aggregation of the final conjugates.
体外研究 (In Vitro)
一种配体与E3泛素连接酶结合,另一种配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。作为一种合成的连接子分子,该化合物在基于细胞的实验中不表现出药理活性。通过成功合成和表征包含该连接子的PROTAC构建体,证明了其体外应用价值。研究人员通过评估偶联效率(通过HPLC、LC-MS或NMR)、所得偶联物在细胞培养基中的稳定性以及最终PROTAC构建体在靶细胞系中的生物活性来评价该连接子的性能。对于PROTAC,在用构建体处理细胞后,通过Western blot或ELISA定量分析靶蛋白的降解情况。该化合物可溶于DMSO和其他有机溶剂,便于其在生物偶联流程中的应用。
体内研究 (In Vivo)
该化合物未显示出直接的体内药理活性。其体内相关性是通过在动物模型中使用该连接子合成的PROTAC构建体的性能来证明的。用于体内给药时,PROTAC构建体通常配制在DMSO/PEG300/Tween-80/生理盐水等载体中。连接子在生物基质中的稳定性、其对构建体药代动力学特征的影响以及其维持构建体完整性的能力是临床前研究中评估的关键参数。NHS酯基团水解不稳定,在水性环境中会迅速水解,因此该连接子通常用于体外偶联,而不是作为游离化合物用于体内给药。
酶活实验
由于该化合物是一种化学连接剂,本身不具备与生物大分子结合的亲和力,因此体外酶/受体结合试验不适用于该化合物。质量控制和表征采用标准分析方法进行。纯度通过高效液相色谱法 (HPLC) 进行评估,结构完整性通过核磁共振氢谱 (¹H NMR)、核磁共振碳谱 (¹³C NMR) 和质谱法进行确认。叠氮基和 NHS 酯基通过光谱分析进行验证。对于使用该连接剂的研究人员,可通过薄层色谱法 (TLC)、高效液相色谱法 (HPLC) 或液相色谱-质谱联用法 (LC-MS) 监测 NHS 酯与伯胺的偶联情况。NHS 酯对水分敏感,应在无水条件下操作。
细胞实验
由于该化合物是一种缺乏生物活性的合成连接子,因此不直接对其进行基于细胞的检测。然而,含有该连接子的PROTAC构建体的生物活性已在相关细胞系中进行了评估。典型的实验方案包括用PROTAC构建体处理细胞4-48小时,然后通过Western blot或ELISA检测靶蛋白的降解情况。细胞活力、增殖和凋亡则使用MTT、CCK-8或流式细胞术等标准检测方法进行监测。连接子对构建体的细胞摄取、稳定性和功效的影响可通过构效关系研究进行推断。DMSO储备液的配制和稀释均在细胞培养基中进行。
动物实验
体内动物研究采用包含该连接子的PROTAC构建体,而非单独的连接子。典型方案采用啮齿动物模型(例如,荷瘤异种移植小鼠)。构建体通过静脉注射、腹腔注射或灌胃给药,剂量根据初步药代动力学和耐受性研究确定。疗效评估通过测量疾病进展终点指标,例如肿瘤体积、生物标志物水平或生存期。药效学终点指标包括组织中靶蛋白的降解(通过Western blot或IHC检测)和下游通路调控。连接子在循环中的稳定性通过血浆采样和LC-MS/MS分析进行评估。
药代性质 (ADME/PK)
作为一种化学连接剂,该化合物不具有常规的药代动力学特征。然而,在临床前研究中,已对包含该连接剂的PROTAC构建体的药代动力学特性进行了评估。在啮齿动物给药后,通过血浆浓度-时间数据测定了半衰期、清除率、分布容积和生物利用度等关键参数。PEG间隔基有助于提高水溶性、降低蛋白结合率,并可能延长循环时间。NHS酯基团水解不稳定,会在血浆中迅速水解。使用LC-MS/MS测定完整构建体浓度随时间的变化来评估连接剂在血浆中的稳定性。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
处理该化合物时应遵循标准实验室安全预防措施:使用个人防护装备(手套、护目镜、实验服),并在通风良好的通风橱内操作。NHS酯对水分敏感,应在无水条件下操作。为确保长期稳定性,该化合物应储存在-20°C,并避免受潮。目前尚无遗传毒性、致癌性或生殖毒性数据。该化合物不属于危险药物,但仍应谨慎处理。研究人员在操作前应查阅安全数据表(SDS)。
其他信息
补充信息:该化合物的CAS号为2182601-77-8,分子式为C₄₀H₆₈N₆O₂₀,分子量约为953 g/mol。它是一种支链PEG衍生物,含有一个叠氮基和两个NHS酯基。它是一种点击化学试剂,也是一种基于PEG的PROTAC连接剂。该化合物仅供研究使用,尚未获准用于临床应用,也未获得FDA批准。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C40H68N6O20
分子量
952.996132850647
精确质量
952.448
CAS号
2182601-77-8
PubChem CID
131709294
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
-2.7
tPSA
256
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
23
可旋转键数目(RBC)
49
重原子数目
66
分子复杂度/Complexity
1290
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1CC(=O)N(C1=O)OC(=O)CCOCCOCCOCCOCCN(CCOCCOCCOCCOCCC(=O)ON2C(=O)CCC2=O)C(=O)CCOCCOCCOCCOCCN=[N+]=[N-]
InChi Key
SZQXOKLTRWLWON-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C40H68N6O20/c41-43-42-7-13-55-19-25-61-31-34-64-28-22-58-16-10-44(8-14-56-20-26-62-32-29-59-23-17-53-11-5-39(51)65-45-35(47)1-2-36(45)48)9-15-57-21-27-63-33-30-60-24-18-54-12-6-40(52)66-46-37(49)3-4-38(46)50/h1-34H2
化学名
(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl-[2-[2-[2-[2-[3-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy-3-oxopropoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl]amino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
View More

注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
View More

口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.0493 mL 5.2466 mL 10.4932 mL
5 mM 0.2099 mL 1.0493 mL 2.0986 mL
10 mM 0.1049 mL 0.5247 mL 1.0493 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们